Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1
|
|
| Alphapleolipovirus HHPV1 | |
|---|---|
|
|
|
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Monodnaviria |
| Rike: | Trapavirae |
| Provins: | Saleviricota |
| Klass: | Huolimaviricetes |
| Beställa: | Haloruvirales |
| Familj: | Pleolipoviridae |
| Släkte: | Alfapleolipovirus |
| Arter: |
Alphapleolipovirus HHPV1
|
Haloarcula hispanica pleomorphic virus 1 (HHPV1) är ett dubbelsträngat DNA-virus som infekterar den halofila arkeonen Haloarcula hispanica . Den har ett antal unika funktioner som inte liknar något tidigare beskrivet virus.
Virologi
Virionerna är omslutna och pleomorfa form. Höljet innehåller en mängd olika lipider inklusive kardiolipiner , fosfatidylglyceroler , fosfatidylglycerofosfatmetylestrar och fosfatidylglycerosulfater. Det finns två huvudproteiner i höljet - VP3 (12 kilo Dalton i vikt) och VP4 (60 kiloDalton i vikt).
Virionerna lämnar värden utan lys, vilket tyder på en spirande mekanism.
Genom
Genomet är en enkel molekyl av dubbelsträngat DNA, cirkulär, 8082 baspar i längd med en G+C- halt på 55,8 %. Den har åtta öppna läsramar (ORF). VP3 och VP4 kodas av ORF3 respektive ORF4. [ citat behövs ]
ORF1 är förmodligen ett replikationsinitieringsprotein. ORF3 kodar för ett integrerat membranprotein med en signalsekvens på 50 aminosyror och två transmembranregioner. Innan den C-terminala transmembrandomänen är en spiralformad region. ORF7 innehåller en NTPase-domän men dess funktion är inte klar. [ citat behövs ]
Taxonomi
Undersökning av proteinerna och genomorganisationen för detta virus tyder på att det var relaterat till det enkelsträngade DNA-viruset Halorubrum pleomorphic virus 1, plasmiden pHK2 och en region inom arkeonet Haloferax volcanii . Det verkar troligt att plasmiden pHK2 kan vara ett virus som kan bilda cirkulära plasmider och att regionen inom Haloferax volcanii är en profet . [ citat behövs ]
Likheten mellan dessa dubbelsträngade DNA-element och det enkelsträngade viruset Halorubrum pleomorphic virus 1 är för närvarande unik. Om detta samband kan bekräftas för andra virus tyder det på att det för närvarande använda Baltimore-klassificeringssystemet kan behöva revideras. [ citat behövs ]