Hafniaceae
| Hafniaceae | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Pseudomonadota |
| Klass: | Gammaproteobakterier |
| Beställa: | Enterobacterales |
| Familj: |
Hafniaceae Adeolu et al., 2016 |
| Genera | |
|
|
Hafniaceae är en familj av gramnegativa bakterier . Denna familj är en medlem av ordningen Enterobacterales i klassen Gammaproteobacteria av phylum Pseudomonadota . Släkten i denna familj inkluderar typsläktet Hafnia , tillsammans med Edwardsiella och Obesumbacterium .
Namnet Hafniaceae härrör från det latinska uttrycket Hafnia , som syftar på typsläktet av familjen och suffixet "-aceae", ett slut som används för att beteckna en familj. Tillsammans Hafniaceae till en familj vars nomenklaturtyp är släktet Hafnia .
Biokemiska egenskaper och molekylära signaturer
Medlemmar är katalaspositiva, oxidasnegativa och negativa för lysindekarboxylas. Dessa bakterier kan också växa på MacConkey-media och kan reducera nitrat.
Fyra konserverade signaturindelar (CSI) identifierades för denna familj i proteinernas tvåkomponentsystemsvarsregulator GIrR, glukos-1-fosfatadenylyltransferas , transkriptionell aktivator NhaR och hybridsensorns histidinkinas /responsregulator. Dessa molekylära signaturer identifierades genom genomiska analyser och fungerar som ett pålitligt molekylärt sätt att skilja medlemmar av denna familj från andra familjer inom ordningen Enterobacterales och alla andra bakterier.
Historisk systematik och aktuell taxonomi
Hafniaceae , från och med 2021, innehåller tre giltigt publicerade släkten. Medlemmar av denna familj var ursprungligen medlemmar av familjen Enterobacteriaceae , en stor fylogenetiskt obesläktad grupp av arter med distinkta biokemiska egenskaper och olika ekologiska nischer. Den ursprungliga tilldelningen av arter i familjen Enterobacteriaceae baserades till stor del på 16S rRNA-genomsekvensanalyser, som är känd för att ha låg diskriminerande kraft och vars resultat förändringar beror på vilken algoritm och organisminformation som används. Trots detta uppvisade analyserna fortfarande polyfyletisk förgrening, vilket indikerar närvaron av distinkta undergrupper inom familjen.
År 2016, Adeolu et al. föreslog uppdelningen av Enterobacteriaceae i 7 nya familjer baserat på jämförande genomiska analyser och grenmönstret för olika fylogenetiska träd konstruerade från konserverade genomsekvenser, 16S rRNA-sekvenser och multilokussekvensanalyser. Molekylära markörer, specifikt konserverade signaturindels, specifika för denna familj identifierades också som bevis som stöder uppdelningen oberoende av fylogenetiska träd.
Hafniaceae