HBV RNA-inkapslingssignal epsilon

HBV RNA-inkapslingssignal epsilon
HBV RNA-inkapslingssignal epsilon
	Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av HBV_epsilon-
identifierare
Symbol	HBV_epsilon
Alt. Symboler	HBV
Rfam	RF01047
Övriga uppgifter
RNA -typ	Cis-reg
Domän(er)	Virus
GÅ	GO:0019079
SÅ	SO:0005836
PDB- strukturer	PDBe

HBV RNA-inkapslingssignalen epsilon ( HBV_epsilon ) är ett element som är väsentligt för replikering av HBV -virus.

Det är en RNA-struktur belägen nära 5' -änden av det pregenomiska HBV -RNA:t. Strukturen består av en nedre skaft, en utbuktning, en övre skaft och en tri-loop. Strukturen bestämdes och förfinades genom enzymatisk sondering och NMR-spektroskopi . Stängningen av tri-loopen förutspåddes inte av RNA-strukturförutsägelseprogram utan observerades i NMR-strukturen. De regioner som visat sig vara kritiska för inkapsling av RNA:t i den virala livscykeln är utbuktningen, den övre stammen och tri-loopen som interagerar med den terminala proteindomänen av HBV-viruspolymeraset.

Se även

externa länkar