GelRöd

GelRöd
Namn
	Föredraget IUPAC-namn 5,5'-(6,22-Dioxo-11,14,17-trioxa-7,21-diazaheptakosan-1,27-diyl)bis(3,8-diamino-6-fenylfenantridin-5-ium) dijodid
	Andra namn Färgämne nr 35, ET-27
Identifierare
3D-modell ( JSmol )	Interaktiv bild;
PubChem CID	117700725;
	InChI InChI=1S/C60H70N8O5.2HI/c61-45-21-25-49-51-27-23-47(63)41-55(51)67(59(53(49)39-45)43-15- 5-1-6-16-43)31-11-3-9-19-57(69)65-29-13-33-71-35-37-73-38-36-72-34-14- 30-66-58(70)20-10-4-12-32-68-56-42-48(64)24-28-52(56)50-26-22-46(62)40-54( 50)60(68)44-17-7-2-8-18-44;;/h1-2,5-8,15-18,21-28,39-42,63-64H,3-4, 9-14,19-20,29-38,61-62H2,(H2,65,66,69,70);2*1H Nyckel: JGBUYEVOKHLFID-UHFFFAOYSA-N ;
	LEDER c1ccccc1-c2c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc4[n+]2CCCCCC(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)CCCCC[n+]5c6cc(N)ccc6c7ccc(N)cc7c5-c8cccccc8.[I-].[I-];
Egenskaper
Kemisk formel	C60H72I2N8O5 _ _ _ _ _ _ _ _ _
Molar massa	1239,07 g/mol
Faror
NFPA 704 (branddiamant)	0 0 0
Flampunkt	> 100 °C (212 °F; 373 K)
Säkerhetsdatablad (SDS)	10 000X i vatten, Biotium Inc.
	Om inte annat anges ges data för material i standardtillstånd (vid 25 °C [77 °F], 100 kPa). Infobox referenser

GelRed är en interkalerande nukleinsyrafärgning som används i molekylär genetik för agarosgel-DNA- elektrofores . GelRed består strukturellt av två etidiumsubenheter som är överbryggade av en linjär syresatt spacer.

GelRed är en fluorofor och dess optiska egenskaper är i huvudsak identiska med etidiumbromidens . När den utsätts för ultraviolett ljus fluorescerar den med en orange färg som förstärks kraftigt efter bindning till DNA . Ämnet marknadsförs som ett mindre giftigt och känsligare alternativ till etidiumbromid. GelRed säljs som en lösning i vattenfri DMSO eller ultrarenat vatten . GelRed kan inte passera cellmembran .

Se även

^ ^a ^b ^c US-ansökan 2010323453 , Mao, Fei & Leung, Wai-Yee, "Metoder för att använda färgämnen i samband med nukleinsyrafärgning eller detektion och tillhörande teknologi"
^ GelRed & GelGreen (PDF) , Biotium Inc., 21 augusti 2012 , hämtad 4 december 2012
^ ^a ^b ^c GelRed och GelGreen: Miljösäkra och ultrakänsliga nukleinsyragelfläckar för att ersätta EtBr, Biotium Inc., hämtad 4 december 2012
^ Carson Susan; Miller, Heather B.; Witherow, D. Scott (2012-01-01). "Labbsession 3 - PCR-amplifiering av egfp och slutförande av vektorpreparering" . Molecular Biology Techniques (3:e upplagan). Akademisk press . s. 21–29. doi : 10.1016/B978-0-12-385544-2.00003-X . ISBN 978-0-12-385544-2 . {{ citera bok }} : CS1 underhåll: datum och år ( länk )

Namn

Föredraget IUPAC-namn 5,5'-(6,22-Dioxo-11,14,17-trioxa-7,21-diazaheptakosan-1,27-diyl)bis(3,8-diamino-6-fenylfenantridin-5-ium) dijodid
Andra namn Färgämne nr 35, ET-27
Identifierare
3D-modell ( JSmol )	Interaktiv bild
PubChem CID	117700725
InChI InChI=1S/C60H70N8O5.2HI/c61-45-21-25-49-51-27-23-47(63)41-55(51)67(59(53(49)39-45)43-15- 5-1-6-16-43)31-11-3-9-19-57(69)65-29-13-33-71-35-37-73-38-36-72-34-14- 30-66-58(70)20-10-4-12-32-68-56-42-48(64)24-28-52(56)50-26-22-46(62)40-54( 50)60(68)44-17-7-2-8-18-44;;/h1-2,5-8,15-18,21-28,39-42,63-64H,3-4, 9-14,19-20,29-38,61-62H2,(H2,65,66,69,70);2*1H Nyckel: JGBUYEVOKHLFID-UHFFFAOYSA-N
LEDER c1ccccc1-c2c3cc(N)ccc3c4ccc(N)cc4[n+]2CCCCCC(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)CCCCC[n+]5c6cc(N)ccc6c7ccc(N)cc7c5-c8cccccc8.[I-].[I-]
Egenskaper
Kemisk formel	C60H72I2N8O5 _{_} _ _{_} _ _{_} _ _{_} _ _{_}
Molar massa	1239,07 g/mol
Faror
NFPA 704 (branddiamant)	0 0 0
Flampunkt	> 100 °C (212 °F; 373 K)
Säkerhetsdatablad (SDS)	10 000X i vatten, Biotium Inc.
Om inte annat anges ges data för material i standardtillstånd (vid 25 °C [77 °F], 100 kPa). Infobox referenser