GGDEF-domän
| GGDEF-domänsvarsregulator | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 PleD i komplex med c-diGMP-
| |||||||||
| identifierare | |||||||||
| Symbol | GGDEF | ||||||||
| Pfam | PF00990 | ||||||||
| Pfam klan | CL0276 | ||||||||
| InterPro | IPR000160 | ||||||||
| SCOP2 | 1w25 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| CDD | cd01949 | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är GGDEF-domänen en proteindomän som verkar vara allestädes närvarande i bakterier och är ofta kopplad till en regulatorisk domän, såsom en fosforyleringsmottagare eller syreavkännande domän. Dess funktion är att fungera som ett diguanylatcyklas och syntetisera cykliskt di-GMP, som används som en intracellulär signalmolekyl i en mängd olika bakterier . Enzymatisk aktivitet kan starkt påverkas av de intilliggande domänerna . Processer som regleras av denna domän inkluderar exopolysackaridsyntes , biofilmbildning , motilitet och celldifferentiering .
Strukturella studier av PleD från Caulobacter crescentus visar att denna domän bildar ett femsträngat beta-ark omgivet av helixar , liknande den katalytiska kärnan av adenylatcyklas .