GC låda

Inom molekylärbiologi är en GC-box , även känd som en GSG-box , ett distinkt mönster av nukleotider som finns i promotorregionen av vissa eukaryota gener. GC-boxen är uppströms om TATA-boxen och cirka 110 baser uppströms från transkriptionsinitieringsstället. Den har en konsensussekvens GGGCGG som är positionsberoende och orienteringsoberoende. GC-elementen är bundna av transkriptionsfaktorer och har liknande funktioner som förstärkare. Några kända GC-boxbindande proteiner inkluderar Sp1, Krox/Egr, Wilms tumör, MIGI och CREA.

GC-boxen är vanligtvis bindningsstället för zinkfingerproteiner . En alfa-helix-sektion av proteinet motsvarar ett större spår i DNA:t. Zinkfingrar binder till triplettbasparsekvenser, med rest 21 som binder till det första basparet, rest 18 binder till det andra basparet och rest 15 binder till det tredje basparet. Triplettbasparen kan antingen vara en GGG eller en GCG. Om rest 18 är en histidin kommer den att binda till ett G, och om rest 18 är ett glutamat kommer den att binda till en C. GC-boxbindande zinkfingrar har mellan 2 och 4 fingrar, vilket gör att de interagerar med basparsekvenser som är 6 till 8 baspar långa.