GALNT1

GALNT1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, GALNAC-T1, polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferas 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferas 1 är ett enzym som hos människor kodas av GALNT1 -genen .

enzymfamiljen UDP-N-acetyl-alfa-D- galaktosamin : polypeptid N- acetylgalaktosaminyltransferas (GalNAc-T). GalNAc-Ts initierar O-kopplad glykosylering av mucintyp i Golgi-apparaten genom att katalysera överföringen av GalNAc till serin- och treoninrester på målproteiner . De kännetecknas av en N-terminal transmembrandomän, en stamregion, en lumenal katalytisk domän som innehåller ett GT1-motiv och Gal/GalNAc- transferasmotiv och en C-terminal ricin / lektinliknande domän. GalNAc-Ts har olika, men överlappande, substratspecificiteter och uttrycksmönster. Transkriptvarianter härledda från denna gen som använder alternativa polyA-signaler har beskrivits i litteraturen.

Vidare läsning

•   Paulson JC, Colley KJ (1989). "Glykosyltransferaser. Struktur, lokalisering och kontroll av celltypsspecifik glykosylering" . J. Biol. Chem . 264 (30): 17615–8. doi : 10.1016/S0021-9258(19)84610-0 . PMID 2681181 .
•   Bennett EP, Hassan H, Clausen H (1996). "cDNA-kloning och uttryck av en ny human UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosamin. Polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferas, GalNAc-t3" . J. Biol. Chem . 271 (29): 17006–12. doi : 10.1074/jbc.271.29.17006 . PMID 8663203 .
•   Meurer JA, Naylor JM, Baker CA, et al. (1996). "cDNA-kloning, uttryck och kromosomal lokalisering av en human UDP-GalNAc:polypeptid, N-acetylgalaktosaminyltransferas". J. Biochem . 118 (3): 568–74. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124947 . PMID 8690719 .
•   Meurer JA, Drong RF, Homa FL, et al. (1996). "Organisation av en human UDP-GalNAc:polypeptid, N-acetylgalaktosaminyltransferasgen och en relaterad bearbetad pseudogen" . Glykobiologi . 6 (2): 231–41. doi : 10.1093/glykob/6.2.231 . PMID 8727794 .
•    Takai S, Hinoda Y, Adachi T, et al. (1997). "En human UDP-GalNAc: polypeptid, N-acetylgalaktosaminyltransferas typ 1-gen är belägen vid den kromosomala regionen 18q12.1". Brum. Genet . 99 (3): 293–4. doi : 10.1007/s004390050359 . PMID 9050910 . S2CID 22965327 .
•   Wandall HH, Hassan H, Mirgorodskaya E, et al. (1997). "Substratspecificiteter för tre medlemmar av den humana UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosamin: polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferasfamiljen, GalNAc-T1, -T2 och -T3" . J. Biol. Chem . 272 (38): 23503–14. doi : 10.1074/jbc.272.38.23503 . PMID 9295285 .
•   Müller S, Goletz S, Packer N, et al. (1997). "Lokalisering av O-glykosyleringsställen på glykopeptidfragment från laktationsassocierad MUC1. Alla förmodade ställen inom tandemupprepningen är glykosyleringsmål in vivo" . J. Biol. Chem . 272 (40): 24780–93. doi : 10.1074/jbc.272.40.24780 . PMID 9312074 .
•   Röttger S, White J, Wandall HH, et al. (1998). "Lokalisering av tre humana polypeptid GalNAc-transferaser i HeLa-celler antyder initiering av O-länkad glykosylering i hela Golgi-apparaten". J. Cell Sci . 111 (1): 45–60. doi : 10.1242/jcs.111.1.45 . PMID 9394011 .
•   Bennett EP, Weghuis DO, Merkx G, et al. (1998). "Genomisk organisation och kromosomal lokalisering av tre medlemmar av UDP-N-acetylgalaktosamin: polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferasfamiljen" . Glykobiologi . 8 (6): 547–55. doi : 10.1093/glykob/8.6.547 . PMID 9592121 .
•   Sanger Centre, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1999). "Mot en komplett mänsklig genomsekvens" . Genome Res . 8 (11): 1097–108. doi : 10.1101/gr.8.11.1097 . PMID 9847074 .
•   Tenno M, Saeki A, Kézdy FJ, et al. (2003). "Lektindomänen av UDP-GalNAc:polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferas 1 är involverad i O-glykosylering av en polypeptid med flera acceptorställen" . J. Biol. Chem . 277 (49): 47088–96. doi : 10.1074/jbc.M207369200 . PMID 12364335 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Kinarsky L, Suryanarayanan G, Prakash O, et al. (2004). "Konformationsstudier på MUC1 tandemupprepning av glykopeptider: implikation för den enzymatiska O-glykosyleringen av mucinproteinkärnan" . Glykobiologi . 13 (12): 929–39. doi : 10.1093/glycob/cwg109 . PMID 12925576 .
•   Brokx RD, Revers L, Zhang Q, et al. (2004). "Kärnmagnetisk resonansbaserad dissektion av en glykosyltransferasspecificitet för mucin MUC1 tandemupprepning". Biokemi . 42 (47): 13817–25. doi : 10.1021/bi0353070 . PMID 14636048 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .