Francisella novicida

Francisella novicida
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Bakterie
Provins:	Pseudomonadota
Klass:	Gammaproteobakterier
Beställa:	Thiotrichales
Familj:	Francisellaceae
Släkte:	Francisella
Arter:	F. novicida
Binomialt namn
Francisella novicida (Larson et al. 1955) Olsufiev et al. 1959 (Godkända listor 1980)

Francisella novicida är en bakterie av familjen Francisellaceae , som består av gramnegativa patogena bakterier. Dessa bakterier varierar från små kocker till stavformade och är mest kända för sina intracellulära parasitiska egenskaper. I denna familj har sex arter identifierats; arten F. novicida är dock under intensiv granskning. Även om vissa anser att den bör klassificeras med sin egen artbeteckning, menar andra att den bör omklassificeras som en underart under F. tularensis . Om den skulle klassificeras som en underart, F. novicida ansluta sig till de andra kända underarterna inklusive F. t. tularensis (typ A) och F. t. holarctica (typ B). Biokemiska analyser för att identifiera F. tularensis subtyper och stammar är inte idealiska eftersom resultaten ofta är icke-definitiva och föremål för variation, därför bör dessa analyser endast betraktas som kompletterande tester för identifiering av Francisella arter och underarter. Flera stammar av F. novicida eller F. novicida -liknande bakterier har beskrivits, och dessa stammar kan lösas upp med PCR-baserade metoder.

Även om F. novicida anses vara en sällsynt patogen, är dess nära släkting F. tularensis välkänd för att orsaka tularemi. Till skillnad från F. tularensis har det inte funnits några dokumenterade fall av F. novicida eller F. novicida -liknande stamöverföring till människor genom leddjursbett. Infektionsvägen för majoriteten av mänskliga F. novicida eller F. novicida -liknande fall är okänd, även om infekterat vatten eller is har varit inblandat. Några av de viktigaste symtomen i samband med denna infektion inkluderar lunginflammation, muskelsmärtor och feber, bland många andra. När de rapporteras är fall av F. novicida eller F. novicida -liknande infektioner vanligast hos personer med nedsatt immunförsvar. Även om F. novicida sällan förknippas med mänsklig sjukdom trots det nära genetiska släktskapet med F. tularensis , har fall rapporterats hos människor i USA. Till exempel involverade ett fall av F. novicida en kvinna i Arizona 2009. Under 2011 hittades dessutom tre bekräftade fall av F. novicida i en bostadsanläggning i Louisiana. I det senare fallet var is överföringssättet; hur isen ursprungligen var förorenad med F. novicida är dock fortfarande okänt.

Klassificeringsargument

Överföring av F. novicida till en Francisella tularensis subsp. novicida har rekommenderats, och många mikrobiologer använder redan detta namn. Resultat av DNA-DNA-hybridisering och genomsekvenseringsexperiment indikerar att F. novicida är genetiskt nära F. tularensis . Dessutom överensstämmer de observerade fenotypiska skillnaderna med underartbegreppet. Ur vissa forskares synvinkel är det inte konsekvent att ha en art F. tularensis med tre underarter som stöds av DNA-DNA-hybridiseringsdata, utan särskiljs av fenotypiska egenskaper och anses därför vara en separat art. DNA-DNA-släktskapet var större än 85 %. Människo- eller djurinfektioner med F. t. novicida är mycket sällsynta och få publikationer beskriver det, delvis för att det sällan isoleras. Detta indikerar att de flesta laboratorier inte kan särskilja de två underarterna baserat på fenotyp eller metaboliska krav. För medicinskt viktiga organismer som Francisella finns tydliga riktlinjer för differentiering av underarter. Enligt EU:s riktlinjer 2000/54/EC, som har antagits i 27 europeiska länder, har F. t. tularensis [ F. tularensis (typ A)] klassificeras som en BSL 3-patogen, medan F.t. holarctica [ F. tularensis (typ B)] klassificeras som en BSL 2-patogen. Elva metabola reaktioner har visat sig skilja sig åt i F. novicida och F. tularensis . Många forskare hävdar att detta inte är tillräckligt bland de 98 egenskaperna för att motsäga F. novicida som en underart. Det är vanligt att bakteriearter är sammansatta av individer som inte är identiska i fenotypiska egenskaper. Till exempel sträcker sig storleken på Escherichia coli -genomet från 4,6 till 5,7 Mb. Detta innebär att stammarna av en enskild art kan skilja sig åt i 20-25% av deras genom utan att påverka deras taxonomiska status. Därför tror många att det behövs mer metabolisk mångfald för att skilja de två som separata arter. Även om allt detta stöder F. novicida att klassificeras som en underart, tror många fortfarande att det finns tillräckligt med bevis för att skapa en separat art.

När F. novicida och F. tularensis odlas verkar de vara morfologiskt mycket lika. De är båda gramnegativa baciller. Många tester har gjorts för att försöka skilja på om F. novicida och F. tularensis ska betraktas som separata arter. Ett av dessa test involverade tillväxt på cystein-glukos-blodagar (CGBA). för F. tularensis att visa sig på CGBA, medan det bara tog 24 timmar för F. novicida att visa sig. F. novicida växer mycket snabbare på CGBA än F. tularensis . En annan skillnad mellan de två är att virulensen hos F. novicida var lägre. F. tularensis var mycket virulent i möss och hålor (marsvin) som användes i studier. Det tog bara en till 10 celler av F. tularensis för att döda djuret av någon av arterna, även om F. novicida tog 10 till 100 celler i hålor och upp till 1 000 celler i möss. De immunologiska skillnaderna är dock de starkaste bevisen som används för att stödja tanken att F. novicida och F. tularensis är separata arter. Icke-levande vacciner gav inget skydd mot den heterologa organismen. Emellertid gav dessa icke-levande vacciner skydd mot den homologa organismen. De levande vaccinerna gav skydd och korsskydd. också. Inget skydd påvisades mot F. tularensis vid användning av ett F. novicida- vaccin i något experiment. Därför verkar det finnas en fundamental skillnad i den antigena sammansättningen av de två organismerna, vilket också påvisades genom korsabsorption i passivt kutan anafylaxitest (PCA). Förmågan hos det givna antigenet att avlägsna all reaktivitet från dess homologa antiserum samtidigt som det lämnar det heterologa antiserumet intakt indikerar avsaknaden av antigenidentitet. För många forskare är detta tillräckligt med bevis för att betrakta F. novicida och F. tularensis som separata arter. Mycket debatt förekommer fortfarande om hur man klassificerar de två organismerna, och det är viktigt för forskare att etablera ett artbegrepp för denna organism på grund av dess medicinska relevans.