Forskningsinstitut för genetisk information
The Genetic Information Research Institute ( GIRI ) är en ideell institution som grundades 1994 av Jerzy Jurka . Institutets uppdrag "är att förstå biologiska processer som förändrar den genetiska sammansättningen av olika organismer, som en grund för potentiell genterapi och genomteknik." Institutet är specialiserat på att använda datorverktyg för analys av DNA- och proteinsekvensinformation . GIRI utvecklar och underhåller Repbase Update, en databas med prototypiska sekvenser som representerar repetitivt DNA från olika eukaryota arter, och Repbase Reports, en elektronisk tidskrift etablerad 2001. Repetitivt DNA härrör i första hand från transposerbara element (TEs), som inkluderar DNA-transposoner som tillhör ca. 20 superfamiljer och retrotransposoner som också kan underklassificeras i underfamiljer. Majoriteten av kända superfamiljer av DNA-transposoner upptäcktes eller medupptäcktes vid GIRI, inklusive Helitron , Academ, Dada, Ginger, Kolobok, Novosib, Sola, Transib, Zator, PIF/Harbinger och Polinton/Maverick . Ett gammalt element från Transib -superfamiljen identifierades som den evolutionära föregångaren till den rekombinationsaktiverande genen . GIRI har varit värd för tre internationella konferenser som ägnas åt den genomiska effekten av eukaryota transposerbara element.
externa länkar
- Institutets officiella webbplats
- Publikationer
- Screening av DNA eller proteinsekvenser mot Repbase
- Automatiserad klassificering av icke-LTR-retrotransposoner
- Way-Back Machine Archive från www.girinst.org