I augusti 2009 undertecknade Kanadas premiärminister Stephen Harper och Panamas president Ricardo Martinelli ett bilateralt frihandelsavtal känt som Kanada–Panamas frihandelsavtal . Det ratificerades formellt av Kanadas parlament tre år senare och trädde i kraft den 1 april 2013. Under 2010, 2011 och 2012 beräknades den totala årliga handeln mellan de två länderna vara mellan 200 M$ och 250 M$.
2008 slöt Kanada och Panama ett flygtransportavtal. Detta avtal införde ett nytt, modernt ramverk för reguljärflyg mellan Kanada och Panama. Detta avtal är ansvarigt för att öka turismen sedan 2008, mellan Kanada och Panama.
