Drosocin

Drosocin
Drosocin.png
Identifiers
Symbol Drosocin, Dro eller Drc
Pfam DÄMPA
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Drosocin är en 19-rester lång antimikrobiell peptid (AMP) från flugor som först isolerades i fruktflugan Drosophila melanogaster och senare visades vara konserverad genom hela släktet Drosophila . Drosocin regleras av NF-KB Imd-signalvägen i flugan.

Drosocin - genen kodar för två peptider: dess namne Drosocin-peptid och en andra peptid som heter Buletin.

Struktur och funktion

Drosocin är främst aktivt mot gramnegativa bakterier . Peptiden är prolinrik med prolin- argininupprepningar , samt en kritisk treoninrest . Detta treonin är O - glykosylerat , vilket krävs för antimikrobiell aktivitet. Denna O -glykosylering kan utföras antingen av mono- eller disackarider, som har olika aktivitetsspektra. Liksom de antimikrobiella peptiderna pyrrhocoricin och abaecin, binder drosocin till bakteriellt DnaK, vilket hämmar cellmaskineri och replikation. Verkan av dessa drosocinliknande peptider förstärks av närvaron av porbildande peptider, vilket underlättar inträdet av drosocinliknande peptider i bakteriecellen. Prolinrika peptider som drosocin kan också binda till mikroberribosomer, vilket förhindrar proteintranslation . I frånvaro av porbildande peptider tas det relaterade AMP-pyrrhocoricinet in i bakterierna genom inverkan av upptagspermeaser. I Drosophila melanogaster är Drosocin - genen speciellt viktig för flugförsvaret mot infektion av Enterobacter cloacae -bakterier, vilket stöder tidigare in vitro- arbete som visar att Drosocin är aktivt mot E. cloacae .

Drosocin -genen från Drosophila neotestacea kodar unikt för tandemupprepningar av mogna Drosocin- peptider mellan klyvningsställen. Som ett resultat hackas ett enda protein upp till flera Drosocin-peptider. Denna tandemupprepningsstruktur finns också i honungsbiet AMP-apidaecin och antas vara en evolutionär mekanism för att öka hastigheten på immunsvaret och AMP-produktionen.

Molekylär struktur

Den fetstilta treoninresten fungerar som en plats för O-glykosylering, som också finns i AMP:erna abaecin och pyrrhocoricin . De understrukna PRP-motiven är nyckeln till bindningen av sådana peptider till bakteriers DnaK-proteiner.

D. melanogaster drosocin: GK PRP YS PRP T SH PRP IRV

Vidare läsning