dinQ-agrB toxin-antitoxinsystem

DinQ -agrB typ I -toxin-antitoxin (TA)-systemet identifierades initialt i Escherichia coli . Detta typ I TA-system induceras av det bakteriella DNA-skada- responssystemet känt som SOS-responssystemet .

dinQ

dinQ , DNA -d amage- i ducerbart protein Q producerar två stora transkript , endast ett, dock +44, är aktivt översatt . Translation initieras med det ovanliga GUG- startkodonet och resulterar i en peptid på 27 aminosyror . Plasmidbaserat uttryck av C-terminal trippel FLAG-märkt dinQ lokaliserad DinQ i det inre membranet av E. coli . Överuttryck av dinQ ledde till minskad överlevnad, förlust av transmembran elektrisk polaritet och minskade intracellulära ATP- koncentrationer.

agrA och agrB

agrA och agrB är två små RNA , 84 ribonukleotider långa, namngivna på grund av sin position i E. coli- genomet ( a rsR- g eller r egion gen A och B ). 31 ribonukleotider vid 5'-änden av agrA och agrB visar partiell sekvenskomplementaritet inom det primära transkriptet av dinQ , 25 för agrA och 30 för agrB är identiska. Endast deletion av agrB -genen ledde till en ökning av känsligheten för DNA-skadande UV-ljus , agrB - mutanten växte också långsammare än vildtyp E. coli och misslyckades med att dekompaktera dess kromosomala DNA efter en kort icke-dödlig exponering för DNA- skadlig UV.

agrB- hämning av dinQ- översättning

agrB fungerar genom att binda till det translationellt aktiva dinQ- transkriptet, +44, och stabiliserar på så sätt den intramolekylära sekvestreringen av Shine-Dalgarno translationsinitieringssekvensen. Dessutom agrB preferentiellt den endoribonukleolytiska klyvningen av +44 dinQ -transkriptet av RNas III i motsats till det primära +1-transkriptet.