Dependoparvovirus
|
|
| Dependoparvovirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Monodnaviria |
| Rike: | Shotokuvirae |
| Provins: | Cossaviricota |
| Klass: | Quintoviricetes |
| Beställa: | Piccovirales |
| Familj: | Parvoviridae |
| Underfamilj: | Parvovirinae |
| Släkte: | Dependoparvovirus |
| Art | |
|
Se text |
|
Dependoparvovirus (tidigare Dependovirus eller Adeno - associerad virusgrupp ) är ett släkte i underfamiljen Parvovirinae av virusfamiljen Parvoviridae ; de är grupp II-virus enligt Baltimore-klassificeringen . Vissa dependoparvovirus är också kända som adenoassocierade virus eftersom de inte kan replikera produktivt i sin värdcell utan att cellen samtidigt är infekterad av ett hjälpvirus som ett adenovirus , ett herpesvirus eller ett vacciniavirus .
Arter
Det finns elva erkända arter:
- Adeno-associerat dependoparvovirus A
- Adeno-associerat dependoparvovirus B
- Anseriform dependoparvovirus 1
- Aviärt dependoparvovirus 1
- Köttätare dependoparvovirus 1
- Chiropteran dependoparvovirus 1
- Pinniped dependoparvovirus 1
- Gnagare dependoparvovirus 1
- Gnagare dependoparvovirus 2
- Squamate dependoparvovirus 1
- Squamate dependoparvovirus 2
Virologi
Dependoparvovirus har en ikosaedrisk form, mått 22 nm består av 60 kilformade proteiner trianguleringsnummer = 1). Tre proteiner (VP1, VP2 och VP3) finns i varje kapsomer. Varje kapsid är gjord av 5 VP1-, 5 VP2- och 50 VP3-proteiner. Kapsiden har inget kuvert.
Genomet är en enkel molekyl av enkelsträngat DNA med en längd på 4,7 kilobaser. Den har bara två öppna läsramar . Den 3' öppna läsramen är det strukturella kapsidproteinet, cap, som kan splittas för att bilda två RNA, en för virionprotein 1 (VP1) och den andra fortsätter att så småningom göra VP2 och VP3. Den andra genen, rep, kan skarvas i fyra olika, icke-strukturella, regulatoriska proteiner som alla hjälper till med replikeringen av genomet. Dessa proteiner heter Rep 78, Rep68, Rep 52 och Rep 40 baserat på deras molekylvikt.
På grund av inverterade terminala upprepningar (ITR) i varje ände av genomet, bildas en T-formad sekundär struktur . De komplementära områdena lämnar en 3'- hydroxylgrupp enkelsträngad för att replikationen ska börja. Denna 3'-hydroxylgrupp används som en primer för den ledande strängsyntesen . Både positiva och negativa sinnessträngar av DNA skapas. Dubbelsträngade mellanprodukter bildas under hela replikationen; detta betyder att de två delarna, positiv och negativ mening, kommer att matchas.
Värdsortiment
Dessa virus kan replikeras inom alla ryggradsdjur. De begränsas endast av viruset de måste infektera med, även känt som hjälparviruset. Dessa hjälpvirus är nödvändiga för replikeringen av ett dependoparvovirus. Ett vanligt hjälpvirus hos människor är adenoviruset . [ citat behövs ]
Genterapi
Dependoparvovirus är inte tillräckligt infektiöst för att utlösa ett immunsvar ; detta gör det till ett bra virus att använda som ett genterapiverktyg. Genterapi är en möjlig behandling för en mängd olika störningar och sjukdomar som är genetiskt ursprung. Virala vektorer utvecklas för närvarande för att transportera gener in i mänskliga celler. Eftersom detta virus inte stimulerar ett immunsvar kan det användas flera gånger effektivt utan att neutraliseras före infektion [ citat behövs ] . En annan anledning till att dessa virus är pålitliga vektorer är den kända insättningspunkten för genomet. Detta virus sätter alltid in sitt innehåll på samma plats på kromosom 19. [ citat behövs ] Denna förutsägbarhet kan skära ner på chanserna att infogas i ett viktigt område som kan störa normal genfunktion eller öka risken för att utveckla cancer.
Vid denna tidpunkt är en utmaning att använda detta virus som ett terapiverktyg det faktum att genomet är ganska litet. Med mindre än 5 kb i genomet är mängden genetiskt material som kan passa in i kapsiden begränsad. Arbete pågår för närvarande för att öka mängden information som denna vektor kan leverera. Detta kan åstadkommas av de ITR som finns vid både 5'- och 3'-änden av genomet. Eftersom ITR:erna har samma sekvens kommer de att lämna komplementära strängar exponerade om de tas bort. De komplementära strängarna kan genomgå rekombination och sammanfoga två 5 kb insatta fragment.
externa länkar
| Myndighetskontroll : Nationella bibliotek |
|---|
