DDX6

DDX6
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, HLR2, P54, RCK, DEAD-box helicase 6, IDDILF, Rck/p54
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Troligt ATP-beroende RNA-helikas DDX6 är ett enzym som hos människor kodas av DDX6 - genen .

DEAD boxproteiner , kännetecknade av det konserverade motivet Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), är förmodade RNA-helikaser. De är inblandade i ett antal cellulära processer som involverar förändring av RNAs sekundära struktur, såsom translationsinitiering, nukleär och mitokondriell splitsning och ribosom- och spliceosomsammansättning . Baserat på deras distributionsmönster, tros vissa medlemmar av denna familj vara involverade i embryogenes , spermatogenes och cellulär tillväxt och delning. Denna gen kodar för ett DEAD box-protein. Det kan bidra till cellproliferation och karcinogenes .

Vidare läsning

Akao Y, Seto M, Yamamoto K, et al. (1992). "RCK-genen associerad med t(11;14)-translokation är skild från MLL/ALL-1-genen med t(4;11)- och t(11;19)-translokationer". Cancer Res . 52 (21): 6083–7. PMID 1394235 .
Akao Y, Marukawa O, Morikawa H, et al. (1995). "rck/p54-kandidatproto-onkogenprodukten är ett 54-kilodalton DEAD-boxprotein som uttrycks differentiellt i mänskliga och musvävnader". Cancer Res . 55 (15): 3444–9. PMID 7614484 .
Zhang WJ, Wu JY (1996). "Funktionella egenskaper hos p54, ett nytt SR-protein aktivt i konstitutiv och alternativ splitsning" . Mol. Cell. Biol . 16 (10): 5400–8. doi : 10.1128/MCB.16.10.5400 . PMC 231539 . PMID 8816452 .
Akiyama K, Akao Y, Yokoyama M, et al. (1999). "Expression av två döda boxgener (DDX1 och DDX6) är oberoende av MYCN i humana neuroblastomcellinjer" . Biochem. Mol. Biol. Int . 47 (4): 563–8. doi : 10.1080/15216549900201603 . PMID 10319407 . S2CID 45609314 .
Nakagawa Y, Morikawa H, Hirata I, et al. (1999). "Överuttryck av rck/p54, ett DEAD box-protein, i humana kolorektala tumörer" . Br. J. Cancer . 80 (5–6): 914–7. doi : 10.1038/sj.bjc.6690441 . PMC 2362290 . PMID 10360675 .
Smillie DA, Sommerville J (2002). "RNA helicase p54 (DDX6) är ett skyttelprotein som är involverat i nukleär sammansättning av lagrade mRNP-partiklar". J. Cell Sci . 115 (Pt 2): 395–407. doi : 10.1242/jcs.115.2.395 . PMID 11839790 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Miyaji K, Nakagawa Y, Matsumoto K, et al. (2003). "Överuttryck av ett DEAD box/RNA-helikasprotein, rck/p54, i humana hepatocyter från patienter med hepatit C-virusrelaterad kronisk hepatit och dess implikation i hepatocellulär karcinogenes". J. Viral Hepat . 10 (4): 241–8. doi : 10.1046/j.1365-2893.2003.00447.x . PMID 12823589 . S2CID 36830183 .
Matsui T, Hogetsu K, Akao Y, et al. (2004). "Kristallisation och röntgenanalys av den N-terminala kärndomänen av ett tumörassocierat humant DEAD-box RNA-helikas, rck/p54". Acta Crystallogr. D . 60 (Pt 1): 156–9. doi : 10.1107/S09074444903024223 . PMID 14684915 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNAs" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Fenger-Grøn M, Fillman C, Norrild B, Lykke-Andersen J (2006). "Flera bearbetande kroppsfaktorer och det ARE-bindande proteinet TTP aktiverar mRNA-decapping" . Mol. Cell . 20 (6): 905–15. doi : 10.1016/j.molcel.2005.10.031 . PMID 16364915 .
Matsui T, Hogetsu K, Usukura J, et al. (2006). "Strukturell insikt av humant DEAD-box-protein rck/p54 i dess substratigenkänning med konformationsförändringar" . Gener Celler . 11 (4): 439–52. doi : 10.1111/j.1365-2443.2006.00951.x . PMID 16611246 . S2CID 29643976 .
Wichroski MJ, Robb GB, Rana TM (2006). "Human Retroviral Host Restriction Factors APOBEC3G och APOBEC3F lokaliseras till mRNA-bearbetningskroppar" . PLOS Pathog . 2 (5): e41. doi : 10.1371/journal.ppat.0020041 . PMC 1458959 . PMID 16699599 .
Chu CY, Rana TM (2006). "Översättningsrepression i mänskliga celler genom mikroRNA-inducerad gentystnad kräver RCK/p54" . PLOS Biol . 4 (7): e210. doi : 10.1371/journal.pbio.0040210 . PMC 1475773 . PMID 16756390 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Nonhoff U, Ralser M, Welzel F, et al. (2007). "Ataxin-2 interagerar med DEAD/H-Box RNA Helicase DDX6 och interfererar med P-kroppar och stressgranuler" . Mol. Biol. Cell . 18 (4): 1385–96. doi : 10.1091/mbc.E06-12-1120 . PMC 1838996 . PMID 17392519 .