DDX1

DDX1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, DBP-RB, UKVH5d, DEAD/H-box helicase 1, DEAD-box helicase 1
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

ATP-beroende RNA-helikas DDX1 är ett enzym som hos människor kodas av DDX1 -genen .

Fungera

DEAD boxproteiner, kännetecknade av det konserverade motivet Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), är förmodade RNA-helikaser. De är inblandade i ett antal cellulära processer som involverar förändring av RNAs sekundära struktur, såsom translationsinitiering, nukleär och mitokondriell splitsning och ribosom- och spliceosomsammansättning. Baserat på deras distributionsmönster, tros vissa medlemmar av denna familj vara involverade i embryogenes, spermatogenes och cellulär tillväxt och delning. Denna gen kodar för ett DEAD boxprotein med okänd funktion. Den visar höga transkriptionsnivåer i 2 retinoblastomcellinjer och i vävnader av neuroektodermalt ursprung.

Interaktioner

DDX1 har visats interagera med HNRPK . DDX1 har också preliminärt visats interagera med hCLE/C14orf166/RTRAF och HSPC117 i ett cap-bindande komplex som aktiverar mRNA-translation.

Vidare läsning

Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). "Roller av HIV-1 hjälpproteiner i viral patogenes och värd-patogen interaktioner" . Cellforskning . 15 (11–12): 923–34. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
Godbout R, Squire J (augusti 1993). "Amplifiering av en DEAD box-proteingen i retinoblastomcellinjer" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 90 (16): 7578–82. Bibcode : 1993PNAS...90.7578G . doi : 10.1073/pnas.90.16.7578 . PMC 47185 . PMID 7689221 .
Kitajima Y, Yatsuki H, Zhang R, Matsuhashi S, Hori K (mars 1994). "En ny mänsklig homolog av en dead-box RNA-helikasfamilj". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 199 (2): 748–54. doi : 10.1006/bbrc.1994.1292 . PMID 8135819 .
Akiyama K, Akao Y, Yokoyama M, Nakagawa Y, Noguchi T, Yagi K, Nishi Y (april 1999). "Expression av två döda boxgener (DDX1 och DDX6) är oberoende av MYCN i humana neuroblastomcellinjer" . Biochemistry and Molecular Biology International . 47 (4): 563–8. doi : 10.1080/15216549900201603 . PMID 10319407 . S2CID 45609314 .
Golembowski S, Gellrich S, von Zimmermann M, Rutz S, Lippert S, Audring H, Lorenz P, Sterry W, Jahn S (april 2000). "Klonal evolution i ett primärt kutant follikelcentrum B-cellslymfom avslöjat genom enkelcellsanalys i sekventiella biopsier". Immunobiologi . 201 (5): 631–44. doi : 10.1016/s0171-2985(00)80080-7 . PMID 10834319 .
Bléoo S, Sun X, Hendzel MJ, Rowe JM, Packer M, Godbout R (oktober 2001). "Association av humant DEAD box-protein DDX1 med en klyvningsstimuleringsfaktor involverad i 3'-ändsbehandling av pre-MRNA" . Cellens molekylärbiologi . 12 (10): 3046–59. doi : 10.1091/mbc.12.10.3046 . PMC 60154 . PMID 11598190 .
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (januari 2002). "Riktad proteomisk analys av den mänskliga nukleolen" . Aktuell biologi . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Chen HC, Lin WC, Tsay YG, Lee SC, Chang CJ (oktober 2002). "Ett RNA-helikas, DDX1, som interagerar med poly(A) RNA och heterogent nukleärt ribonukleoprotein K" ( PDF) . Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40403–9. doi : 10.1074/jbc.M206981200 . PMID 12183465 . S2CID 25252628 .
Fang J, Kubota S, Yang B, Zhou N, Zhang H, Godbout R, Pomerantz RJ (december 2004). "Ett DEAD box-protein underlättar HIV-1-replikation som en cellulär kofaktor för Rev" . Virologi . 330 (2): 471–80. doi : 10.1016/j.virol.2004.09.039 . PMID 15567440 .
Krishnan V, Zeichner SL (december 2004). "Förändringar i uttrycket av DEAD-box och andra RNA-bindande proteiner under HIV-1-replikation" . Retrovirologi . 1 : 42. doi : 10.1186/1742-4690-1-42 . PMC 543576 . PMID 15588285 .
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (januari 2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
Fang J, Acheampong E, Dave R, Wang F, Mukhtar M, Pomerantz RJ (juni 2005). "RNA-helikaset DDX1 är involverat i begränsad HIV-1 Rev-funktion i mänskliga astrocyter" . Virologi . 336 (2): 299–307. doi : 10.1016/j.virol.2005.03.017 . PMID 15892970 .
Kaneko S, Ohira M, Nakamura Y, Isogai E, Nakagawara A, Kaneko M (mars 2007). "Släktskap mellan DDX1- och NAG-genamplifiering/överuttryck till prognosen för patienter med MYCN-förstärkt neuroblastom". Journal of Cancer Research and Clinical Oncology . 133 (3): 185–92. doi : 10.1007/s00432-006-0156-y . PMID 17028906 . S2CID 9295969 .
Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (april 2007). "Proteomikanalys av interaktomen av N-myc nedströms reglerad gen 1 och dess interaktioner med androgensvarsprogrammet i prostatacancerceller" . Molekylär och cellulär proteomik . 6 (4): 575–88. doi : 10.1074/mcp.M600249-MCP200 . PMID 17220478 .