CRABP2

CRABP2
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CRABP-II, RBP6, cellulärt retinsyrabindande protein 2
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Cellulärt retinsyrabindande protein 2 är ett cytoplasmatiskt bindande protein som hos människor kodas av CRABP2 -genen .

CRABP2 är strukturellt lik CRABP1 , men CRABP2 har en lägre affinitet för retinsyra ( RA). CRABP2 är associerat med celler som producerar stora mängder retinsyra och kan spela en roll för att mediera effekterna av retinsyra i cellen.

Fungera

Ett antal specifika bärarproteiner för medlemmar av vitamin A-familjen har upptäckts. Retinsyra är en aktiv metabolit av vitamin A (retinol). Cellulära retinoinsyrabindande proteiner (CRABP) är lågmolekylära proteiner vars exakta funktion förblir i stort sett okänd.

Inducerbarheten av CRABP2-genen antyder att denna isoform är viktig i retinsyramedierad reglering av mänsklig hudtillväxt, differentiering och utveckling. CRABP2 är involverat i metabolismen och transporten av retinsyra från cytosolen till RAR (retinsyrareceptorer) som finns i kärnan. CRABP2 är specifikt samuttryckt med RAR-β och cellulära retinolbindande protein 1-gener i vissa vävnader. Det har postulerats att CRABP2-genen är transkriptionellt reglerad av ett nyligen syntetiserat regulatoriskt protein.

Vävnadsfördelning

Vävnadsfördelning av CRABP2-genen har i första hand studerats med hjälp av musmodeller. Under embryonal utveckling är CRABP2 närvarande i vävnader i hela kroppen i ett mer diffust mönster än CRABP1. CRABP1 är mer isolerad till specifika regioner, även om den förekommer i högre koncentrationer. CRABP1 och 2 överlappar ofta i vävnader.

CRABP2-genuttryck är rikligt i bålen och bakhjärnan (och i mindre utsträckning i framhjärnan), men finns i andra delar av kroppen. Strukturer som lemmar, bakhjärna och kraniala nervceller har visat sig vara överdrivet känsliga för höga nivåer av retinsyra. Rhombomersegmentering i bakhjärnan och utvecklingen av kranialganglier V, VII, VIII, IX och X verkar också vara delvis beroende av CRABP2-uttryck. CRABP2 finns rikligt i den dorsala delen av lemmen under utvecklingen.

CRABP2-gener uttrycks också i strukturer som är mindre känsliga för retinoidnivåer i hela kroppen under embryonal utveckling. Dessa strukturer inkluderar svalgpåsar, framtarm, mellantarm, mandibular och frontal mesenkym , utvecklande muskler, interdigitalt mesenkym, det urogenitala systemet, optiska kärl och sensoriska epitel i innerörat.

Defekter

Vitamin A-brist hos möss har visat sig orsaka problem med spermatogenes, oregelbundna brunstcykler, förändringar i livmoderns epitel och reproduktionssvikt som slutar med fosterdöd och reabsorption.

Vävnader med CRABP2 kan vara känsliga för höga nivåer av retinsyra, vilket kan orsaka defekter i utvecklingen av dessa vävnader.

CRABP2-gen knockout-studier bör utföras för att fastställa eventuella specifika defekter orsakade av förlust av denna gen.

Interaktioner

CRABP2 har visats interagera med Cyclin D3 .

externa länkar

• Mänskligt CRABP2- genomplacering och CRABP2- geninformationssida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

•   Eller MS, Oleksiak MF, McQuaid TJ, McAfee SG, Gilchrest BA (feb 1992). "Den molekylära kloningen och uttrycket av två CRABP-cDNA från mänsklig hud". Experimentell cellforskning . 198 (2): 328–36. doi : 10.1016/0014-4827(92)90387-N . PMID 1309505 .
•    Äldste JT, Aström A, Pettersson U, Voorhees JJ, Trent JM (jul 1992). "Tilldelning av den humana CRABP-II-genen till kromosom 1q21 genom icke-isotopisk hybridisering in situ" ( PDF) . Human Genetik . 89 (5): 487–90. doi : 10.1007/BF00219171 . hdl : 2027.42/47631 . PMID 1321791 . S2CID 24955299 .
•   Aström A, Pettersson U, Voorhees JJ (dec 1992). "Struktur av den humana cellulära retinsyrabindande protein II-genen. Tidig transkriptionell reglering av retinsyra" . Journal of Biological Chemistry . 267 (35): 25251–5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)74033-2 . PMID 1334086 .
•   Thompson JR, Bratt JM, Banaszak LJ (sep 1995). "Kristallstruktur av cellulärt retinsyrabindande protein I visar ökad tillgång till bindningskaviteten på grund av bildandet av ett intermolekylärt beta-ark". Journal of Molecular Biology . 252 (4): 433–46. doi : 10.1006/jmbi.1995.0509 . PMID 7563063 .
•   Kleywegt GJ, Bergfors T, Senn H, Le Motte P, Gsell B, Shudo K, Jones TA (dec 1994). "Kristallstrukturer av cellulära retinsyrabindande proteiner I och II i komplex med all-trans-retinsyra och en syntetisk retinoid" . Struktur . 2 (12): 1241–58. doi : 10.1016/S0969-2126(94)00125-1 . PMID 7704533 .
•   Stephanou A, Sarlis NJ, Richards R, Handwerger S (juli 1994). "Uttryck av retinsyrareceptorsubtyper och cellulär retinsyrabindande protein-II mRNA under differentiering av humana trofoblastceller". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 202 (2): 772–80. doi : 10.1006/bbrc.1994.1997 . PMID 8048948 .
•   Sanquer S, Eller MS, Gilchrest BA (feb 1993). "Retinoider och differentieringstillstånd modulerar CRABP II-genuttryck i en hudekvivalent" . Journal of Investigative Dermatology . 100 (2): 148–53. doi : 10.1111/1523-1747.ep12462785 . PMID 8381448 .
•   Wang L, Li Y, Yan H (januari 1997). "Struktur-funktionsrelationer av cellulära retinsyrabindande proteiner. Kvantitativ analys av de ligandbindande egenskaperna hos vildtypsproteiner och platsriktade mutanter" . Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1541–7. doi : 10.1074/jbc.272.3.1541 . PMID 8999826 .
•   Flagiello D, Apiou F, Gibaud A, Poupon MF, Dutrillaux B, Malfoy B (1997). "Tilldelning av generna för cellulärt retinsyrabindande protein 1 (CRABP1) och 2 (CRABP2) till humant kromosomband 15q24 respektive 1q21.3 genom in situ hybridisering". Cytogenetik och cellgenetik . 76 (1–2): 17–8. doi : 10.1159/000134502 . PMID 9154115 .
•   Brar AK, Kessler CA, Meyer AJ, Cedars MI, Jikihara H (mars 1996). "Retinsyra undertrycker in vitro decidualisering av humana endometriala stromaceller" . Molekylär mänsklig reproduktion . 2 (3): 185–93. doi : 10.1093/molh/2.3.185 . PMID 9238678 .
•   Chen X, Tordova M, Gilliland GL, Wang L, Li Y, Yan H, Ji X (maj 1998). "Kristallstruktur av apo-cellulärt retinsyrabindande protein typ II (R111M) antyder en mekanism för ligandinträde" . Journal of Molecular Biology . 278 (3): 641–53. doi : 10.1006/jmbi.1998.1734 . PMID 9600845 .
•   Wang L, Li Y, Abildgaard F, Markley JL, Yan H (sep 1998). "NMR-lösningsstruktur av typ II humant cellulärt retinsyrabindande protein: implikationer för ligandbindning". Biokemi . 37 (37): 12727–36. doi : 10.1021/bi9808924 . PMID 9737849 .
•   Wang L, Yan H (sep 1998). "NMR-studie tyder på en viktig roll för Arg111 för att upprätthålla strukturen och de dynamiska egenskaperna hos typ II humant cellulärt retinsyrabindande protein". Biokemi . 37 (37): 13021–32. doi : 10.1021/bi981021x . PMID 9737883 .
•   Chaudhuri BN, Kleywegt GJ, Broutin-L'Hermite I, Bergfors T, Senn H, Le Motte P, Partouche O, Jones TA (nov 1999). "Strukturer av cellulära retinoinsyrabindande proteiner I och II i komplex med syntetiska retinoider". Acta Crystallographica Sektion D. 55 (Pt 11): 1850–7. doi : 10.1107/S0907444999011026 . PMID 10531482 .
•    Budhu AS, Noy N (april 2002). "Direkt kanalisering av retinsyra mellan cellulärt retinsyrabindande protein II och retinsyrareceptor sensibiliserar bröstkarcinomceller för retinsyrainducerad tillväxtstopp" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (8): 2632–41. doi : 10.1128/MCB.22.8.2632-2641.2002 . PMC 133717 . PMID 11909957 .
•   Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (feb 2003). "Cyclin D3 är en kofaktor för retinsyrareceptorer, som modulerar deras aktivitet i närvaro av cellulärt retinsyrabindande protein II" . Journal of Biological Chemistry . 278 (8): 6355–62. doi : 10.1074/jbc.M210697200 . PMID 12482873 .
•   Behrens GM, Genschel J, Schmidt RE, Schmidt HH (maj 2003). "Brist på mutationer i LMNA, dess promotorregion och det cellulära retinsyrabindande proteinet II (CRABP II) i HIV-associerad lipodystrofi". European Journal of Medical Research . 8 (5): 221–5. PMID 12844477 .
•   Van den Bogaerdt AJ, El Ghalbzouri A, Hensbergen PJ, Reijnen L, Verkerk M, Kroon-Smits M, Middelkoop E, Ulrich MM (mars 2004). "Differentiellt uttryck av CRABP-II i fibroblaster härledda från dermis och subkutant fett". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 315 (2): 428–33. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.069 . PMID 14766225 .