Breznakibacter
| Breznakibacter | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Provins: | |
| Klass: | |
| Beställa: | |
| Familj: | |
| Släkte: |
Breznakibacter
García-López et al . 2020
|
| Binomialt namn | |
|
Breznakibacter xylanolyticus (Haack och Breznak 1993) García-López et al . 2020
|
|
| Synonymer | |
|
|
Breznakibacter xylanolyticus är en sötvattenglidbakterie som bryter ned olösliga partikelformiga xylaner och dominerar xylanjäsning, särskilt i svavel- och metanrika miljöer. Det är den enda arten i släktet Breznakibacter . Vid tidpunkten för isolering klassificerades den i ordningen Cytophagales på basis av fenotypiska egenskaper såsom polymernedbrytning och glidande motilitet. Den har sedan omklassificerats till ordningen Bacteroidales på grund av 16s rRNA-genomsekvensanalys.
Tillväxt och miljö
Breznakibacter xylanolyticus bildar orange till rosa kolonier när de odlas på xylankulturer, på grund av produktionen av karotenoidpigment. Xylaner anses vara de 2:a vanligaste polysackariderna i naturen, som går igenom stora mängder omsättning. I naturen finns de alltid i komplex med cellulosa i växtcellväggar. Eftersom B. xylanolyticus inte växer på cellulosa, förutsägs det att stammen växer i gemenskap med andra mikroorganismer som kan bryta ner cellulosa. Mekanismen för xylannedbrytning är dåligt förstådd, vilket gör den enzymatiska vägen för B. xylanolyticus mycket intressant.
Xylan-nedbrytande enzymer
Breznakibacter xylanolyticus kodar för ett cytoplasmatiskt α-l-arabinofuranosidas som kallas Arf1, vilket står för nästan all arabinofuranosidasaktivitet i cellerna. Arfl är en trimer eller tetramer på mellan 160 och 210 kDa. Fragment av xylooligosackarid som är tillräckligt små för att ha passerat genom det cytoplasmatiska membranet kan störa andra enzymer. Arf1 klyver α-l-arabinofuranosylrester från fragment som finns i cytoplasman och producerar arabinos från kulturer som råg, majskolvar, vete och havrespeltarabinoxylaner. Att ta bort arabinos från arabinoxylanerna gör att oligosackariden bryts ned helt av ENDOX-enzymer, som helt bryter ned xylan-ryggraden i cellen.