Beta-defensin 2

DEFB4B
Tillgängliga strukturer
PDB	Human UniProt-sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, DEFB4P, defensin beta 4B
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa

Beta-defensin 2 (BD-2) även känd som hud-antimikrobiell peptid 1 (SAP1) är en peptid som hos människor kodas av DEFB4 - genen (defensin, beta 4) .

Humant beta-defensin-2 (hBD-2) är en cysteinrik katjonisk lågmolekylär antimikrobiell peptid som nyligen upptäckts i lesional hud.

Strukturera

hBD-2 är ett protein vars primära struktur är gjord av 64 aminosyror. Vid koncentrationer ≤2,4 mM är hBD-2 monomer. Strukturen är amfifil med en ojämn ytfördelning av positiv laddning och innehåller flera viktiga strukturella element, inklusive ett trippelsträngat, antiparallellt beta-ark med strängarna 2 och 3 i en beta-hårnålskonformation . Bestämningen av andra strukturella element beror på vilken teknik som används. När röntgenkristallografi används kan en alfa-helix observeras vid den N-terminala änden av proteinet (PDB-koder: , och ). Vid användning av NMR visas inte denna alfa-helix (PDB-kod: ), men denna struktur bestämdes med en trunkerad version av hBD-2 som saknade de första 4 aminosyrorna och kan vara orsaken till avvikelsen.

Fungera

Defensiner bildar en familj av mikrobicida och cytotoxiska peptider gjorda av neutrofiler . Medlemmar av defensinfamiljen är mycket lika i proteinsekvens. Beta-defensin 2 är en antibiotisk peptid som är lokalt reglerad av inflammation .

Humant beta-defensin 2 produceras av ett antal epitelceller och uppvisar potent antimikrobiell aktivitet mot Gram-negativa bakterier och Candida , men inte Gram-positiva S. aureus . Det har spekulerats i att beta-defensin 2 kan bidra till sällan av gramnegativa infektioner på hud och lungvävnad.

hBD-2 representerar det första humana defensinet som produceras efter stimulering av epitelceller genom kontakt med mikroorganismer såsom P. aeruginosa eller cytokiner såsom TNF-alfa och IL-1 beta. HBD-2-genen och proteinet uttrycks lokalt i keratinocyter associerade med inflammatoriska hudskador. Det är spännande att spekulera i att HBD-2 är en dynamisk komponent i det lokala epiteliala försvarssystemet i huden och luftvägarna som har en roll att skydda ytor från infektioner och ger en möjlig orsak till att hud- och lunginfektioner med gramnegativa bakterier är ganska sällsynt.

Även om detta protein inte har någon antibakteriell aktivitet mot grampositiva bakterier, finns det en studie som visar att det finns en synergi mellan hBD-2 och andra proteiner. Ett exempel på denna synergistiska effekt är med epiP, ett protein som segregeras av vissa stammar av S. epidermidis . hBD2, som håller hand med epiP, kan döda S. aureus , en grampositiv bakterie som är ansvarig för mänskliga sjukdomar.

externa länkar

Human DEFB4A- genomplacering och DEFB4A- gendetaljersida i UCSC Genome Browser .

Vidare läsning

Weinberg A, Krisanaprakornkit S, Dale BA (1999). "Epiteliala antimikrobiella peptider: granskning och betydelse för orala applikationer" . Kritiska recensioner i oral biologi och medicin . 9 (4): 399–414. doi : 10.1177/10454411980090040201 . PMID 9825219 .
Schröder JM, Harder J (juni 1999). "Human beta-defensin-2". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 31 (6): 645–651. doi : 10.1016/S1357-2725(99)00013-8 . PMID 10404637 .
Bals R, Wang X, Wu Z, Freeman T, Bafna V, Zasloff M, Wilson JM (september 1998). "Humant beta-defensin 2 är ett saltkänsligt peptidantibiotikum som uttrycks i mänskliga lungor" . The Journal of Clinical Investigation . 102 (5): 874–880. doi : 10.1172/JCI2410 . PMC 508952 . PMID 9727055 .
Liu L, Wang L, Jia HP, Zhao C, Heng HH, Schutte BC, McCray PB, Ganz T (november 1998). "Struktur och kartläggning av den mänskliga beta-defensin HBD-2-genen och dess uttryck vid inflammationsställen". Gene . 222 (2): 237–244. doi : 10.1016/S0378-1119(98)00480-6 . PMID 9831658 .
Mathews M, Jia HP, Guthmiller JM, Losh G, Graham S, Johnson GK, Tack BF, McCray PB (juni 1999). "Produktion av beta-defensin antimikrobiella peptider av munslemhinnan och spottkörtlarna" . Infektion och immunitet . 67 (6): 2740–2745. doi : 10.1128/IAI.67.6.2740-2745.1999 . PMC 96577 . PMID 10338476 .
Jia HP, Mills JN, Barahmand-Pour F, Nishimura D, Mallampali RK, Wang G, Wiles K, Tack BF, Bevins CL, McCray PB (september 1999). "Molekylär kloning och karakterisering av råttgener som kodar för homologer av mänskliga beta-defensiner" . Infektion och immunitet . 67 (9): 4827–4833. doi : 10.1128/IAI.67.9.4827-4833.1999 . PMC 96815 . PMID 10456937 .
Yang D, Chertov O, Bykovskaia SN, Chen Q, Buffo MJ, Shogan J, Anderson M, Schröder JM, Wang JM, Howard OM, Oppenheim JJ (oktober 1999). "Beta-defensiner: kopplar medfödd och adaptiv immunitet genom dendritisk och T-cell CCR6". Vetenskap . 286 (5439): 525–528. doi : 10.1126/science.286.5439.525 . PMID 10521347 .
Diamond G, Kaiser V, Rhodes J, Russell JP, Bevins CL (januari 2000). "Transkriptionell reglering av beta-defensin-genuttryck i trakeala epitelceller" . Infektion och immunitet . 68 (1): 113–119. doi : 10.1128/iai.68.1.113-119.2000 . PMC 97109 . PMID 10603376 .
Harder J, Meyer-Hoffert U, Teran LM, Schwichtenberg L, Bartels J, Maune S, Schröder JM (juni 2000). "Mucoid Pseudomonas aeruginosa, TNF-alfa och IL-1beta, men inte IL-6, inducerar humant beta-defensin-2 i respiratoriska epitel". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology . 22 (6): 714–721. doi : 10.1165/ajrcmb.22.6.4023 . PMID 10837369 .
Hoover DM, Rajashankar KR, Blumenthal R, Puri A, Oppenheim JJ, Chertov O, Lubkowski J (oktober 2000). "Strukturen av humant beta-defensin-2 visar bevis på oligomerisering av högre ordning" . Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32911–32918. doi : 10.1074/jbc.M006098200 . PMID 10906336 .
Meyer JE, Harder J, Görögh T, Schröder JM, Maune S (juli 2000). "[hBD-2-genuttryck i nässlemhinnan]". Laryngo- Rhino- Otologie . 79 (7): 400–403. doi : 10.1055/s-2000-4626 . PMID 11005092 .
Ali RS, Falconer A, Ikram M, Bissett CE, Cerio R, Quinn AG (juli 2001). "Uttryck av peptidantibiotika humant beta-defensin-1 och humant beta-defensin-2 i normal mänsklig hud" . Journal of Investigative Dermatology . 117 (1): 106–111. doi : 10.1046/j.0022-202x.2001.01401.x . PMID 11442756 .
Carothers DG, Graham SM, Jia HP, Ackermann MR, Tack BF, McCray PB (2001). "Produktion av beta-defensin antimikrobiella peptider av maxillary sinus mucosa". American Journal of Rhinology . 15 (3): 175–179. doi : 10.2500/105065801779954238 . PMID 11453504 . S2CID 31583849 .
Biragyn A, Surenhu M, Yang D, Ruffini PA, Haines BA, Klyushnenkova E, Oppenheim JJ, Kwak LW (december 2001). "Medlare av medfödd immunitet som riktar sig mot omogna, men inte mogna, dendritiska celler inducerar antitumörimmunitet när de är genetiskt sammansmälta med icke-immunogena tumörantigener" . Journal of Immunology . 167 (11): 6644–6653. doi : 10.4049/jimmunol.167.11.6644 . PMID 11714836 .
Bauer F, Schweimer K, Klüver E, Conejo-Garcia JR, Forssmann WG, Rösch P, Adermann K, Sticht H (december 2001). "Strukturbestämning av mänskliga och murina beta-defensiner avslöjar strukturell bevarande i frånvaro av signifikant sekvenslikhet" . Proteinvetenskap . 10 (12): 2470–2479. doi : 10.1110/ps.24401 . PMC 2374044 . PMID 11714914 .
Takahashi A, Wada A, Ogushi K, Maeda K, Kawahara T, Mawatari K, Kurazono H, Moss J, Hirayama T, Nakaya Y (november 2001). "Produktion av beta-defensin-2 av humana kolon epitelceller inducerad av Salmonella enteritidis flagella filament strukturellt protein" . FEBS Bokstäver . 508 (3): 484–488. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03088-5 . PMID 11728477 . S2CID 24925463 .
Schibli DJ, Hunter HN, Aseyev V, Starner TD, Wiencek JM, McCray PB, Tack BF, Vogel HJ (mars 2002). "Lösningsstrukturerna för de mänskliga beta-defensinerna leder till en bättre förståelse av den potenta bakteriedödande aktiviteten hos HBD3 mot Staphylococcus aureus. " Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 8279–8289. doi : 10.1074/jbc.M108830200 . PMID 11741980 .