Bakteriofag pRNA
| Bakteriofag-pRNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av Phage_pRNA-
| |
| identifierare | |
| Symbol | Phage_pRNA |
| Rfam | RF00044 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen |
| Domän(er) | Virus |
| SÅ | SO:0000655 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Bakteriofag-pRNA är ett ncRNA- element. Under replikering av linjära dsDNA-virus packas det virala genomet i den förbildade virala prokapsiden . Förpackningen av DNA i prokapsiden kräver en molekylär motor , som använder ATP som energi för att åstadkomma den energetiskt ogynnsamma rörelsen. I vissa bakteriofag är en RNA (pRNA) molekyl en viktig komponent i denna motor. Strukturella analyser av förpackningsmotorn har visat att pRNA- molekylen har femfaldig symmetri när den är fäst vid proheaden. pRNA:t tros vara bundet av kapsidkopplingsproteinet . Endast de första 120 baserna av pRNA:t är väsentliga för packning av det virala DNA:t. pRNA föreslås vara sammansatt av två domäner, en motsvarande de första 120 baserna och den andra till de återstående 50 baserna. Nukleär klyvning sker i den enkelsträngade regionen som länkar samman dessa två domäner.