Ataxin 3

ATXN3
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, AT3, ATX3, JOS, MJD, MJD1, SCA3, Ataxin 3
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Ataxin-3 är ett protein som hos människor kodas av ATXN3 -genen .

Klinisk signifikans

Machado-Josephs sjukdom , även känd som spinocerebellär ataxi-3, är en autosomal dominant neurologisk störning. Proteinet som kodas av ATXN3 -genen innehåller CAG-upprepningar i den kodande regionen, och expansionen av dessa upprepningar från normala 13-36 till 68-79 är orsaken till Machado-Josephs sjukdom. Denna störning är således en trinukleotidupprepningsstörning typ I känd som en polyglutamin (PolyQ) sjukdom . Det finns en omvänd korrelation mellan debutåldern och antalet CAG-upprepningar. Alternativt splitsade transkriptvarianter som kodar för olika isoformer har beskrivits för denna gen.

Interaktioner

Ataxin 3 har visat sig interagera med:

• RAD23A ,
• RAD23B och
• VCP .

Modellorganismer

Modellorganismer har använts i studien av ATXN3-funktion. En villkorlig knockout-muslinje som heter Atxn3 ^{tm1a(KOMP)Wtsi} genererades vid Wellcome Trust Sanger Institute . Han- och hondjur genomgick en standardiserad fenotypisk screening för att bestämma effekterna av deletion. Ytterligare undersökningar utförda: - Djupgående immunologisk fenotypning - djupgående ben- och broskfenotypning

Atxn3 knockout mus fenotyp

Karakteristisk	Fenotyp
All data tillgänglig på.
Leukocyter från perifert blod 6 veckor	Vanligt
Insulin	Vanligt
Hematologi 6 veckor	Vanligt
Homozygot viabilitet vid P14	Vanligt
Homozygot fertilitet	Vanligt
Kroppsvikt	Vanligt
Neurologisk bedömning	Vanligt
Greppstyrka	Vanligt
Dysmorfologi	Vanligt
Indirekt kalorimetri	Vanligt
Glukostoleranstest	Vanligt
Auditiv hjärnstammsrespons	Vanligt
DEXA	Vanligt
Radiografi	Vanligt
Ögonmorfologi	Vanligt
Klinisk kemi	Vanligt
Hematologi 16 veckor	Vanligt
Leukocyter från perifert blod 16 veckor	Vanligt
Hjärtvikt	Vanligt
Salmonellainfektion _	Vanligt
Cytotoxisk T-cellsfunktion	Vanligt
Immunfenotypning av mjälte	Vanligt
Mesenterisk lymfkörtelimmunfenotypning	Vanligt
Benmärgsimmunfenotypning	Vanligt
Epidermal immunkomposition	Vanligt
Influensa utmaning	Vanligt

Vidare läsning

•    Goto J, Watanabe M, Ichikawa Y, Yee SB, Ihara N, Endo K, Igarashi S, Takiyama Y, Gaspar C, Maciel P, Tsuji S, Rouleau GA, Kanazawa I (aug 1997). "Machado-Josephs sjukdomsgenprodukter som bär olika karboxylterminaler". Neurovetenskaplig forskning . 28 (4): 373–7. doi : 10.1016/S0168-0102(97)00056-4 . PMID 9274833 . S2CID 27241785 .
•   Schöls L, Vieira-Saecker AM, Schöls S, Przuntek H, Epplen JT, Riess O (juni 1995). "Trinukleotidexpansion inom MJD1-genen uppträder kliniskt som spinocerebellär ataxi och förekommer oftast hos tyska SCA-patienter". Human molekylär genetik . 4 (6): 1001–5. doi : 10.1093/hmg/4.6.1001 . PMID 7655453 .
•    Stevanin G, Cancel G, Dürr A, Chneiweiss H, Dubourg O, Weissenbach J, Cann HM, Agid Y, Brice A (Jan 1995). "Genen för spinal cerebellar ataxi 3 (SCA3) är belägen i en region av cirka 3 cM på kromosom 14q24.3-q32.2" . American Journal of Human Genetics . 56 (1): 193–201. PMC 1801316 . PMID 7825578 .
•    Kawaguchi Y, Okamoto T, Taniwaki M, Aizawa M, Inoue M, Katayama S, Kawakami H, Nakamura S, Nishimura M, Akiguchi I (november 1994). "CAG-expansion i en ny gen för Machado-Josephs sjukdom vid kromosom 14q32.1". Naturgenetik . 8 (3): 221–8. doi : 10.1038/ng1194-221 . PMID 7874163 . S2CID 29188685 .
•   Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•    Ikeda H, Yamaguchi M, Sugai S, Aze Y, Narumiya S, Kakizuka A (juni 1996). "Utökad polyglutamin i proteinet Machado-Josephs sjukdom inducerar celldöd in vitro och in vivo". Naturgenetik . 13 (2): 196–202. doi : 10.1038/ng0696-196 . PMID 8640226 . S2CID 21966287 .
•    Paulson HL, Das SS, Crino PB, Perez MK, Patel SC, Gotsdiner D, Fischbeck KH, Pittman RN (april 1997). "Machado-Josephs sjukdomsgenprodukt är ett cytoplasmatiskt protein som uttrycks brett i hjärnan". Annals of Neurology . 41 (4): 453–62. doi : 10.1002/ana.410410408 . PMID 9124802 . S2CID 43460483 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (okt 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•   Wellington CL, Ellerby LM, Hackam AS, Margolis RL, Trifiro MA, Singaraja R, McCutcheon K, Salvesen GS, Propp SS, Bromm M, Rowland KJ, Zhang T, Rasper D, Roy S, Thornberry N, Pinsky L, Kakizuka A Ross CA, Nicholson DW, Bredesen DE, Hayden MR (april 1998). "Kaspasklyvning av genprodukter associerade med triplettexpansionsstörningar genererar trunkerade fragment som innehåller polyglutaminkanalen" . Journal of Biological Chemistry . 273 (15): 9158–67. doi : 10.1074/jbc.273.15.9158 . PMID 9535906 .
•   Tait D, Riccio M, Sittler A, Scherzinger E, Santi S, Ognibene A, Maraldi NM, Lehrach H, Wanker EE (juni 1998). "Ataxin-3 transporteras in i kärnan och associeras med kärnmatrisen" . Human molekylär genetik . 7 (6): 991–7. doi : 10.1093/hmg/7.6.991 . PMID 9580663 .
•   Wang G, Sawai N, Kotliarova S, Kanazawa I, Nukina N (juli 2000). "Ataxin-3, MJD1-genprodukten, interagerar med de två humana homologerna av jäst-DNA-reparationsprotein RAD23, HHR23A och HHR23B" . Human molekylär genetik . 9 (12): 1795–803. doi : 10.1093/hmg/9.12.1795 . PMID 10915768 .
•   Ichikawa Y, Goto J, Hattori M, Toyoda A, Ishii K, Jeong SY, Hashida H, Masuda N, Ogata K, Kasai F, Hirai M, Maciel P, Rouleau GA, Sakaki Y, Kanazawa I (2001). "Den genomiska strukturen och uttrycket av MJD, genen för Machado-Josephs sjukdom" . Journal of Human Genetics . 46 (7): 413–22. doi : 10.1007/s100380170060 . PMID 11450850 .
•    Chai Y, Shao J, Miller VM, Williams A, Paulson HL (juli 2002). "Live-cell imaging avslöjar divergerande intracellulär dynamik hos polyglutaminsjukdomsproteiner och stöder en sekvestreringsmodell för patogenes" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (14): 9310–5. Bibcode : 2002PNAS...99.9310C . doi : 10.1073/pnas.152101299 . PMC 123137 . PMID 12084819 .
•    Yoshida H, Yoshizawa T, Shibasaki F, Shoji S, Kanazawa I (juli 2002). "Kemiska chaperoner minskar aggregatbildning och celldöd orsakad av den trunkerade genprodukten från Machado-Josephs sjukdom med en utökad polyglutaminsträcka". Sjukdomens neurobiologi . 10 (2): 88–99. doi : 10.1006/nbdi.2002.0502 . PMID 12127147 . S2CID 25183307 .
•   Li F, Macfarlan T, Pittman RN, Chakravarti D (november 2002). "Ataxin-3 är ett histonbindande protein med två oberoende transkriptionella corepressoraktiviteter" . Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 45004–12. doi : 10.1074/jbc.M205259200 . PMID 12297501 .
•    Albrecht M, Hoffmann D, Evert BO, Schmitt I, Wüllner U, Lengauer T (feb 2003). "Strukturell modellering av ataxin-3 avslöjar avlägsen homologi med adaptiner". Proteiner . 50 (2): 355–70. doi : 10.1002/prot.10280 . PMID 12486728 . S2CID 25660172 .
•   Marchal S, Shehi E, Harricane MC, Fusi P, Heitz F, Tortora P, Lange R (aug 2003). "Strukturell instabilitet och fibrillär aggregation av icke-expanderat humant ataxin-3 avslöjas under högt tryck och temperatur" . Journal of Biological Chemistry . 278 (34): 31554–63. doi : 10.1074/jbc.M304205200 . PMID 12766160 .

externa länkar

• GeneReviews/NCBI/NIH/UW-post om spinocerebellär ataxi typ 3
• Mänskligt ATXN3- genomplacering och ATXN3- geninformationssida i UCSC Genome Browser .