Ataxin-2

ATXN2
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ASL13, ATX2, SCA2, TNRC13, ataxin 2
externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Ataxin-2 är ett protein som hos människor kodas av ATXN2 -genen . Mutationer i ATXN2 orsakar spinocerebellär ataxi typ 2 (SCA2).

Proteinstruktur

Ataxin-2 innehåller följande proteindomäner:

Två LSm- domäner, som sannolikt tillåter det att binda RNA
Ett PAM2-motiv, förutspått att associera med det poly(A)-bindande proteinet
En polyglutaminkanal hos vissa arter (belägen nära aminoterminalen hos primater och mellan LSm-domänerna hos insekter)

En potentiell transkriptvariant, som saknar en intern kodande exon, har beskrivits; dess fullängdskaraktär är dock inte säker.

Arter, vävnad och subcellulär distribution

ATXN2 bevaras över eukaryoter . De flesta ryggradsdjur har två ortologer av genen (kallade ATXN2 och ATXN2L hos människor), med undantag för fåglar som bara har en. Växtarter har två till sex ATXN2 -ortologer.

ATXN2 uttrycks överallt i olika vävnader. Inom enskilda celler lokaliseras den till Golgi-apparaten och stressgranuler .

Fungera

Ataxin-2 är involverad i att reglera mRNA-translation genom dess interaktioner med det poly(A)-bindande proteinet. Det är också involverat i bildandet av stressgranuler och P-kroppar , som också spelar roller i RNA-reglering.

Klinisk signifikans

Spinocerebellär ataxi typ 2 (SCA2)

Polyglutaminkanalen i humant ataxin-2 är instabil och kan expandera när den överförs över generationer. Normala alleler har vanligtvis 22 eller 23 repetitioner, men kan innehålla upp till 31 repetitioner. Längre expansioner kan orsaka spinocerebellär ataxi typ 2 (SCA2), en dödlig progressiv genetisk störning där neuroner degenererar i lillhjärnan , inferior oliv , pons och andra områden. Symtom på SCA2 inkluderar ataxi (förlust av koordinerade rörelser), parkinsonism och demens i vissa fall. Sjukdomsallelen innehåller vanligtvis 34-52 CAG-repetitioner, men kan innehålla så få som 32 eller fler än 100, och kan expandera i storlek när den överförs till successiva generationer. Hur polyglutaminexpansionen i ataxin-2 leder till dessa symtom är okänt.

Amyotrofisk lateralskleros (ALS)

År 2010 upptäckte arbete från Aaron Gitler och Nancy Bonini vid University of Pennsylvania att CAG-expansion av medelstor storlek är signifikant förknippad med risken för att utveckla amyotrofisk lateralskleros (Lou Gehrigs sjukdom).

Primärt öppenvinkelglaukom (POAG) och intraokulärt tryck (IOP)

Genomomfattande associationsstudier har avslöjat ett signifikant samband av ATXN2 -varianter med POAG och IOP. Ytterligare undersökning av de genetiska och biologiska mekanismerna som ligger bakom sambandet mellan ATXN2 och POAG kan ge värdefulla insikter om patogenesen och potentiella terapeutiska mål för glaukom.

Vidare läsning

Stevanin G, Dürr A, Brice A (januari 2000). "Kliniska och molekylära framsteg i autosomala dominanta cerebellära ataxier: från genotyp till fenotyp och fysiopatologi" . European Journal of Human Genetics . 8 (1): 4–18. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200403 . PMID 10713882 .
Pulst SM, Nechiporuk A, Nechiporuk T, Gispert S, Chen XN, Lopes-Cendes I, Pearlman S, Starkman S, Orozco-Diaz G, Lunkes A, DeJong P, Rouleau GA, Auburger G, Korenberg JR, Figueroa C, Sahba S (november 1996). "Måttlig expansion av en normalt biallel trinukleotidupprepning vid spinocerebellär ataxi typ 2". Naturgenetik . 14 (3): 269–76. doi : 10.1038/ng1196-269 . PMID 8896555 . S2CID 12365475 .
Sanpei K, Takano H, Igarashi S, Sato T, Oyake M, Sasaki H, Wakisaka A, Tashiro K, Ishida Y, Ikeuchi T, Koide R, Saito M, Sato A, Tanaka T, Hanyu S, Takiyama Y, Nishizawa M Shimizu N, Nomura Y, Segawa M, Iwabuchi K, Eguchi I, Tanaka H, Takahashi H, Tsuji S (november 1996). "Identifiering av genen för spinocerebellar ataxi typ 2 med hjälp av en direkt identifiering av upprepad expansion och kloningsteknik, DIRECT". Naturgenetik . 14 (3): 277–84. doi : 10.1038/ng1196-277 . PMID 8896556 . S2CID 24971010 .
Imbert G, Saudou F, Yvert G, Devys D, Trottier Y, Garnier JM, Weber C, Mandel JL, Cancel G, Abbas N, Dürr A, Didierjean O, Stevanin G, Agid Y, Brice A (november 1996). "Klonning av genen för spinocerebellär ataxi 2 avslöjar ett locus med hög känslighet för expanderade CAG/glutamin-repetitioner". Naturgenetik . 14 (3): 285–91. doi : 10.1038/ng1196-285 . PMID 8896557 . S2CID 9304975 .
Sahba S, Nechiporuk A, Figueroa KP, Nechiporuk T, Pulst SM (februari 1998). "Genomisk struktur av den mänskliga genen för spinocerebellär ataxi typ 2 (SCA2) på kromosom 12q24.1". Genomik . 47 (3): 359–64. doi : 10.1006/geno.1997.5131 . PMID 9480749 .
Huynh DP, Del Bigio MR, Ho DH, Pulst SM (februari 1999). "Uttryck av ataxin-2 i hjärnor från normala individer och patienter med Alzheimers sjukdom och spinocerebellär ataxi 2". Annals of Neurology . 45 (2): 232–41. doi : 10.1002/1531-8249(199902)45:2<232::AID-ANA14>3.0.CO;2-7 . PMID 9989626 . S2CID 18022785 .
Huynh DP, Figueroa K, Hoang N, Pulst SM (september 2000). "Nukleär lokalisering eller inklusionskroppsbildning av ataxin-2 är inte nödvändiga för SCA2-patogenes hos mus eller människa". Naturgenetik . 26 (1): 44–50. doi : 10.1038/79162 . PMID 10973246 . S2CID 14489237 .
Affaitati A, de Cristofaro T, Feliciello A, Varrone S (april 2001). "Identifiering av alternativ splitsning av spinocerebellär ataxi typ 2-gen". Gene . 267 (1): 89–93. doi : 10.1016/S0378-1119(01)00402-4 . PMID 11311558 .
Kiehl TR, Shibata H, Vo T, Huynh DP, Pulst SM (augusti 2001). "Identifiering och uttryck av en musortolog av A2BP1". Däggdjurs genom . 12 (8): 595–601. doi : 10.1007/s00335-001-2056-4 . PMID 11471052 . S2CID 7340712 .
Choudhry S, Mukerji M, Srivastava AK, Jain S, Brahmachari SK (oktober 2001). "CAG-repeterande instabilitet vid SCA2-lokus: förankring av CAA-avbrott och kopplade enstaka nukleotidpolymorfismer" . Human molekylär genetik . 10 (21): 2437–46. doi : 10.1093/hmg/10.21.2437 . PMID 11689490 .
Pang JT, Giunti P, Chamberlain S, An SF, Vitaliani R, Scaravilli T, Martinian L, Wood NW, Scaravilli F, Ansorge O (mars 2002). "Neuronala intranukleära inneslutningar i SCA2: en genetisk, morfologisk och immunhistokemisk studie av två fall" . Hjärna . 125 (Pt 3): 656–63. doi : 10.1093/brain/awf060 . PMID 11872620 .
Satterfield TF, Jackson SM, Pallanck LJ (december 2002). "En Drosophila-homolog av polyglutaminsjukdomsgenen SCA2 är en doskänslig regulator av aktinfilamentbildning" . Genetik . 162 (4): 1687–702. doi : 10.1093/genetics/162.4.1687 . PMC 1462369 . PMID 12524342 .
Wiedemeyer R, Westermann F, Wittke I, Nowock J, Schwab M (januari 2003). "Ataxin-2 främjar apoptos av mänskliga neuroblastomceller" . Onkogen . 22 (3): 401–11. doi : 10.1038/sj.onc.1206150 . PMID 12545161 .
Payami H, Nutt J, Gancher S, Bird T, McNeal MG, Seltzer WK, Hussey J, Lockhart P, Gwinn-Hardy K, Singleton AA, Singleton AB, Hardy J, Farrer M (april 2003). "SCA2 kan presenteras som levodopa-responsiv parkinsonism". Rörelsestörningar . 18 (4): 425–9. doi : 10.1002/mds.10375 . PMID 12671950 . S2CID 35401117 .
Svetel M, Djarmati A, Dragasević N, Savić D, Culjković B, Romac S, Kostić VS (september 2003). "SCA2- och SCA3-mutationer i ung-debuterande dopa-responsiv parkinsonism". European Journal of Neurology . 10 (5): 597. doi : 10.1046/j.1468-1331.2003.00671.x . PMID 12940846 . S2CID 30076827 .
Brenneis C, Bösch SM, Schocke M, Wenning GK, Poewe W (oktober 2003). "Atrofimönster i SCA2 bestämt av voxelbaserad morfometri". NeuroReport . 14 (14): 1799–802. doi : 10.1097/00001756-200310060-00008 . PMID 14534423 . S2CID 26149005 .

externa länkar

GeneReviews/NIH/NCBI/UW-inlägg om spinocerebellär ataxi typ 2
Mänskligt ATXN2- genomplacering och ATXN2- geninformationssida i UCSC Genome Browser .