Aktinobakteriella fagholinfamiljen

Actinobacterial Phage Holin (APH)-familjen ( TC# 1.E.57) är en ganska stor familj av proteiner mellan 105 och 180 aminoacylrester i längd, som vanligtvis uppvisar ett enda transmembransegment (TMS) nära N-terminalen. En representativ lista över proteiner som tillhör APH-familjen finns i Transporter Classification Database .

Ett av arketypproteinerna i denna familj är Gp5-holin från mykobakteriofag Ms6. Mycobacteriophage Ms6 är en dubbelsträngad DNA (dsDNA) bakteriofag som, förutom det förutsagda endolysin (LysA)-holin (Gp4) lyseringssystemet, kodar för ytterligare tre proteiner inom sin lysmodul: Gpl, LysB och Gp5.

Ms6 Gp4 ( TC# 1.E.18.1.2 ) har tidigare beskrivits som ett klass II holinliknande protein. En andra förmodad holingen ( gp5 ) som kodar för ett protein (Gp5) med en förutsagd enkel N-terminal TMS identifierades i slutet av det lytiska Ms6-operonet. Varken det förmodade klass II-holinet eller den enda TMS-polypeptiden kunde utlösa lys i parvisa kombinationer med endolysin LysA i Escherichia coli . Ytterligare studier har dock visat att Ms6:s Gp4 och Gp5 interagerar med varandra. Detta tyder på att vid Ms6-infektion uppnås den korrekta och programmerade tidpunkten för lysering genom den kombinerade verkan av Gp4 och Gp5.

Se även

• Aktinobakterier
• Holin
• Lysin
• Databas för klassificering av transportörer

Vidare läsning

•    Petrovski, Steve; Seviour, Robert J.; Tillett, Daniel (2011). "Karakterisering av genomet av den polyvalenta lytiska bakteriofagen GTE2, som har potential för biokontroll av Gordonia-, Rhodococcus- och Nocardia-stabiliserade skum i aktiverade slamväxter" . Tillämpad och miljömikrobiologi . 77 (12): 3923–3929. doi : 10.1128/AEM.00025-11 . PMC 3131622 . PMID 21498753 .
•    Reddy, Bhaskara L.; Saier Jr, Milton H. (2013). "Topologiska och fylogenetiska analyser av bakteriella holinfamiljer och superfamiljer" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembraner . 1828 (11): 2654–2671. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 .
•    Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015). "Holins i bakterier, eukaryoter och arkéer: multifunktionella xenologer med potentiella bioteknologiska och biomedicinska tillämpningar" . Journal of Bakteriologi . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•   Wang, IN; Smith, DL; Young, R. (2000). "Holins: proteinklockorna för bakteriofaginfektioner". Årlig översyn av mikrobiologi . 54 : 799-825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . PMID 11018145 .

Från och med denna redigering använder den här artikeln innehåll från "1.E.57. The Actinobacterial Phage Holin (APH) Family" , som är licensierad på ett sätt som tillåter återanvändning under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , men inte under GFDL . _ Alla relevanta villkor måste följas.