APEX1

APEX1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, APE, APE1, APEN, APEX, APX, HAP1, REF1, apurin/apyrimidinisk endodeoxiribonukleas 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

DNA-lyas (apurin eller apyrimidinplats) är ett enzym som hos människor kodas av APEX1 -genen .

Apurina/apyrimidiniska (AP) ställen (även kallade "abasiska ställen") förekommer ofta i DNA-molekyler genom spontan hydrolys, genom DNA-skadande medel eller genom DNA-glykosylaser som tar bort specifika onormala baser. AP-ställen är pre-mutagena lesioner som kan förhindra normal DNA-replikation. Alla celler, från enkla prokaryoter till människor, har utvecklat system för att identifiera och reparera sådana platser. Klass II AP-endonukleaser klyver fosfodiesterryggraden 5' till AP-stället och initierar därigenom en process som kallas basexcisionsreparation (BER). APEX-genen (alternativt benämnd APE1, HAP1, APEN) kodar för det huvudsakliga AP-endonukleaset i humana celler. Splitsvarianter har hittats för denna gen; alla kodar för samma protein.

Interaktioner

APEX1 har visats interagera med MUTYH , Flap-strukturspecifikt endonukleas 1 och XRCC1 .

Åldrande

Brist på APEX1 orsakar ackumulering av DNA-skador som leder till både cellulär åldrande och kännetecken av för tidigt åldrande . Detta fynd stämmer överens med teorin att DNA-skador är en primär orsak till åldrande.

Vidare läsning

Mol CD, Hosfield DJ, Tainer JA (augusti 2000). "Abasic platsigenkänning av två apuriniska/apyrimidiniska endonukleasfamiljer i DNA-basexcisionsreparation: 3'-ändarna motiverar medlen". Mutationsforskning . 460 (3–4): 211–29. doi : 10.1016/s0921-8777(00)00028-8 . PMID 10946230 .
Fritz G (september 2000). "Human APE/Ref-1 protein". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 32 (9): 925–9. doi : 10.1016/S1357-2725(00)00045-5 . PMID 11084372 .
Fritz G, Grösch S, Tomicic M, Kaina B (november 2003). "APE/Ref-1 och däggdjursresponsen på genotoxisk stress". Toxikologi . 193 (1–2): 67–78. doi : 10.1016/S0300-483X(03)00290-7 . PMID 14599768 .
Tell G, Damante G, Caldwell D, Kelley MR (2005). "Den intracellulära lokaliseringen av APE1/Ref-1: mer än ett passivt fenomen?". Antioxidanter och redoxsignalering . 7 (3–4): 367–84. doi : 10.1089/ars.2005.7.367 . hdl : 1805/4802 . PMID 15706084 .
Hung RJ, Hall J, Brennan P, Boffetta P (november 2005). "Genetiska polymorfismer i basexcisionsreparationsvägen och cancerrisk: en enorm recension" . American Journal of Epidemiology . 162 (10): 925–42. doi : 10.1093/aje/kwi318 . PMID 16221808 .
Dyrkheeva NS, Khodyreva SN, Lavrik OI (2007). "[Multifunktionellt humant apurin/apyrimidiniskt endonukleas 1: rollen för ytterligare funktioner]". Molekuliarnaia Biologiia . 41 (3): 450–66. PMID 17685223 .
Harrison L, Ascione G, Menninger JC, Ward DC, Demple B (december 1992). "Human apurinisk endonukleasgen (APE): struktur och genomisk kartläggning (kromosom 14q11.2-12)". Human molekylär genetik . 1 (9): 677–80. doi : 10.1093/hmg/1.9.677 . PMID 1284593 .
Cheng XB, Bunville J, Patterson TA (januari 1992). "Nukleotidsekvens av ett cDNA för ett apurin/apyrimidiniskt endonukleas från HeLa-celler" . Nukleinsyraforskning . 20 (2): 370. doi : 10.1093/nar/20.2.370 . PMC 310384 . PMID 1371347 .
Xanthoudakis S, Miao G, Wang F, Pan YC, Curran T (september 1992). "Redoxaktivering av Fos-Jun DNA-bindande aktivitet förmedlas av ett DNA-reparationsenzym" . EMBO Journal . 11 (9): 3323–35. doi : 10.1002/j.1460-2075.1992.tb05411.x . PMC 556867 . PMID 1380454 .
Zhao B, Grandy DK, Hagerup JM, Magenis RE, Smith L, Chauhan BC, Henner WD (augusti 1992). "Den mänskliga genen för apurin/apyrimidinisk endonukleas (HAP1): sekvens och lokalisering till kromosom 14 band q12" . Nukleinsyraforskning . 20 (15): 4097–8. doi : 10.1093/nar/20.15.4097 . PMC 334100 . PMID 1380694 .
Robson CN, Hochhauser D, Craig R, Rack K, Buckle VJ, Hickson ID (september 1992). "Struktur av den mänskliga DNA-reparationsgenen HAP1 och dess lokalisering till kromosom 14q 11.2-12" . Nukleinsyraforskning . 20 (17): 4417–21. doi : 10.1093/nar/20.17.4417 . PMC 334166 . PMID 1383925 .
Seki S, Hatsushika M, Watanabe S, Akiyama K, Nagao K, Tsutsui K (juli 1992). "cDNA-kloning, sekvensering, uttryck och möjlig domänstruktur av humant APEX-nukleas homologt med Escherichia coli exonukleas III". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur och uttryck . 1131 (3): 287–99. doi : 10.1016/0167-4781(92)90027-w . PMID 1627644 .
Robson CN, Hickson ID (oktober 1991). "Isolering av cDNA-kloner som kodar för ett humant apurin/apyrimidinendonukleas som korrigerar DNA-reparations- och mutagenesdefekter i E. coli xth (exonukleas III) mutanter" . Nukleinsyraforskning . 19 (20): 5519–23. doi : 10.1093/nar/19.20.5519 . PMC 328951 . PMID 1719477 .
Demple B, Herman T, Chen DS (december 1991). "Kloning och uttryck av APE, cDNA som kodar för det huvudsakliga humana apuriniska endonukleaset: definition av en familj av DNA-reparationsenzymer" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 88 (24): 11450–4. Bibcode : 1991PNAS...8811450D . doi : 10.1073/pnas.88.24.11450 . PMC 53153 . PMID 1722334 .
Okazaki T, Chung U, Nishishita T, Ebisu S, Usuda S, Mishiro S, Xanthoudakis S, Igarashi T, Ogata E (november 1994). "Ett redoxfaktorprotein, ref1, är involverat i negativ genreglering av extracellulärt kalcium" . Journal of Biological Chemistry . 269 (45): 27855–62. doi : 10.1016/S0021-9258(18)46865-2 . PMID 7961715 .
Akiyama K, Seki S, Oshida T, Yoshida MC (september 1994). "Struktur, promotoranalys och kromosomal tilldelning av den mänskliga APEX-genen". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Genstruktur och uttryck . 1219 (1): 15–25. doi : 10.1016/0167-4781(94)90241-0 . PMID 8086453 .
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (april 1996). "En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek. Analytisk biokemi . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Chung U, Igarashi T, Nishishita T, Iwanari H, Iwamatsu A, Suwa A, Mimori T, Hata K, Ebisu S, Ogata E, Fujita T, Okazaki T (april 1996). "Interaktionen mellan Ku-antigen och REF1-protein förmedlar negativ genreglering av extracellulärt kalcium" . Journal of Biological Chemistry . 271 (15): 8593–8. doi : 10.1074/jbc.271.15.8593 . PMID 8621488 .
Rothwell DG, Hickson ID (november 1996). "Asparagine 212 är väsentligt för abasic site-igenkänning av det humana DNA-reparationsendonukleaset HAP1" . Nukleinsyraforskning . 24 (21): 4217–21. doi : 10.1093/nar/24.21.4217 . PMC 146231 . PMID 8932375 .
Izumi T, Henner WD, Mitra S (november 1996). "Negativ reglering av det stora humana AP-endonukleaset, ett multifunktionellt protein". Biokemi . 35 (47): 14679–83. doi : 10.1021/bi961995u . PMID 8942627 .

externa länkar

Mänskligt APEX1- genomplacering och APEX1- geninformationssida i UCSC Genome Browser .