ACTL6A

ACTL6A
Identifiers
	, ACTL6, ARPN-BETA, Arp4, BAF53A, INO80K, actin like 6A, SMARCN1
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Aktinliknande protein 6A är ett protein som hos människor kodas av ACTL6A -genen .

Fungera

Denna gen kodar för en familjemedlem av aktinrelaterade proteiner (ARP), som delar signifikant aminosyrasekvensidentitet med konventionella aktiner. Både aktiner och ARP har ett aktinveck, vilket är en ATP-bindande klyfta, som ett vanligt drag. ARP:erna är involverade i olika cellulära processer, inklusive vesikulär transport, spindelorientering, nukleär migration och kromatinremodellering . Denna gen kodar för ett 53 kDa subenhetsprotein av BAF-komplexet (BRG1/brm-associerad faktor) i däggdjur, vilket är funktionellt relaterat till SWI/SNF-komplex i S. cerevisiae och Drosophila ; det senare tros underlätta transkriptionell aktivering av specifika gener genom att antagonisera kromatinmedierad transkriptionell repression . Tillsammans med beta-aktin krävs det för maximal ATPas-aktivitet av BRG1 och för associering av BAF-komplexet med kromatin/matris. Tre transkriptvarianter som kodar för två olika proteinisoformer har beskrivits.

Klinisk signifikans

ACTL6A förstärks i huvud- och skivepitelcancer och ger dålig prognos hos patienter. I hepatocellulära karcinom främjar det metastasering.

Interaktioner

ACTL6A har visats interagera med SMARCA2 , Myc , Transformation/transkriptionsdomänassocierat protein , RuvB-like 1 och SMARCA4 .

Vidare läsning

Schafer DA, Schroer TA (2000). "Aktinrelaterade proteiner". Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 15 : 341–63. doi : 10.1146/annurev.cellbio.15.1.341 . PMID 10611965 .
Doyon Y, Côté J (2004). "Det mycket konserverade och multifunktionella NuA4 HAT-komplexet". Curr. Opin. Genet. Dev . 14 (2): 147–54. doi : 10.1016/j.gde.2004.02.009 . PMID 15196461 .
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (1998). "Ett humant RNA-polymeras II-komplex som innehåller faktorer som modifierar kromatinstrukturen" . Mol. Cell. Biol . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (1999). "Rekonstitution av ett kärnkromatinombyggnadskomplex från SWI/SNF-subenheter" . Mol. Cell . 3 (2): 247–53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID 10078207 .
Ikura T, Ogryzko VV, Grigoriev M, Groisman R, Wang J, Horikoshi M, Scully R, Qin J, Nakatani Y (2000). "Involvering av TIP60 histonacetylaskomplexet i DNA-reparation och apoptos" . Cell . 102 (4): 463–73. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00051-9 . PMID 10966108 . S2CID 18047169 .
Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (2001). "Det humana SWI/SNF-B-kromatinombyggnadskomplexet är relaterat till jäst rsc och lokaliseras vid kinetokorer av mitotiska kromosomer" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (24): 13015–20. Bibcode : 2000PNAS...9713015X . doi : 10.1073/pnas.240208597 . PMC 27170 . PMID 11078522 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). "Mot en katalog av mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs" . Genome Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2001). "Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering" . EMBO Rep . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Sung YH, Choi EY, Kwon H (2001). "Identifiering av ett nukleärt protein ArpN som en komponent i humant SWI/SNF-komplex och dess selektiva association med en undergrupp av aktiva gener". Mol. Celler . 11 (1): 75–81. PMID 11266125 .
Lai CH, Chiu JY, Lin W (2001). "Identifiering av den mänskliga krokhalsgenen genom jämförande genidentifiering". Biochim. Biophys. Acta . 1517 (3): 449–54. doi : 10.1016/s0167-4781(00)00295-5 . PMID 11342225 .
Fuchs M, Gerber J, Drapkin R, Sif S, Ikura T, Ogryzko V, Lane WS, Nakatani Y, Livingston DM (2001). "P400-komplexet är ett viktigt E1A-transformationsmål" . Cell . 106 (3): 297–307. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00450-0 . PMID 11509179 . S2CID 15634637 .
Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (2002). "SYT associerar med humana SNF/SWI-komplex och den C-terminala regionen av dess fusionspartner SSX1 riktar sig mot histoner" . J. Biol. Chem . 277 (7): 5498–505. doi : 10.1074/jbc.M108702200 . PMID 11734557 .
Park J, Wood MA, Cole MD (2002). "BAF53 bildar distinkta nukleära komplex och fungerar som en kritisk c-Myc-interagerande nukleär kofaktor för onkogen transformation" . Mol. Cell. Biol . 22 (5): 1307–16. doi : 10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002 . PMC 134713 . PMID 11839798 .
Ohfuchi E, Nishimori K, Harata M (2003). "Alternativa splitsningsprodukter av genen för ett humant nukleärt aktinrelaterat protein, hArpNbeta/Baf53, som kodar för en proteinisoform, hArpNbetaS, i cytoplasman". Biosci. Biotechnol. Biochem . 66 (8): 1740–3. doi : 10.1271/bbb.66.1740 . PMID 12353638 . S2CID 35246242 .
Kuroda Y, Oma Y, Nishimori K, Ohta T, Harata M (2003). "Hjärnspecifikt uttryck av det nukleära aktinrelaterade proteinet ArpNalpha och dess inblandning i SWI/SNF-kromatinombyggnadskomplex för däggdjur". Biochem. Biophys. Res. Commun . 299 (2): 328–34. doi : 10.1016/S0006-291X(02)02637-2 . PMID 12437990 .