Spelare födda 1 januari 2006 eller senare var berättigade att delta i tävlingen. Totalt tolv lag kvalificerade sig för att spela i den sista turneringen, inklusive Algeriet som kvalificerade sig automatiskt som värdar.
Sedan Africa U-17 Cup of Nations 2021 ställdes in kommer detta att vara den första upplagan i Africa U-17 Cup of Nations som har utökats till 12 lag istället för åtta. Var och en av de sex zonerna fick två platser i den sista turneringen.
UNAF U-17-turneringen 2022, som också fungerade som kval till Africa U-17 Cup of Nations, ägde rum mellan 8 och 14 november 2022 i Alger, Algeriet . De fyra lagen placerades i en grupp, där vinnarna kvalificerade sig till den sista turneringen. Algeriet deltog inte i turneringen, eftersom de kvalificerade sig automatiskt till den sista turneringen som värdar.
WAFU -UFOA Zon A- kvalet till Africa U-17 Cup of Nations var värd för Mauretanien med matcherna som spelades mellan 1 och 9 oktober 2022. Lottningen offentliggjordes den 21 juli 2022.
WAFU -UFOA Zon B- kval till Africa U-17 Cup of Nations var värd för Ghana med matcherna som spelades mellan 11 och 24 juni 2022. Lottningen offentliggjordes den 15 april 2022.
UNIFFAC- kvalet till Africa U-17 Cup of Nations var planerat att hållas i Kamerun mellan 7–12 januari 2023 men sköts upp och spelades så småningom mellan 12–18 januari 2023 på grund av att ett antal spelare ansågs vara överdrivna av MRI-testerna för Tchad, DR Kongo och Kamerun.
CECAFA -kvalet till Africa U-17 Cup of Nations var värd för Etiopien , med matcherna spelade mellan 2 och 19 oktober 2022. Lottningen offentliggjordes den 15 september 2022.
De tio lagen delades inledningsvis in i två grupper om fem lag. Etiopien, Tanzania, Somalia, Sydsudan och Eritrea drogs in i grupp A och Uganda, Djibouti, Sudan, Burundi och Rwanda drogs in i grupp B. Den 26 september drog sig dock Eritrea och Rwanda ur tävlingen, vilket lämnade båda grupperna med fyra lag. Den 1 oktober diskvalificerades Djibouti och Sudan från turneringen efter att några av deras spelare misslyckades med MRI-testet, vilket lämnade grupp B med bara två lag.
En omlottning genomfördes sedan den 2 oktober, med tre lag lottade i två grupper. Vinnarna och tvåan i varje grupp gick vidare till semifinal.
De nio lagen lottades till en början i tre grupper om tre lag. Malawi, Botswana och Namibia drogs in i grupp A; Angola, Sydafrika och Mauritius drogs in i grupp B; och Zambia, Moçambique och Seychellerna drogs in i grupp C.
Men några dagar senare drog sig Mauritius ur tävlingen och lämnade grupp B med bara två lag. En omlottning genomfördes sedan den 29 november, med åtta lag som drogs in i två grupper om fyra lag. Vinnarna och tvåan i varje grupp gick vidare till semifinal.