Ödeskartläggning

Exempel på en ödeskarta.

Fate mapping är en metod som används inom utvecklingsbiologin för att studera embryonalt ursprung hos olika vuxna vävnader och strukturer. "Ödet" för varje cell eller grupp av celler kartläggs på embryot, vilket visar vilka delar av embryot som kommer att utvecklas till vilken vävnad. När den utförs med encellsupplösning kallas denna process spårning av cellhärkomst . Det används också för att spåra utvecklingen av tumörer .

Historia

De tidigaste ödeskartorna baserades på direkt observation av embryon från ascidianer eller andra marina ryggradslösa djur. Modern ödeskartläggning började 1929 när Walter Vogt markerade cellgrupperna med hjälp av ett färgat agarchips och spårade dem genom gastrulation . 1978 pepparrotsperoxidas (HRP) som markör. HRP var effektivare än tidigare markörer, men krävde att embryon fixerades före visning. Genetisk ödeskartläggning är en teknik som utvecklades 1981 och som använder ett platsspecifikt rekombinas för att spåra cellhärkomst genetiskt. Idag är ödeskartläggning ett viktigt verktyg inom många områden av biologisk forskning, såsom utvecklingsbiologi, stamcellsforskning och njurforskning .

Cell härstamning

Den fullständiga cellinjen av C. elegans .

Ödeskartläggning och cellhärstamning är liknande men distinkta ämnen, även om det ofta finns överlappning. Till exempel kan utvecklingen av den fullständiga celllinjen av C. elegans beskrivas som ödeskartorna för varje celldelning staplade hierarkiskt. Skillnaden mellan ämnena ligger i vilken typ av information som ingår. Ödeskartläggning visar vilka vävnader som kommer från vilken del av embryot vid ett visst utvecklingsstadium, medan cellhärstamning visar relationerna mellan celler vid varje delning. En cellinje kan användas för att generera en ödeskarta, och i fall som C. elegans används successiv ödeskartläggning för att utveckla en cellinje.

Metod

Ödeskartläggning åstadkoms genom att infoga ett ärftligt genetiskt märke i en cell. Vanligtvis är detta ett fluorescerande protein. Därför kommer alla avkommor till cellen att ha detta genetiska märke. Det kan också göras genom användning av molekylära streckkoder, som introduceras till cellen av retrovirus .

Se även

Bestämning av cellöde

externa länkar