WDR5

WDR5
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, BIG-3, CFAP89, SWD3, WD-repetitionsinnehållande protein 5, WD-repetitionsdomän 5
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

WD repeat-innehållande protein 5 är ett protein som hos människor kodas av WDR5 -genen .

Denna gen kodar för en medlem av WD-repetitionsproteinfamiljen. WD-upprepningar är minimalt konserverade regioner med cirka 40 aminosyror, typiskt omgivna av gly-his och trp-asp (GH-WD), vilket kan underlätta bildningen av heterotrimera eller multiproteinkomplex. Medlemmar av denna familj är involverade i en mängd olika cellulära processer, inklusive cellcykelprogression, signaltransduktion, apoptos och genreglering. Detta protein innehåller 7 WD-repetitioner. Alternativt har splitsade transkriptvarianter som kodar för samma protein identifierats.

Interaktioner

WDR5 har visats interagera med värdcellsfaktor C1 och MLL . Den interagerar också med det långa icke-kodande RNA HOTTIP och med lncRNA NeST. WDR5 är en nyckeldeterminant för MYC- rekrytering till kromatin

Vidare läsning

•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds-cDNA-sekvenser för människor och mus" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, et al. (2003). "Humant Sin3-deacetylas och trithorax-relaterat Set1/Ash2-histon H3-K4-metyltransferas binds samman selektivt av cellproliferationsfaktorn HCF-1" . Genes Dev . 17 (7): 896–911. doi : 10.1101/gad.252103 . PMC 196026 . PMID 12670868 .
•   Gori F, Demay MB (2004). "BIG-3, ett nytt WD-40-repetitionsprotein, uttrycks i den växande tillväxtplattan och påskyndar kondrocytdifferentiering in vitro" . Endokrinologi . 145 (3): 1050–4. doi : 10.1210/sv.2003-1314 . PMID 14657013 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, et al. (2004). "Leukemi proto-onkoprotein MLL bildar ett SET1-liknande histonmetyltransferaskomplex med menin för att reglera Hox-genuttrycket" . Mol. Cell. Biol . 24 (13): 5639–49. doi : 10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004 . PMC 480881 . PMID 15199122 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, et al. (2005). "Nukleolär proteomdynamik". Naturen . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
•    Wysocka J, Swigut T, Milne TA, et al. (2005). "WDR5 associerar med histon H3 metylerad vid K4 och är avgörande för H3 K4-metylering och utveckling av ryggradsdjur" . Cell . 121 (6): 859–72. doi : 10.1016/j.cell.2005.03.036 . PMID 15960974 . S2CID 17521631 .
•    Dou Y, Milne TA, Tackett AJ, et al. (2005). "Fysisk association och koordinatfunktion av H3 K4 metyltransferas MLL1 och H4 K16 acetyltransferas MOF" . Cell . 121 (6): 873–85. doi : 10.1016/j.cell.2005.04.031 . PMID 15960975 . S2CID 14717470 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Mot en karta i proteomskala över det mänskliga protein-proteininteraktionsnätverket". Naturen . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•   Gori F, Friedman L, Demay MB (2006). "Wdr5, ett nytt WD-repetitionsprotein, reglerar osteoblast- och kondrocytdifferentiering in vivo". Journal of Musculoskeletal & Neuronal Interactions . 5 (4): 338–9. PMID 16340128 .
•    Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). "Ett protein-proteininteraktionsnätverk för mänskliga ärftliga ataxier och störningar av Purkinje-celldegeneration" . Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
•    Ruthenburg AJ, Wang W, Graybosch DM, et al. (2006). "Histone H3-igenkänning och presentation av WDR5-modulen i MLL1-komplexet" . Nat. Struktur. Mol. Biol . 13 (8): 704–12. doi : 10.1038/nsmb1119 . PMC 4698793 . PMID 16829959 .
•    Couture JF, Collazo E, Trievel RC (2006). "Molekylär igenkänning av histon H3 av WD40-proteinet WDR5". Nat. Struktur. Mol. Biol . 13 (8): 698–703. doi : 10.1038/nsmb1116 . PMID 16829960 . S2CID 26165068 .
•    Dou Y, Milne TA, Ruthenburg AJ, et al. (2006). "Reglering av MLL1 H3K4-metyltransferasaktivitet genom dess kärnkomponenter". Nat. Struktur. Mol. Biol . 13 (8): 713–9. doi : 10.1038/nsmb1128 . PMID 16878130 . S2CID 12849159 .
•    Schuetz A, Allali-Hassani A, Martín F, et al. (2006). "Strukturell grund för molekylär igenkänning och presentation av histon H3 av WDR5" . EMBO J . 25 (18): 4245–52. doi : 10.1038/sj.emboj.7601316 . PMC 1570438 . PMID 16946699 .
•    Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
•    Bryan AF, Wang J, Howard GC, et al. (2020). "WDR5 är en konserverad regulator av genuttryck för proteinsyntes" . Nukleinsyraforskning . 48 (6): 2924–2941. doi : 10.1093/nar/gkaa051 . PMC 7102967 . PMID 31996893 .