VPS4B

VPS4B
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, SKD1, SKD1B, VPS4-2, MIG1, vakuolär proteinsortering 4 homolog B
Externa ID: n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Vakuolärt proteinsorteringsassocierat protein 4B är ett protein som hos människor kodas av VPS4B -genen .

Proteinet som kodas av denna gen är en medlem av AAA- proteinfamiljen (ATPaser associerade med olika cellulära aktiviteter), och är homologen av jäst Vps4-proteinet.

Hos människor har två paraloger av jästproteinet identifierats. De delar en hög grad av aminosyrasekvenslikhet med varandra, och även med jäst Vps4 och musproteiner. Funktionella studier indikerar att båda humana paraloger associerar med de endosomala avdelningarna och är involverade i intracellulär proteinhandel, liknande Vps4-protein i jäst. Genen som kodar för denna paralog har kartlagts till kromosom 18 ; genen för den andra ( VPS4A ) finns på kromosom 16 .

Vidare läsning

•    Périer F, Coulter KL, Liang H, et al. (1994). "Identifiering av en ny däggdjursmedlem av familjen NSF/CDC48p/Pas1p/TBP-1 genom heterologt uttryck i jäst" . FEBS Lett . 351 (2): 286–90. doi : 10.1016/0014-5793(94)00879-5 . PMID 8082782 . S2CID 31778093 .
•    Mao M, Fu G, Wu JS, et al. (1998). "Identifiering av gener som uttrycks i humana CD34+ hematopoetiska stam-/progenitorceller genom uttryckta sekvenstaggar och effektiv cDNA-kloning i full längd" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (14): 8175–80. Bibcode : 1998PNAS...95.8175M . doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID 9653160 .
•   Scheuring S, Bodor O, Röhricht RA, et al. (1999). "Kloning, karakterisering och funktionellt uttryck av Mus musculus SKD1-genen i jäst visar att mus-SKD1- och jäst-VPS4-generna är ortologer och involverade i intracellulär proteinhandel". Gene . 234 (1): 149–59. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00163-8 . PMID 10393249 .
•    Biskop N, Woodman P (2000). "ATPas-defekt däggdjurs VPS4 lokaliseras till avvikande endosomer och försämrar kolesterolhandel" . Mol. Biol. Cell . 11 (1): 227–39. doi : 10.1091/mbc.11.1.227 . PMC 14770 . PMID 10637304 .
•    Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Klonning och funktionell analys av cDNA med öppna läsramar för 300 tidigare odefinierade gener uttryckta i CD34+ hematopoetiska stam-/föräldrarceller" . Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
•   Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (2002). "CHMP1 fungerar som en medlem av en nyligen definierad familj av vesikelhandelsproteiner". J. Cell Sci . 114 (Pt 13): 2395–404. doi : 10.1242/jcs.114.13.2395 . PMID 11559748 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Beyer A, Scheuring S, Müller S, et al. (2003). "Jämförande sekvens- och uttrycksanalyser av fyra däggdjurs-VPS4-gener". Gene . 305 (1): 47–59. doi : 10.1016/S0378-1119(02)01205-2 . PMID 12594041 .
•    Strack B, Calistri A, Craig S, et al. (2003). "AIP1/ALIX är en bindande partner för HIV-1 p6 och EIAV p9 som fungerar i virusknoppning" . Cell . 114 (6): 689–99. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00653-6 . PMID 14505569 . S2CID 10733770 .
•    von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B, et al. (2003). "Proteinnätverket för HIV-spirande" . Cell . 114 (6): 701–13. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00714-1 . PMID 14505570 . S2CID 16894972 .
•   Fujita H, Umezuki Y, Imamura K, et al. (2005). "Vps-proteiner från däggdjursklass E, SBP1 och mVps2/CHMP2A, interagerar med och reglerar funktionen hos en AAA-ATPas SKD1/Vps4B" . J. Cell Sci . 117 (Pt 14): 2997–3009. doi : 10.1242/jcs.01170 . PMID 15173323 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Katoh K, Suzuki H, Terasawa Y, et al. (2006). "Penta-EF-handproteinet ALG-2 interagerar direkt med ESCRT-I-komponenten TSG101, och Ca2+-beroende samlokaliseras till avvikande endosomer med dominant-negativ AAA ATPase SKD1/Vps4B" . Biochem. J . 391 (Pt 3): 677–85. doi : 10.1042/BJ20050398 . PMC 1276969 . PMID 16004603 .
•   Takasu H, Jee JG, Ohno A, et al. (2005). "Strukturell karakterisering av MIT-domänen från mänsklig Vps4b". Biochem. Biophys. Res. Commun . 334 (2): 460–5. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.06.110 . PMID 16018968 .
•    Scott A, Chung HY, Gonciarz-Swiatek M, et al. (2005). "Strukturella och mekanistiska studier av VPS4-proteiner" . EMBO J . 24 (20): 3658–69. doi : 10.1038/sj.emboj.7600818 . PMC 1276703 . PMID 16193069 .
•    Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener" . Genome Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
•   Welsch S, Habermann A, Jäger S, et al. (2007). "Ultrastrukturell analys av ESCRT-proteiner tyder på en roll för endosomassocierade tubulära-vesikulära membran i ESCRT-funktion. " Trafik . 7 (11): 1551–66. doi : 10.1111/j.1600-0854.2006.00489.x . PMID 17014699 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
•    Lambert C, Döring T, Prange R (2007). "Mognad av hepatit B-virus är känslig för funktionell hämning av ESCRT-III, Vps4 och γ2-Adaptin" . J. Virol . 81 (17): 9050–60. doi : 10.1128/JVI.00479-07 . PMC 1951427 . PMID 17553870 .