Thiodictyon
| Thiodictyon | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Pseudomonadota |
| Klass: | Gammaproteobakterier |
| Beställa: | Chromatiales |
| Familj: | Chromatiaceae |
| Släkte: |
Thiodictyon Sergei Winogradsky 1888 |
| Arter | |
|
|
Thiodictyon är ett släkte av gramnegativa bakterier klassificerade inom lila svavelbakterier ( PSB).
- T. elegans bildar "nätliknande aggregat under vissa odlingsförhållanden." Det är obligatoriskt fototrofiskt och strikt anaerobt.
- T. bacillosum bildar inte nätliknande aggregat, bara klumpar.
- " Ca. T. syntrophicum" växer bäst under mikrooxiska och svaga ljusförhållanden. Det har bara skett en framgångsrik anrikning av " Ca. T. syntrophicum"; " Ca.T. syntrophicum"-stam Cad16T .
- " Ca. T. intracellulare " rapporteras 2021 som en symbiont av Pseudoblepharisma tenue . Den har förlorat en stor del av sitt genom inklusive kända gener för svaveldissimilering, men den återstående sekvensen placerar den ganska nära " Ca. T. syntrophicum".
Klassificering
Thiodictyon tillhör familjen Chromatiaceae och klass Gammaproteobacteria. " Ca. T. syntrophicum" är känt för att vara släkt med släktena Lamprocystis , Thiocystis och Thiocapsa. Stam Cad16 T tilldelades tidigare till släktet Lamprocystis , men omfördelades nyligen till släktet Thiodictyon av Peduzzi et al. Matrix-assisterad laserdesorption/joniseringstid för flygmasspektrometri ( MALDI -TOF MS) användes för att separera Cad16 T från Lamprocystis på grund av skillnader i cellmorfologi/arrangemang, caretenoidgrupper och kemolitotrofisk tillväxt; som alla är viktiga faktorer som används för att betrakta Cad16 T som en medlem av släktet Thiodictyon snarare än släktet Lamprocystis .
Genetik
16S rRNA från typstammarna av de två igenkända arterna har sekvenserats. De två föreslagna Candidatus -arterna har fått hela genomet sekvenserat. GTDB rapporterar att flera hela genom från metagenomiska prover, ännu inte namngivna, också är tillgängliga, samlade i tre ytterligare grupper på artnivå.
Stam Cad16 T
Cad16 T är en ny stam av " Ca. T. syntrophicum", som isolerades från kemoklinen i en krenogen meromiktisk sjö. 16S rRNA-gensekvensdata visar att Cad16 T är nära besläktat med Thiodictyon bacillosum DSM234 T (99,2 % sekvenslikhet) och Thiodictyon elegans DSM232 T (98,9 % sekvenslikhet).
Miljö
Cad16 T -stammen av " Ca. T. syntrophicum" isolerades från Lake Cadagno . Denna sjö är krenogen och meromiktisk , och dess lager skapar olika ekologiska nischer som stödjer tillväxten av olika och ofta nya arter. Lake Cadagno är euxinisk , vilket betyder att den är både anoxisk och sulfidisk på djupet. Dess kemoklin, som inträffar vid cirka 12 m, är ganska smal och har höga koncentrationer av sulfid, sulfat, syre och ljus. Ett grumlighetsmaximum korrelerar också med kemoklinen, och detta orsakas av höga koncentrationer av anaeroba fototrofa svavelbakterier.
Kolfixering
" Ca. T. syntrophicum"-stam Cad16 T har förmågan för CO 2 -fixering och visade sig spela en nyckelroll i den övergripande oorganiska kolfixeringen som inträffade i Lake Cadagno. Inom kemoklinen i Lake Cadagno var Cad16 T och ett annat isolat från sjön, CadA31 (en PSB), de två mest effektiva CO 2 -fixerande stammarna, och forskare fann att CO 2 -fixering skedde i både ljusa och mörka förhållanden. Emellertid var Cad16 T troligen den främsta bidragsgivaren till ljus och mörk kolfixering inom sjöns kemoklin, som Storelli et al. fann att denna stam assimilerade ungefär 25,9 % av allt hypotetiskt kol fixerat i kemoklinen.
Svavelcykling
Stam Cad16 T av " Ca. T. syntrophicum" är en art av PSB. Forskare upptäckte att stammen Cad16 T skapar och lagrar svavelkulor intracellulärt. De rena kulturerna av Cad16 T visade sig använda sulfid och elementärt svavel som sina elektrondonatorer.
Cad16 T är känt för att ha syntrofiska associationer och cell-till-cell-aggregation med Desulfocapsa sp. Desulfocapsa sp. är en sulfatreducerande och svaveloproportionerande bakterie som finns i både blandad kultur och i den naturliga miljön.