Terapeutiska måldatabas
 | |
| Innehåll | |
|---|---|
| Beskrivning | Drogmåldatabas |
| Kontakt | |
| Laboratorium | Innovative Drug Research and Bioinformatics Group (IDRB) Bioinformatics and Drug Design Group (BIDD) |
| Primärt citat | PMID 31691823 |
| Utgivningsdatum | 11 november 2019 |
| Tillgång | |
| Hemsida | http://db.idrblab.net/ttd/ |
| Diverse | |
| Licens | Fri tillgång |
| Version | 7.1.01 |
Therapeutic Target Database ( TTD ) är ett farmaceutiskt och medicinskt arkiv som konstruerats av Innovative Drug Research and Bioinformatics Group (IDRB) vid Zhejiang University, Kina och Bioinformatics and Drug Design Group vid National University of Singapore . Den ger information om kända och utforskade terapeutiska protein- och nukleinsyramål , den riktade sjukdomen, information om vägen och motsvarande läkemedel riktade mot vart och ett av dessa mål. Detaljerad kunskap om målfunktion, sekvens, 3D-struktur, ligandbindande egenskaper, enzymnomenklatur och läkemedelsstruktur, terapeutisk klass och klinisk utvecklingsstatus. TTD är fritt tillgängligt utan inloggningskrav.
Statistik
Denna databas innehåller för närvarande 3 419 terapeutiska mål (461 framgångsrika, 1 191 kliniska prövningar, 207 patenterade och 1 560 forskningsmål) och 37 316 läkemedel (2 649 godkända, 9 465 kliniska prövningar, 5 059 patenterade och 20 143 experimentella läkemedel). Målen och läkemedlen i TTD täcker 583 biokemiska proteinklasser respektive 958 läkemedelsterapeutiska klasser. Den senaste versionen av den internationella klassificeringen av sjukdomar (ICD-11) koder som släppts av WHO är inkorporerade i TTD för att underlätta en tydlig definition av sjukdoms-/sjukdomsklass.
Validering av primärt terapeutiskt mål
Målvalidering kräver normalt bestämning av att målet uttrycks i de sjukdomsrelevanta cellerna/vävnaderna, det kan moduleras direkt av ett läkemedel eller en läkemedelsliknande molekyl med tillräcklig styrka i biokemisk analys, och att målmodulering i cell och/eller djur modeller förbättrar den relevanta sjukdomsfenotypen. Därför samlar TTD in tre typer av målvalideringsdata:
- Experimentellt bestämd styrka av läkemedel mot deras primära mål eller mål.
- Uppenbar styrka eller effekter av läkemedel mot sjukdomsmodeller (cellinjer, ex-vivo, in-vivo-modeller) kopplade till deras primära mål eller mål.
- Observerade effekter av target knockout, knockdown, RNA-interferens, transgenetiska, antikropps- eller antisense-behandlade in vivo-modeller.
Mutations- och uttrycksprofil för mål
Omfattande ansträngningar har riktats mot upptäckt, undersökning och klinisk övervakning av riktade terapier. Dessa ansträngningar kan underlättas av den bekväma åtkomsten av de genetiska, proteomiska, interaktiva och andra aspekterna av de terapeutiska målen. De relaterade uppgifterna tillhandahålls i TTD:
- 2 000 läkemedelsresistensmutationer i 83 mål och 104 mål/läkemedelsreglerande gener.
- Differentiella uttrycksprofiler för 758 mål i den sjukdomsrelevanta läkemedelsinriktade vävnaden och de icke-riktade vävnaderna.
- 1 008 målkombinationer av 1 764 läkemedel och 1 604 målkombinationer av 664 flermålsläkemedel.
Klinisk prövning och patentskyddat mål
Ett ökande antal proteiner, nukleinsyror och andra molekylära enheter har utforskats som terapeutiska mål, av vilka hundratals är mål för godkända, kliniska prövningar och patentskyddade läkemedel. Kunskap om dessa mål och motsvarande läkemedel, särskilt de i klinisk användning, prövningar och patenterade, är mycket användbar för att underlätta upptäckt av läkemedel. Den senaste versionen av TTD gav:
- Kliniska prövningsmedel och deras mål tillsammans med deras strukturer och experimentella aktivitetsvärden.
- Patenterade medel och deras mål tillsammans med deras strukturer och experimentella aktivitetsvärden.
Regulator och signalväg för målet
Kunskap om terapeutiska mål och tidiga läkemedelskandidater är användbar för förbättrad läkemedelsupptäckt. Speciellt kan data från målregulatorer och anslutna signalvägar underlätta forskningen om drogbarhet, systemfarmakologi, nya trender, molekylära landskap och utvecklingen av verktyg för läkemedelsupptäckt. Vissa transportörers databas tillhandahålls TTD är således utvecklad för att tillhandahålla sådan information om:
- Målreglerande mikroRNA och transkriptionsfaktorer och målinteragerande proteiner.
- Omfattande mål-vägpar som helt refereras av flera sökvägsdatabaser.
- Den bekväma åtkomsten av de multipla målen och läkemedlen är tvärbundna till var och en av dessa vägposter.