Tapasin

TAPBP
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, NGS17, TAPA, TPN, TPSN, TAP-bindande protein (tapasin), TAP-bindande protein
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

TAP-associerat glykoprotein , även känt som tapasin eller TAPBP , är ett protein som hos människor kodas av TAPBP -genen .

Fungera

TAPBP -genen kodar för ett transmembrant glykoprotein som förmedlar interaktion mellan nyligen sammansatta major histocompatibility complex ( MHC ) klass I -molekyler och transportören som är associerad med antigenbearbetning (TAP), som krävs för transport av antigena peptider över det endoplasmatiska retikulummembranet . Denna interaktion underlättar optimal peptidladdning på MHC klass I-molekylen. Upp till fyra komplex av MHC klass I och tapasin kan bindas till en enda TAP-molekyl. Tapasin innehåller ett C-terminalt dubbellysinmotiv (KKKAE) känt för att bibehålla membranproteiner i det endoplasmatiska retikulum. Hos människor ligger tapasingenen inom det stora histokompatibilitetskomplexet på kromosom 6. Alternativ splitsning resulterar i tre transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Tapasin är en MHC klass I antigenbearbetande molekyl som finns i lumen av det endoplasmatiska retikulum . Det spelar en viktig roll i mognaden av MHC klass I-molekyler i ER-lumen. Tapasin är en komponent i det peptidladdande komplexet och kan hittas associerat med MHC klass I-molekyler efter att MHC klass I tunga kedjan har associerats med Beta ₂ -mikroglobulin. Peptidladdningskomplexet består av TAP, tapasin, MHC klass I, calreticulin och ERp57. Tapasin rekryterar MHC klass I-molekyler till TAP-peptidtransportören och ökar också laddningen av MHC klass I med högaffinitetspeptider . Efter laddning av MHC klass I med en högaffinitetsligand försvinner interaktionen mellan tapasin och MHC klass I.

Interaktioner

Tapasin har visat sig interagera med:

HLA-A , och
TAP1

Se även

Transportör associerad med antigenbearbetning ("TAP")

Vidare läsning

Bailey A, Dalchau N, Carter R, Emmott S, Phillips A, Werner JM, Elliott T (oktober 2015). "Selektorfunktion för MHC I-molekyler bestäms av proteinplasticitet" . Vetenskapliga rapporter . 5 : 14928. Bibcode : 2015NatSR...514928B . doi : 10.1038/srep14928 . PMC 5224517 . PMID 26482009 .
Williams AP, Peh CA, Purcell AW, McCluskey J, Elliott T (april 2002). "Optimering av MHC klass I-peptidlasten är beroende av tapasin" . Immunitet . 16 (4): 509–20. doi : 10.1016/s1074-7613(02)00304-7 . PMID 11970875 .
Howarth M, Williams A, Tolstrup AB, Elliott T (augusti 2004). "Tapasin förbättrar MHC klass I-peptidpresentation enligt peptidhalveringstid" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (32): 11737–42. Bibcode : 2004PNAS..10111737H . doi : 10.1073/pnas.0306294101 . PMC 511045 . PMID 15286279 .
Schneeweiss C, Garstka M, Smith J, Hütt MT, Springer S (juni 2009). "Tapasins verkningsmekanism i peptidutbytet på MHC klass I-molekyler bestämd från kinetiksimuleringsstudier". Molecular Immunology . 46 (10): 2054–63. doi : 10.1016/j.molimm.2009.02.032 . PMID 19362740 .
Turnquist HR, Vargas SE, Schenk EL, McIlhaney MM, Reber AJ, Solheim JC (2002). "Gränssnittet mellan tapasin och MHC klass I: identifiering av aminosyrarester i båda proteinerna som påverkar deras interaktion". Immunologisk forskning . 25 (3): 261–9. doi : 10.1385/IR:25:3:261 . PMID 12018464 . S2CID 42534968 .
Momburg F, Tan P (oktober 2002). "Tapasin - slutstenen i laddningskomplexet som optimerar peptidbindning av MHC klass I-molekyler i det endoplasmatiska retikulumet". Molecular Immunology . 39 (3–4): 217–33. doi : 10.1016/S0161-5890(02)00103-7 . PMID 12200052 .
Dissemond J, Kothen T, Mörs J, Weimann TK, Lindeke A, Goos M, Wagner SN (juni 2003). "Nedreglering av tapasinuttryck i progressivt humant malignt melanom". Arkiv för dermatologisk forskning . 295 (2): 43–9. doi : 10.1007/s00403-003-0393-8 . PMID 12682852 . S2CID 6496902 .
Paulsson K, Wang P (juni 2003). "Chaperones och vikning av MHC klass I-molekyler i endoplasmatiska retikulum" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research . 1641 (1): 1–12. doi : 10.1016/S0167-4889(03)00048-X . PMID 12788224 .
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (april 1996). "En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek. Analytisk biokemi . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Sadasivan B, Lehner PJ, Ortmann B, Spies T, Cresswell P (augusti 1996). "Roller för kalretikulin och ett nytt glykoprotein, tapasin, i interaktionen mellan MHC klass I-molekyler med TAP" . Immunitet . 5 (2): 103–14. doi : 10.1016/S1074-7613(00)80487-2 . PMID 8769474 .
Lewis JW, Neisig A, Neefjes J, Elliott T (juli 1996). "Punktmutationer i alfa 2-domänen av HLA-A2.1 definierar en funktionellt relevant interaktion med TAP" . Aktuell biologi . 6 (7): 873–83. doi : 10.1016/S0960-9822(02)00611-5 . PMID 8805302 .
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (april 1997). "Storskalig sammanlänkning av cDNA-sekvensering" . Genomforskning . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Li S, Sjögren HO, Hellman U, Pettersson RF, Wang P (augusti 1997). "Kloning och funktionell karakterisering av en subenhet av transportören associerad med antigenbearbetning" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (16): 8708–13. Bibcode : 1997PNAS...94.8708L . doi : 10.1073/pnas.94.16.8708 . PMC 23091 . PMID 9238042 .
Ortmann B, Copeman J, Lehner PJ, Sadasivan B, Herberg JA, Grandea AG, Riddell SR, Tampé R, Spies T, Trowsdale J, Cresswell P (augusti 1997). "En kritisk roll för tapasin i sammansättningen och funktionen av multimera MHC klass I-TAP-komplex". Vetenskap . 277 (5330): 1306–9. doi : 10.1126/science.277.5330.1306 . PMID 9271576 .
Herberg JA, Sgouros J, Jones T, Copeman J, Humphray SJ, Sheer D, Cresswell P, Beck S, Trowsdale J (februari 1998). "Genomisk analys av Tapasingenen, belägen nära TAP-loci i MHC" . European Journal of Immunology . 28 (2): 459–67. doi : 10.1002/(SICI)1521-4141(199802)28:02<459::AID-IMMU459>3.0.CO;2-Z . PMID 9521053 .
Lindquist JA, Jensen ON, Mann M, Hämmerling GJ (april 1998). "ER-60, en chaperone med tiolberoende reduktasaktivitet involverad i MHC klass I-montering" . EMBO Journal . 17 (8): 2186–95. doi : 10.1093/emboj/17.8.2186 . PMC 1170563 . PMID 9545232 .
Herberg JA, Beck S, Trowsdale J (april 1998). "TAPASIN, DAXX, RGL2, HKE2 och fyra nya gener (BING 1, 3 till 5) bildar ett tätt kluster vid den centromera änden av MHC". Journal of Molecular Biology . 277 (4): 839–57. doi : 10.1006/jmbi.1998.1637 . PMID 9545376 .
Furukawa H, Kashiwase K, Yabe T, Ishikawa Y, Akaza T, Tadokoro K, Tohma S, Inoue T, Tokunaga K, Yamamoto K, Juji T (september 1998). "Polymorfism av TAPASIN och dess länkojämvikt med HLA klass II-gener i den japanska befolkningen". Vävnadsantigener . 52 (3): 279–81. doi : 10.1111/j.1399-0039.1998.tb03044.x . PMID 9802609 .
El Ouakfaoui S, Heitz D, Paquin R, Beaulieu AD (februari 1999). "Granulocyt-makrofagkolonistimulerande faktor modulerar tapasinuttryck i humana neutrofiler" . Journal of Leukocyte Biology . 65 (2): 205–10. doi : 10.1002/jlb.65.2.205 . PMID 10088603 . S2CID 31764268 .
Bangia N, Lehner PJ, Hughes EA, Surman M, Cresswell P (juni 1999). "Den N-terminala regionen av tapasin krävs för att stabilisera MHC klass I-laddningskomplexet" . European Journal of Immunology . 29 (6): 1858–70. doi : 10.1002/(SICI)1521-4141(199906)29:06<1858::AID-IMMU1858>3.0.CO;2-C . PMID 10382748 .
Knittler MR, Alberts P, Deverson EV, Howard JC (september 1999). "Nukleotidbindning av TAP förmedlar association med peptid och frisättning av sammansatta MHC klass I-molekyler" . Aktuell biologi . 9 (18): 999–1008. doi : 10.1016/S0960-9822(99)80448-5 . PMID 10508608 . S2CID 18539813 .
Li S, Paulsson KM, Chen S, Sjögren HO, Wang P (januari 2000). "Tapasin krävs för effektiv peptidbindning till transportör associerad med antigenbearbetning" . Journal of Biological Chemistry . 275 (3): 1581–6. doi : 10.1074/jbc.275.3.1581 . PMID 10636848 .
Tan P, Kropshofer H, Mandelboim O, Bulbuc N, Hämmerling GJ, Momburg F (februari 2002). "Rekrytering av MHC klass I-molekyler av tapasin till transportören associerad med antigenbearbetningsassocierat komplex är avgörande för optimal peptidladdning" . Journal of Immunology . 168 (4): 1950–60. doi : 10.4049/jimmunol.168.4.1950 . PMID 11823531 .
Mayer WE, Klein J (december 2001). "Är tapasin en modifierad Mhc klass I-molekyl?". Immunogenetik . 53 (9): 719–23. doi : 10.1007/s00251-001-0403-y . PMID 11862402 . S2CID 43163810 .

externa länkar

tapasin vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
PDBe-KB ger en översikt över all strukturinformation som finns tillgänglig i PDB för humant tapasin