TOM1
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, mål för myb1-membranhandelsprotein, IMD85
Externa ID:n
Wikidata
Target of Myb protein 1 är ett protein som hos människor kodas av TOM1 -genen .
Den specifika funktionen av denna gen har ännu inte fastställts, men den kan innebära translokation av tillväxtfaktorreceptorkomplex till lysosomen för nedbrytning. Denna gen är lokaliserad till 22q13.1, med HMOX1 och MCM5 distalt och HMG2L1 proximalt placerade.
Interaktioner
TOM1 har visat sig interagera med TOLLIP och ZFYVE16 .
Vidare läsning
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (1999). "DNA-sekvensen av human kromosom 22" . Naturen . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
Misra S, Beach BM, Hurley JH (2000). "Struktur av VHS-domänen för mänsklig Tom1 (mål för myb 1): insikter i interaktioner med proteiner och membran". Biokemi . 39 (37): 11282–90. doi : 10.1021/bi0013546 . PMID 10985773 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), en storskalig insats för att identifiera nya mänskliga utsöndrade och transmembranproteiner: en bioinformatisk bedömning" . Genome Res . 13 (10): 2265–70. doi : 10.1101/gr.1293003 . PMC 403697 . PMID 12975309 .
Yamakami M, Yoshimori T, Yokosawa H (2004). "Tom1, ett VHS-domäninnehållande protein, interagerar med tollip, ubiquitin och clathrin" . J. Biol. Chem . 278 (52): 52865–72. doi : 10.1074/jbc.M306740200 . PMID 14563850 .
Seet LF, Liu N, Hanson BJ, Hong W (2004). "Endofin rekryterar TOM1 till endosomer" . J. Biol. Chem . 279 (6): 4670–9. doi : 10.1074/jbc.M311228200 . PMID 14613930 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). "En genomannoteringsdriven metod för att klona det mänskliga ORFeome" . Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Seet LF, Hong W (2005). "Endofin rekryterar clathrin till tidiga endosomer via TOM1" . J. Cell Sci . 118 (Pt 3): 575–87. doi : 10.1242/jcs.01628 . PMID 15657082 .
Schmid EM, Ford MG, Burtey A, et al. (2007). "Roll av AP2 beta-appendage-hubben vid rekrytering av partners för clathrin-belagd vesikelmontering" . PLOS Biol . 4 (9): e262. doi : 10.1371/journal.pbio.0040262 . PMC 1540706 . PMID 16903783 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .
externa länkar
PDB galleri
1elk : VHS-domän av TOM1-protein från H. sapiens
1wrd : Kristallstruktur av Tom1 GAT-domän i komplex med ubiquitin