TIAL1

TIAL1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, TCBP, TIAR, TIA1 cytotoxiskt granul-associerat RNA-bindande protein-liknande 1, TIA1 cytotoxiskt granula-associerat RNA-bindande protein som 1
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Nukleolysin TIAR är ett protein som hos människor kodas av TIAL1 -genen .

Proteinet som kodas av denna gen är en medlem av en familj av RNA -bindande proteiner, har tre RNA-igenkänningsmotiv (RRM) och binder adenin- och uridinrika element i mRNA och pre-mRNA från ett brett spektrum av gener. Den reglerar olika aktiviteter inklusive translationell kontroll, splitsning och apoptos . Alternativa transkriptionella splitsningsvarianter, som kodar för olika isoformer , har karakteriserats. De olika isoformerna har visat sig fungera olika med avseende på post-transkriptionell tystnad.

Vidare läsning

Taupin JL, Tian Q, Kedersha N, et al. (1995). "Det RNA-bindande proteinet TIAR translokeras från kärnan till cytoplasman under Fas-medierad apoptotisk celldöd" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (5): 1629–33. Bibcode : 1995PNAS...92.1629T . doi : 10.1073/pnas.92.5.1629 . PMC 42573 . PMID 7533298 .
Dember LM, Kim ND, Liu KQ, Anderson P (1996). "Individuella RNA-igenkänningsmotiv av TIA-1 och TIAR har olika RNA-bindningsspecificiteter" . J. Biol. Chem . 271 (5): 2783–8. doi : 10.1074/jbc.271.5.2783 . PMID 8576255 .
Doi T, Minami T, Itoh M, et al. (1997). "En alternativ form av nukleolysin binder till ett T-kluster-DNA i ljuddämparelementet i trombocytfaktor 4-genen". Biochem. Biophys. Res. Commun . 235 (3): 625–30. doi : 10.1006/bbrc.1997.6817 . PMID 9207209 .
Jin K, Li W, Nagayama T, et al. (2000). "Uttrycket av det RNA-bindande proteinet TIAR ökar i neuroner efter ischemisk hjärnskada". J. Neurosci. Res . 59 (6): 767–74. doi : 10.1002/(SICI)1097-4547(20000315)59:6<767::AID-JNR9>3.0.CO;2-K . PMID 10700014 . S2CID 33671199 .
Le Guiner C, Lejeune F, Galiana D, et al. (2001). "TIA-1 och TIAR aktiverar splitsning av alternativa exoner med svaga 5'-splitsningsställen följt av en U-rik sträckning på sina egna pre-mRNA. " J. Biol. Chem . 276 (44): 40638–46. doi : 10.1074/jbc.M105642200 . PMID 11514562 .
Iseni F, Garcin D, Nishio M, et al. (2002). "Sendai virus trailer RNA binder TIAR, ett cellulärt protein involverat i virusinducerad apoptos" . EMBO J . 21 (19): 5141–50. doi : 10.1093/emboj/cdf513 . PMC 129035 . PMID 12356730 .
Li W, Li Y, Kedersha N, et al. (2002). "Cellproteinerna TIA-1 och TIAR interagerar med 3'-stamslingan av West Nile-virusets komplementära minussträngade RNA och underlättar virusreplikation" . J. Virol . 76 (23): 11989–2000. doi : 10.1128/JVI.76.23.11989-12000.2002 . PMC 136884 . PMID 12414941 .
Yu Q, Cok SJ, Zeng C, Morrison AR (2003). "Translationsrepression av humana matrismetalloproteinaser-13 genom en alternativt splitsad form av T-cellsbegränsat intracellulärt antigenrelaterat protein (TIAR)" . J. Biol. Chem . 278 (3): 1579–84. doi : 10.1074/jbc.M203526200 . PMID 12426321 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Le Guiner C, Gesnel MC, Breathnach R (2003). "TIA-1 eller TIAR krävs för DT40-cellviabilitet" . J. Biol. Chem . 278 (12): 10465–76. doi : 10.1074/jbc.M212378200 . PMID 12533540 .
Cok SJ, Acton SJ, Morrison AR (2003). "Den proximala regionen av den 3'-otranslaterade regionen av cyklooxygenas-2 känns igen av ett multimert proteinkomplex som innehåller HuR, TIA-1, TIAR och det heterogena nukleära ribonukleoproteinet U." J. Biol. Chem . 278 (38): 36157–62. doi : 10.1074/jbc.M302547200 . PMID 12855701 .
Zhu H, Hasman RA, Young KM, et al. (2003). "U1 snRNP-beroende funktion av TIAR i regleringen av alternativ RNA-bearbetning av humant kalcitonin/CGRP-pre-mRNA" . Mol. Cell. Biol . 23 (17): 5959–71. doi : 10.1128/MCB.23.17.5959-5971.2003 . PMC 180986 . PMID 12917321 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Shukla S, Dirksen WP, Joyce KM, et al. (2004). "TIA-proteiner är nödvändiga men inte tillräckliga för den vävnadsspecifika splitsningen av den myosinfosfatasinriktade subenhet 1" . J. Biol. Chem . 279 (14): 13668–76. doi : 10.1074/jbc.M314138200 . PMID 14736875 .
Esclatine A, Taddeo B, Roizman B (2004). "Herpes simplex virus 1 inducerar cytoplasmatisk ackumulering av TIA-1/TIAR och både syntes och cytoplasmatisk ackumulering av tristetraprolin, två cellulära proteiner som binder och destabiliserar AU-rika RNA. " J. Virol . 78 (16): 8582–92. doi : 10.1128/JVI.78.16.8582-8592.2004 . PMC 479066 . PMID 15280467 .
Hua Y, Zhou J (2004). "Motorneuronprotein för överlevnad underlättar montering av stressgranuler" . FEBS Lett . 572 (1–3): 69–74. doi : 10.1016/j.febslet.2004.07.010 . PMID 15304326 . S2CID 27599172 .
Suswam EA, Nabors LB, Huang Y, et al. (2005). "IL-1beta inducerar stabilisering av IL-8 mRNA i maligna bröstcancerceller via den 3' oöversatta regionen: Involvering av divergerande RNA-bindande faktorer HuR, KSRP och TIAR" . Int. J. Cancer . 113 (6): 911–9. doi : 10.1002/ijc.20675 . PMID 15514971 . S2CID 33272692 .
Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Suswam EA, Li YY, Mahtani H, King PH (2005). "Nya DNA-bindande egenskaper hos det RNA-bindande proteinet TIAR" . Nucleic Acids Res . 33 (14): 4507–18. doi : 10.1093/nar/gki763 . PMC 1184220 . PMID 16091628 .

externa länkar

Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q01085 (Nucleolysin TIAR) i PDBe-KB .