TARBP1

TARBP1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, TRM3, TRP-185, TRP185, TAR (HIV-1) RNA-bindande protein 1, TRMT3
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Troligt metyltransferas TARBP1 är ett enzym som hos människor kodas av TARBP1 -genen .

HIV-1 , det orsakande medlet för förvärvat immunbristsyndrom (AIDS), innehåller ett RNA- genom som producerar ett kromosomalt integrerat DNA under replikationscykeln. Aktivering av HIV-1-genexpression av transaktivatorn Tat är beroende av ett RNA-regulatoriskt element (TAR) beläget nedströms om transkriptionsinitieringsstället. Detta element bildar en stabil stam-loop-struktur och kan bindas av antingen proteinet som kodas av denna gen eller av RNA-polymeras II . Detta protein kan verka för att frigöra RNA-polymeras II från TAR under transkriptionell förlängning. Alternativt kan splitsade transkript av denna gen existera, men deras fullängdsnatur har inte fastställts.

Vidare läsning

•   Sheline CT, Milocco LH, Jones KA (1992). "Två distinkta nukleära transkriptionsfaktorer känner igen loop- och utbuktningsrester av HIV-1 TAR RNA-hårnålen" . Genes Dev . 5 (12B): 2508–20. doi : 10.1101/gad.5.12b.2508 . PMID 1752441 .
•    Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). "Specifik bindning av RNA-polymeras II till det transaktiverande området för humant immunbristvirus regleras av cellulära kofaktorer och Tat" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (16): 7153–7. Bibcode : 1995PNAS...92.7153W . doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . PMC 41297 . PMID 7638159 .
•   Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1996). "Identifiering av en grupp av cellulära kofaktorer som stimulerar bindningen av RNA-polymeras II och TRP-185 till humant immunbristvirus 1 TAR RNA" . J. Biol. Chem . 271 (8): 4201–8. doi : 10.1074/jbc.271.8.4201 . PMID 8626763 .
•    Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1996). "Den cellulära faktorn TRP-185 reglerar RNA-polymeras II-bindning till HIV-1 TAR-RNA" . EMBO J . 14 (23): 5995–6009. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00288.x . PMC 394719 . PMID 8846792 .
•   Yedavalli VS, Benkirane M, Jeang KT (2003). "Tat och transaktiveringsresponsiv (TAR) RNA-oberoende induktion av HIV-1 lång terminal upprepning av humant och murint cyklin T1 kräver Sp1" . J. Biol. Chem . 278 (8): 6404–10. doi : 10.1074/jbc.M209162200 . PMID 12458222 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•   Gregory SG, Barlow KF, McLay KE, et al. (2006). "DNA-sekvensen och den biologiska annoteringen av human kromosom 1" . Naturen . 441 (7091): 315–21. Bibcode : 2006Natur.441..315G . doi : 10.1038/nature04727 . PMID 16710414 .