TAF8

TAF8
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, 43, II, TAF, TAFII-43, TAFII43, TBN, TATA-box-bindande proteinassocierad faktor 8, TAF(II)43
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Transkriptionsinitieringsfaktor TFIID subenhet 8 är ett protein som hos människor kodas av TAF8 -genen .

Denna gen kodar för en av flera TATA-bindande protein (TBP)-associerade faktorer (TAF), som är integrerade subenheter av det allmänna transkriptionsfaktorkomplexet TFIID . TFIID känner igen kärnpromotorn för många gener och bildar sammansättningen av ett transkriptionspreinitieringskomplex innehållande RNA-polymeras II och andra initieringsfaktorer. Proteinet som kodas av denna gen innehåller en H4-liknande histonveckdomän och interagerar med flera subenheter av TFIID inklusive TBP och histonveckproteinet TAF10. Alternativt splitsade transkriptvarianter har beskrivits, men deras biologiska giltighet har inte fastställts.

Klinisk signifikans

Mutationer av TAF8-genen orsakar en neurodegenerativ störning som först beskrevs 2022 och presenteras som allvarlig psykomotorisk retardation med nästan frånvarande utveckling, ätproblem, mikrocefali , tillväxthämning , spasticitet och epilepsi .

Vidare läsning

•    Zhou Q, Sharp PA (1995). "Ny mekanism och faktor för reglering av HIV-1 Tat" . EMBO J . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
•   Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "En ny LBP-1-medierad restriktion av HIV-1-transkription på nivån av förlängning in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
•    Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Roll av flankerande E-box-motiv i humant immunbristvirus typ 1 TATA-elementfunktion" . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
•    Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, et al. (1994). "Direkt interaktion av human TFIID med HIV-1-transaktivatorn tat". Naturen . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . doi : 10.1038/367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
•   Wang Z, Morris GF, Rice AP, et al. (1996). "Vildtyps- och transaktiveringsdefekta mutanter av humant immunbristvirus typ 1 Tat-protein binder humant TATA-bindande protein in vitro". J. Acquir. Immunbrist. Syndr. Brum. Retrovirol . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
•    Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Mutationer i den karboxiterminala domänen av TBP påverkar syntesen av humant immunbristvirus typ 1 fullängds- och korta transkript på liknande sätt" . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
•    Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, et al. (1996). "Interaktion av humant immunbristvirus typ 1 Tat med en unik plats för TFIID hämmar negativ kofaktor Dr1 och stabiliserar TFIID-TFIIA-komplexet" . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
•    Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: kofaktor för stimulering av transkriptionell förlängning av HIV-1 Tat". Vetenskap . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
•   García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Association av Tat med renade HIV-1- och HIV-2-transkriptionsförinitieringskomplex" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
•   Purrello M, Di Pietro C, Viola A, et al. (1998). "Genomik och transkriptionsanalys av mänsklig TFIID" . Onkogen . 16 (12): 1633–8. doi : 10.1038/sj.onc.1201673 . PMID 9569032 .
•    Guermah M, Tao Y, Roeder RG (2001). "Positiva och negativa TAFII-funktioner som föreslår en dynamisk TFIID-struktur och framkallar synergi med TRAPs i aktivatorinducerad transkription" . Mol. Cell. Biol . 21 (20): 6882–94. doi : 10.1128/MCB.21.20.6882-6894.2001 . PMC 99865 . PMID 11564872 .
•   Tora L (2002). "En enhetlig nomenklatur för TATA-boxbindande protein (TBP)-associerade faktorer (TAF) involverade i RNA-polymeras II-transkription" . Genes Dev . 16 (6): 673–5. doi : 10.1101/gad.976402 . PMID 11963920 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Guermah M, Ge K, Chiang CM, Roeder RG (2003). "TBN-proteinet, som är väsentligt för tidig utveckling av embryonal mus, är en inducerbar TAFII som är inblandad i adipogenes" . Mol. Cell . 12 (4): 991–1001. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00396-4 . PMID 14580349 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Soutoglou E, Demény MA, Scheer E, et al. (2005). "Kärnkraftsimporten av TAF10 regleras av en av dess tre interaktionspartners innehållande histonfolddomän" . Mol. Cell. Biol . 25 (10): 4092–104. doi : 10.1128/MCB.25.10.4092-4104.2005 . PMC 1087738 . PMID 15870280 .