TAF6

TAF6
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, MGC:8964, TAF(II)70, TAF(II)80, TAF2E, TAFII-70, TAFII-80, TAFII70, TAFII80, TAFII85, TATA-box-bindande proteinassocierad faktor 6, ALYUS Externa
IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Transkriptionsinitieringsfaktor TFIID subenhet 6 är ett protein som hos människor kodas av TAF6 -genen .

Fungera

Initiering av transkription av RNA-polymeras II kräver aktiviteter av mer än 70 polypeptider. Proteinet som koordinerar dessa aktiviteter är transkriptionsfaktor IID (TFIID), som binder till kärnpromotorn för att positionera polymeraset på rätt sätt, fungerar som ställningen för sammansättning av resten av transkriptionskomplexet och fungerar som en kanal för regulatoriska signaler. TFIID består av det TATA-bindande proteinet (TBP) och en grupp av evolutionärt konserverade proteiner som kallas TBP-associerade faktorer eller TAF. TAF kan delta i basal transkription, fungera som koaktivatorer, fungera i promotorigenkänning eller modifiera allmänna transkriptionsfaktorer (GTFs) för att underlätta komplex sammansättning och transkriptionsinitiering. Denna gen kodar för en av de mindre subenheterna av TFIID som binder svagt till TBP men starkt till TAF1, den största subenheten av TFIID. Fyra isoformer har identifierats men fullständiga transkript har bestämts för endast tre isoformer. En av isoformerna har visat sig utesluta bindning av en av de andra TFIID-subenheterna, och därigenom minska transkriptionen och initiera signaler som utlöser apoptos.

Interaktioner

TAF6 har visat sig interagera med:

• TAF5 och
• TATA-bindande protein .

Vidare läsning

•    Klemm RD, Goodrich JA, Zhou S, Tjian R (1995). "Molekylär kloning och uttryck av 32-kDa-subenheten av human TFIID avslöjar interaktioner med VP16 och TFIIB som förmedlar transkriptionell aktivering" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (13): 5788–92. Bibcode : 1995PNAS...92.5788K . doi : 10.1073/pnas.92.13.5788 . PMC 41586 . PMID 7597030 .
•    Chen HI, Sudol M (1995). "WW-domänen för Yes-associerat protein binder en prolinrik ligand som skiljer sig från den konsensus som fastställts för Src-homologi 3-bindande moduler" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (17): 7819–23. Bibcode : 1995PNAS...92.7819C . doi : 10.1073/pnas.92.17.7819 . PMC 41237 . PMID 7644498 .
•    Hisatake K, Ohta T, Takada R, Guermah M, Horikoshi M, Nakatani Y, Roeder RG (1995). "Evolutionär bevarande av humana TATA-bindande polypeptid-associerade faktorer TAFII31 och TAFII80 och interaktioner av TAFII80 med andra TAF och med allmänna transkriptionsfaktorer" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (18): 8195–9. Bibcode : 1995PNAS...92.8195H . doi : 10.1073/pnas.92.18.8195 . PMC 41123 . PMID 7667268 .
•    Zhou Q, Sharp PA (1995). "Ny mekanism och faktor för reglering av HIV-1 Tat" . EMBO J . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
•   Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "En ny LBP-1-medierad restriktion av HIV-1-transkription på nivån av förlängning in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
•    Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Roll av flankerande E-box-motiv i humant immunbristvirus typ 1 TATA-elementfunktion" . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
•    Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Direkt interaktion av human TFIID med HIV-1-transaktivatorn tat". Naturen . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . doi : 10.1038/367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
•   Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). "Vildtyps- och transaktiveringsdefekta mutanter av humant immunbristvirus typ 1 Tat-protein binder humant TATA-bindande protein in vitro". J. Acquir. Immunbrist. Syndr. Brum. Retrovirol . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
•    Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Mutationer i den karboxiterminala domänen av TBP påverkar syntesen av humant immunbristvirus typ 1 fullängds- och korta transkript på liknande sätt" . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
•    Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "Interaktion av humant immunbristvirus typ 1 Tat med en unik plats för TFIID hämmar negativ kofaktor Dr1 och stabiliserar TFIID-TFIIA-komplexet" . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
•    Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: kofaktor för stimulering av transkriptionell förlängning av HIV-1 Tat". Vetenskap . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
•   Tao Y, Guermah M, Martinez E, Oelgeschläger T, Hasegawa S, Takada R, Yamamoto T, Horikoshi M, Roeder RG (1997). "Specifika interaktioner och potentiella funktioner hos mänsklig TAFII100" . J. Biol. Chem . 272 (10): 6714–21. doi : 10.1074/jbc.272.10.6714 . PMID 9045704 .
•   García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Association av Tat med renade HIV-1- och HIV-2-transkriptionsförinitieringskomplex" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
•    Mahanta SK, Scholl T, Yang FC, Strominger JL (1997). "Transaktivering av CIITA, den typ II nakna lymfocytsyndrom-associerade faktorn, kräver deltagande av flera regioner av det TATA-boxbindande proteinet" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (12): 6324–9. Bibcode : 1997PNAS...94.6324M . doi : 10.1073/pnas.94.12.6324 . PMC 21048 . PMID 9177216 .
•    Guermah M, Malik S, Roeder RG (1998). "Involvering av TFIID och USA-komponenter i transkriptionell aktivering av den humana immunbristviruspromotorn av NF-kappaB och Sp1" . Mol. Cell. Biol . 18 (6): 3234–44. doi : 10.1128/mcb.18.6.3234 . PMC 108905 . PMID 9584164 .
•    Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (2001). "UV-skadat DNA-bindande protein i TFTC-komplexet kopplar DNA-skada igenkänning till nukleosomacetylering" . EMBO J . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
•    Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, Lymar ES, Gamper AM, Kundu TK, Chait BT, Roeder RG (2001). "Humant STAGA-komplex är en kromatinacetylerande transkriptionskoaktivator som interagerar med pre-mRNA-splitsning och DNA-skadabindande faktorer in vivo" . Mol. Cell. Biol . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
•   Bell B, Scheer E, Tora L (2001). "Identifiering av hTAF(II)80 delta länkar apoptotiska signalvägar till transkriptionsfaktorns TFIID-funktion" . Mol. Cell . 8 (3): 591–600. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00325-2 . PMID 11583621 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P49848 (Transcription initiation factor TFIID subunit 6) på PDBe-KB .