SurE, överlevnadsprotein E
| SurE | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kristallstruktur av SurE-protein från T.maritima i komplex med volframat.
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Säker | ||||||||
| Pfam | PF01975 | ||||||||
| InterPro | IPR002828 | ||||||||
| SCOP2 | 1j9l / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi hänvisar proteindomänen surE till överlevnadsprotein E. Man fann ursprungligen att celler som inte innehöll detta protein inte kunde överleva i den stationära fasen , vid temperaturer över normala och i högsaltmedier. Därav namnet, överlevnadsprotein E. Det är ett metalljonberoende fosfatas som finns i bakterier och eukaryoter . Det är ett viktigt stressresponsprotein . Denna domän finns i sura fosfataser ( EC ), 5'-nukleotidaser ( EC ), 3'-nukleotidaser ( EC ) och exopolyfosfataser ( EC ).
Interaktion med pcm-genen
Genen , surE , är en del av en bicistronisk operon som finns uppströms om pcm -genen. När de är muterade är deras fenotyper , eller fysiska egenskaper, mycket lika och indikerar att båda genprodukterna är viktiga för överlevnad under stressiga förhållanden.
Fungera
Den C-terminala domänen är viktig främst för att upprätthålla det oligomera tillståndet hos proteinet, SurE. Den N-terminala domänen anses vara en del av den funktionella domänen. Eftersom SurE är ett fosfatasenzym tar det bort en fosfatgrupp från ett ämne, vilket påverkar ämnets roll i signaltransduktion .
Strukturera
Detta protein består av två proteindomäner . Den ena är en stor, globulär N-terminal domän och den andra är en mindre C-terminal domän.
N-terminal domän
Den N-terminala domänen innehåller en trelagers alfa/beta/alfa-sandwich som är homolog med Rossmann-vecket (CATH-klass 3.40.50.170) vars huvuddrag är ett långt beta-ark som består av nio mestadels parallella betasträngar . SurE strukturella domän har en liknande topologi som den N-terminala proteindomänen i glutaminas / asparaginasfamiljen .
C-terminal domän
Den C-terminala domänen har 3 beta-strängar och två utsprång; varav en är en C-terminal alfahelix och den andra är en beta-hårnål .