Stjärnaktivitet

Stjärnaktivitet är relaxeringen eller förändringen av specificiteten för restriktionsenzymmedierad klyvning av DNA som kan ske under reaktionsbetingelser som skiljer sig väsentligt från de optimala för enzymet. Resultatet är typiskt klyvning vid icke-kanoniska igenkänningsställen, eller ibland fullständig förlust av specificitet.

Skillnader som kan leda till stjärna inkluderar låg jonstyrka , högt pH och höga (> 5 % v/v) glycerolkoncentrationer . Det senare tillståndet är av särskilt praktiskt intresse, eftersom kommersiella restriktionsenzymer vanligtvis tillhandahålls i en buffert som innehåller en betydande mängd glycerol (50 % v/v är typiskt), vilket betyder att otillräcklig utspädning av enzymlösningen kan orsaka stjärnaktivitet; detta problem uppstår oftast under dubbla eller multipla smältningar. Stjärnaktivitet kan uppstå på grund av närvaron av Mg2 ^{+ , som} till exempel kan ses i Hindlll .

Termen stjärnaktivitet introducerades av Mayer som karakteriserade den modifierade aktiviteten i EcoRI .

externa länkar

• Star Activity - New England Biolabs
• Star Activity (Relaxation of Specificity) - Fermentas
• Stjärnaktivitet av restriktionsenzymer - en detaljerad lista från TaKaRa
•    Wei, H; Therrien, C; Blanchard, A; Guan, S; Zhu, Z (2008). "Fidelity Index ger en systematisk kvantifiering av stjärnaktivitet för DNA-restriktionsendonukleaser" . Nukleinsyraforskning . 36 (9): e50. doi : 10.1093/nar/gkn182 . PMC 2396408 . PMID 18413342 .