Sterolavkännande domän
En sterolavkännande domän ( SSD ) är en proteindomän som består av 180 aminosyror som bildar fem transmembransegment som kan binda sterolgrupper . Denna typ av domän finns i proteiner involverade i kolesterolmetabolism och signalering.
Fungera
Sterolavkännande domäner finns i olika proteiner involverade i nyckelaspekter av kolesterolhomeostas och signalering. Flera sekvensanpassningar med Clustal W har visat att dessa proteiner kan grupperas i sju olika familjer enligt deras SSD. Följande SSD-innehållande proteiner representerar varje familj:
- HMG-CoA-reduktas (HMGCR), involverat i biosyntesen av kolesterol. Detta var det första proteinet med en SSD som upptäcktes. Vid bindning till kolesterol genomgår detta protein endoplasmatisk-retikulum-associerad proteinnedbrytning . SSD krävs inte för den katalytiska aktiviteten av HMGCR.
- SREBP-klyvningsaktiverande protein (SCAP), som reglerar transkription av gener med sterolresponselement genom att proteolytiskt aktivera sterolregulatoriska elementbindande proteiner (SREBP). Detta var det andra SSD-innehållande proteinet som upptäcktes.
- 7-dehydrokolesterolreduktas (7DHCR), involverat i det sista steget av kolesterolbiosyntesen.
-
Niemann-Pick typ C1 (NPC1), involverad i intracellulär kolesteroltransport.
- Niemann-Pick typ C1-liknande 1 (NPC1L1), en regulator av kolesterolabsorption i enterocyter .
- Patched ( PTCH1 , PTCH2 ), involverad i hedgehog-signalvägen och även cytokines. Dess SSD binder kolesteroldelen i igelkotten, och det är viktigt för dess aktivitet.
- Utsänd (DISP1, DISP2, DISP3), även involverad i igelkottssignalering. DISP krävs för utsöndring av igelkott.
- Patched-relaterat protein (PTR), strukturellt likt patched. Dess funktioner är inte helt klarlagda.
Sjukdom
Mutationer i 7DHCR är kopplade till Smith–Lemli–Opitz syndrom ( SLOS). Mutationer i NPC1 har visat sig orsaka Niemann-Pick sjukdom, typ C. Mutationer i patched är associerade med en mängd olika cancerformer ( basalcellscancer , medulloblastom , rabdomyosarkom ).