Squamosa-promotorbindande protein

SBP
PDB 1ul4 EBI.jpg
-lösningsstruktur för den DNA-bindande domänen av Squamosa-promotorbindande proteinliknande 4
identifierare
Symbol SBP
Pfam PF03110
InterPro IPR004333
PROSITE PDOC00798
SCOP2 2lao / SCOPe / SUPFAM
TCDB 3.A.1
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Den SQUAMOSA-promotorbindande proteinliknande ( SBP eller SPL ) familjen av transkriptionsfaktorer definieras av en växtspecifik DNA-bindande domän . Den grundande medlemmen av familjen identifierades baserat på dess specifika in vitro -bindning till promotorn av snapdragon SQUAMOSA-genen. SBP-proteiner tros vara transkriptionella aktivatorer.

Fungera

SPB-proteiner har roller i bladutveckling, vegetativ fasförändring , blom- och fruktutveckling, växtarkitektur, sporogenes, gibberelsyrasignalering och toxinsvar.

Strukturera

Domänen innehåller 10 konserverade cystein- och histidinrester som troligen är zinkligander . SBP-domänen är en mycket konserverad DNA-bindande domän. Den är cirka 80 aminosyror lång och innehåller ett zinkfingermotiv med två zinkbindningsställen: Cys-Cys-His-Cys och Cys-Cys-Cys-His . Den har ett tresträngat antiparallellt beta-ark .

externa länkar

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR004333