Spondin 1

SPON1
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, VSGP/F-spondin, f-spondin, Spondin 1
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ; ; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Spondin-1 (även känt som F-spondin) är ett protein som hos människor kodas av SPON1 -genen . Det utsöndras av celler på golvplattan och kan vara involverat i axonstyrning. Proteinet innehåller 807 aminosyror och är strukturellt sammansatt av sex trombospondindomäner , en reelindomän och en spondindomän.

Vidare läsning

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H (2003). "Konstruktion av expressionsfärdiga cDNA-kloner för KIAA-gener: manuell kuration av 330 KIAA-cDNA-kloner" . DNA Res . 9 (3): 99–106. doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .
Klar A, Baldassare M, Jessell TM (1992). "F-spondin: en gen som uttrycks i höga nivåer i golvplattan kodar för ett utsöndrat protein som främjar neural cellvidhäftning och neuritförlängning". Cell . 69 (1): 95–110. doi : 10.1016/0092-8674(92)90121-R . PMID 1555244 . S2CID 14880785 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalisering och subtraktion: två metoder för att underlätta genupptäckt" . Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Miyamoto K, Morishita Y, Yamazaki M (2001). "Isolering och karakterisering av tillväxtbefrämjande faktor för vaskulär glatt muskelcell från bovin ovariefollikulär vätska och dess cDNA-kloning från bovina och mänskliga äggstockar". Båge. Biochem. Biofys . 390 (1): 93–100. doi : 10.1006/abbi.2001.2367 . PMID 11368520 .
Gonzalez de Peredo A, Klein D, Macek B (2002). "C-mannosylering och o-fukosylering av trombospondin typ 1 upprepningar" . Mol. Cell. Proteomik . 1 (1): 11–8. doi : 10.1074/mcp.M100011-MCP200 . PMID 12096136 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 humana cDNAs i full längd" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Ho A, Südhof TC (2004). "Bindning av F-spondin till amyloid-beta-prekursorprotein: en kandidatligand för amyloid-beta-prekursorprotein som modulerar amyloid-beta-prekursorproteinklyvning" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (8): 2548–53. Bibcode : 2004PNAS..101.2548H . doi : 10.1073/pnas.0308655100 . PMC 356987 . PMID 14983046 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Pyle-Chenault RA, Stolk JA, Molesh DA (2005). "VSGP/F-spondin: en ny äggstockscancermarkör". Tumör Biol . 26 (5): 245–57. doi : 10.1159/000087379 . PMID 16103746 . S2CID 13409234 .
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T (2007). "Signalsekvens och nyckelordsfälla i silico för urval av fullängds humana cDNA som kodar för sekretion eller membranproteiner från oligokapslade cDNA-bibliotek" . DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
Kitagawa M, Kudo Y, Iizuka S (2006). "Effekt av F-spondin på cementoblastisk differentiering av mänskliga parodontala ligamentceller" ( PDF) . Biochem. Biophys. Res. Commun . 349 (3): 1050–6. doi : 10.1016/j.bbrc.2006.08.142 . PMID 16965763 .

externa länkar

Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q9HCB6 (Spondin-1) i PDBe-KB .