Shotgun lipidomics
Inom lipidomics använder processen av shotgun lipidomics (som kallas i analogi med shotgun-sekvensering ) analytisk kemi för att undersöka den biologiska funktionen, betydelsen och följderna av förändringar i lipider och proteinbeståndsdelar som förmedlar lipidmetabolism, trafficking eller biologisk funktion i celler. Lipidomics har underlättats avsevärt av de senaste framstegen inom och nya tillämpningar av elektrosprayjoniseringsmasspektrometri ( ESI/MS) .
Lipidomics är ett forskningsfält som studerar cellulära lipiders vägar och nätverk i biologiska system (dvs lipidomer) i stor skala. Det involverar identifiering och kvantifiering av de tusentals cellulära lipidmolekylarterna och deras interaktioner med andra lipider, proteiner och andra delar in vivo. Utredare i lipidomik undersöker strukturerna, funktionerna, interaktionerna och dynamiken hos cellulära lipider och de dynamiska förändringar som uppstår under patofysiologiska störningar. Lipidomiska studier spelar en viktig roll för att definiera de biokemiska mekanismerna för lipidrelaterade sjukdomsprocesser genom att identifiera förändringar i cellulär lipidmetabolism, trafficking och homeostas. De två stora plattformarna som för närvarande används för lipidomanalyser är HPLC-MS och shotgun lipidomics.
Historia
Shotgun lipidomics utvecklades av Richard W. Gross och Xianlin Han, genom att använda ESI intrasource separation tekniker. Individuella molekylarter av de flesta större och många mindre lipidklasser kan tas med fingeravtryck och kvantifieras direkt från biologiska lipidextrakt utan behov av kromatografisk rening.
Fördelar
Shotgun lipidomics är snabb, mycket känslig, och den kan identifiera hundratals lipider som missats av andra metoder - alla med ett mycket mindre vävnadsprov så att specifika celler eller små biopsiprover kan undersökas.
Vidare läsning
- Gunning för fetter
- Gross RW, Han X (2007). "Lipidomics vid diabetes och det metabola syndromet". Meth. Enzymol . Metoder inom enzymologi. 433 : 73–90. doi : 10.1016/S0076-6879(07)33004-8 . ISBN 9780123739667 . PMID 17954229 .
- Han X, Yang J, Cheng H, Ye H, Gross RW (juli 2004). "Mot fingeravtryck av cellulära lipidomer direkt från biologiska prover genom tvådimensionell elektrosprayjoniseringsmasspektrometri". Anal. Biochem . 330 (2): 317–31. doi : 10.1016/j.ab.2004.04.004 . PMID 15203339 .