SYVN1

SYVN1-
identifierare
	, DER3, HRD1, synoviolin 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	n/a
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

E3 ubiquitin-proteinligas synoviolin är ett enzym som hos människor kodas av SYVN1 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för ett protein involverat i endoplasmatiskt retikulum (ER)-associerad nedbrytning. Det kodade proteinet tar bort oveckade proteiner, ackumulerade under ER-stress , genom retrograd transport till cytosolen från ER. Detta protein använder också ubiquitin-proteasomsystemet för ytterligare nedbrytning av ovikta proteiner. Denna gen och det mitokondriella ribosomala proteinet L49-genen använder i sina respektive 3' UTR:er en del av samma genomiska sekvens. Sekvensanalys identifierade två transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Vidare läsning

Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (september 2000). "Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering" . EMBO-rapporter . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Nagase T, Nakayama M, Nakajima D, Kikuno R, Ohara O (april 2001). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. XX. De kompletta sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kodar för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 8 (2): 85–95. doi : 10.1093/dnares/8.2.85 . PMID 11347906 .
Kaneko M, Ishiguro M, Niinuma Y, Uesugi M, Nomura Y (december 2002). "Human HRD1 skyddar mot ER-stressinducerad apoptos genom ER-associerad nedbrytning" . FEBS Bokstäver . 532 (1–2): 147–52. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03660-8 . PMID 12459480 . S2CID 44570384 .
Nadav E, Shmueli A, Barr H, Gonen H, Ciechanover A, Reiss Y (mars 2003). "Ett nytt endoplasmatiskt reticulum ubiquitinligas från däggdjur som är homologt med jästen Hrd1". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 303 (1): 91–7. doi : 10.1016/S0006-291X(03)00279-1 . PMID 12646171 .
Kikkert M, Doolman R, Dai M, Avner R, Hassink G, van Voorden S, Thanedar S, Roitelman J, Chau V, Wiertz E (januari 2004). "Human HRD1 är ett E3 ubiquitinligas involverat i nedbrytning av proteiner från det endoplasmatiska retikulumet" . Journal of Biological Chemistry . 279 (5): 3525–34. doi : 10.1074/jbc.M307453200 . PMID 14593114 .
Lilley BN, Ploegh HL (oktober 2005). "Multiproteinkomplex som länkar dislokation, ubiquitination och extraktion av felveckade proteiner från det endoplasmatiska retikulummembranet" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 102 (40): 14296–301. Bibcode : 2005PNAS..10214296L . doi : 10.1073/pnas.0505014102 . PMC 1242303 . PMID 16186509 .
Ye Y, Shibata Y, Kikkert M, van Voorden S, Wiertz E, Rapoport TA (oktober 2005). "Rekrytering av p97 ATPase och ubiquitinligaser till platsen för retrotranslokation vid det endoplasmatiska retikulummembranet" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 102 (40): 14132–8. Bibcode : 2005PNAS..10214132Y . doi : 10.1073/pnas.0505006102 . PMC 1242302 . PMID 16186510 .
Schulze A, Standera S, Buerger E, Kikkert M, van Voorden S, Wiertz E, Koning F, Kloetzel PM, Seeger M (december 2005). "Ubiquitin-domänproteinet HERP bildar ett komplex med komponenter av den endoplasmatiska retikulumassocierade nedbrytningsvägen". Journal of Molecular Biology . 354 (5): 1021–7. doi : 10.1016/j.jmb.2005.10.020 . PMID 16289116 .
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (maj 2006). "Ett protein-proteininteraktionsnätverk för mänskliga ärftliga ataxier och störningar av Purkinje-celldegeneration" . Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Yamasaki S, Yagishita N, Tsuchimochi K, Kato Y, Sasaki T, Amano T, Beppu M, Aoki H, Nakamura H, Nishioka K, Nakajima T (juli 2006). "Resistens mot endoplasmatisk retikulumstress är en förvärvad cellulär egenskap hos reumatoida synovialceller" . International Journal of Molecular Medicine . 18 (1): 113–7. doi : 10.3892/ijmm.18.1.113 . PMID 16786162 .
Toh ML, Marotte H, Blond JL, Jhumka U, Eljaafari A, Mougin B, Miossec P (juli 2006). "Överuttryck av synoviolin i perifert blod och synoviocyter från patienter med reumatoid artrit och fortsatt förhöjning av icke-svarare av infliximabbehandling" . Artrit och reumatism . 54 (7): 2109–18. doi : 10.1002/art.21926 . PMID 16802346 .
Arteaga MF, Wang L, Ravid T, Hochstrasser M, Canessa CM (juli 2006). "En amfipatisk helix riktar serum och glukokortikoid-inducerat kinas 1 till det endoplasmatiska retikulum-associerade ubiquitin-konjugationsmaskineriet" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 103 (30): 11178–83. Bibcode : 2006PNAS..10311178A . doi : 10.1073/pnas.0604816103 . PMC 1544061 . PMID 16847254 .
Omura T, Kaneko M, Okuma Y, Orba Y, Nagashima K, Takahashi R, Fujitani N, Matsumura S, Hata A, Kubota K, Murahashi K, Uehara T, Nomura Y (december 2006). "Ett ubiquitinligas HRD1 främjar nedbrytningen av Pael-receptorn, ett substrat för Parkin". Journal of Neurochemistry . 99 (6): 1456–69. doi : 10.1111/j.1471-4159.2006.04155.x . hdl : 2115/17141 . PMID 17059562 . S2CID 6256027 .
Yang H, Zhong X, Ballar P, Luo S, Shen Y, Rubinsztein DC, Monteiro MJ, Fang S (februari 2007). "Ubiquitinligas Hrd1 förbättrar nedbrytningen och undertrycker toxiciteten hos polyglutaminexpanderat huntingtin". Experimentell cellforskning . 313 (3): 538–50. doi : 10.1016/j.yexcr.2006.10.031 . PMID 17141218 .
Yamasaki S, Yagishita N, Sasaki T, Nakazawa M, Kato Y, Yamadera T, Bae E, Toriyama S, Ikeda R, Zhang L, Fujitani K, Yoo E, Tsuchimochi K, Ohta T, Araya N, Fujita H, Aratani S , Eguchi K, Komiya S, Maruyama I, Higashi N, Sato M, Senoo H, Ochi T, Yokoyama S, Amano T, Kim J, Gay S, Fukamizu A, Nishioka K, Tanaka K, Nakajima T (januari 2007). "Cytoplasmatisk förstörelse av p53 av det endoplasmatiska retikulum- residenta ubiquitinligaset "Synoviolin" " . EMBO Journal . 26 (1): 113–22. doi : 10.1038/sj.emboj.7601490 . PMC 1782373 . PMID 17170702 .

externa länkar

Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q86TM6 (E3 ubiquitin-protein ligas synoviolin) vid PDBe-KB .