SYNPO

SYNPO-
identifierare
	, synaptopodin
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Synaptopodin är ett protein som hos människor kodas av SYNPO -genen .

Fungera

Synaptopodin är ett aktinassocierat protein som kan spela en roll i aktinbaserad cellform och rörlighet. Namnet synaptopodin härrör från proteinets associationer med postsynaptiska densiteter och dendritiska ryggraden och med renala podocyter (Mundel et al., 1997).[tillhandahållen av OMIM]

Interaktioner

SYNPO har visat sig interagera med MAGI1 .

Vidare läsning

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (sep 1995). "Initial bedömning av mänskliga gendiversitet och uttrycksmönster baserat på 83 miljoner nukleotider av cDNA-sekvens" ( PDF) . Naturen . 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (november 2000). "DNA-kloning med användning av platsspecifik rekombination in vitro" . Genomforskning . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (mars 2001). "Mot en katalog av mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs" . Genomforskning . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Patrie KM, Drescher AJ, Welihinda A, Mundel P, Margolis B (aug 2002). "Interaktion mellan två aktinbindande proteiner, synaptopodin och alfa-aktinin-4, med tight junction-proteinet MAGI-1" . Journal of Biological Chemistry . 277 (33): 30183–90. doi : 10.1074/jbc.M203072200 . PMID 12042308 .
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (sep 2004). "Sekvensjämförelse av mänskliga och musgener avslöjar en homolog blockstruktur i promotorregionerna" . Genomforskning . 14 (9): 1711–8. doi : 10.1101/gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
He JC, Husain M, Sunamoto M, D'Agati VD, Klotman ME, Iyengar R, Klotman PE (sep 2004). "Nef stimulerar proliferation av glomerulära podocyter genom aktivering av Src-beroende Stat3- och MAPK1,2-vägar" . The Journal of Clinical Investigation . 114 (5): 643–51. doi : 10.1172/JCI21004 . PMC 514582 . PMID 15343382 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (okt 2004). "Från ORFeome till biologi: en funktionell genomikpipeline" . Genomforskning . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (Jan 2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Natur Bioteknik . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Kremerskothen J, Plaas C, Kindler S, Frotscher M, Barnekow A (feb 2005). "Synaptopodin, en molekyl som är involverad i bildandet av den dendritiska ryggradsapparaten, är ett dubbelt aktin/alfa-aktininbindande protein". Journal of Neurochemistry . 92 (3): 597–606. doi : 10.1111/j.1471-4159.2004.02888.x . PMID 15659229 . S2CID 1837841 .
Asanuma K, Kim K, Oh J, Giardino L, Chabanis S, Faul C, Reiser J, Mundel P (maj 2005). "Synaptopodin reglerar den aktinbindande aktiviteten av alfa-aktinin på ett isoformspecifikt sätt" . The Journal of Clinical Investigation . 115 (5): 1188–98. doi : 10.1172/JCI23371 . PMC 1070637 . PMID 15841212 .
Husain M, D'Agati VD, He JC, Klotman ME, Klotman PE (november 2005). "HIV-1 Nef inducerar dedifferentiering av podocyter in vivo: en karakteristisk egenskap hos HIVAN". AIDS . 19 (17): 1975–80. doi : 10.1097/01.aids.0000191918.42110.27 . PMID 16260903 . S2CID 40286329 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Jan 2006). "LIFEdb-databasen 2006" . Nukleinsyraforskning . 34 (Databasproblem): D415-8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Hirakawa M, Tsuruya K, Yotsueda H, Tokumoto M, Ikeda H, Katafuchi R, Fujimi S, Hirakata H, Iida M (juli 2006). "Uttryck av synaptopodin och GLEPP1 som markörer för steroidrespons vid primär fokal segmentell glomeruloskleros". Livsvetenskap . 79 (8): 757–63. doi : 10.1016/j.lfs.2006.02.031 . PMID 16564554 .
Asanuma K, Yanagida-Asanuma E, Faul C, Tomino Y, Kim K, Mundel P (maj 2006). "Synaptopodin orkestrerar aktinorganisation och cellmotilitet via reglering av RhoA-signalering". Naturens cellbiologi . 8 (5): 485–91. doi : 10.1038/ncb1400 . PMID 16622418 . S2CID 12861229 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (november 2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
Garovic VD, Wagner SJ, Petrovic LM, Gray CE, Hall P, Sugimoto H, Kalluri R, Grande JP (april 2007). "Glomerulärt uttryck av nefrin och synaptopodin, men inte podocin, är minskat i njursektioner från kvinnor med havandeskapsförgiftning. " Nefrologi, dialys, transplantation . 22 (4): 1136–43. doi : 10.1093/ndt/gfl711 . PMID 17255128 .