SUMO4

SUMO4-
identifierare
	, IDDM5, SMT3H4, SUMO-4, dJ281H8.4, liten ubiquitinliknande modifierare 4, liten ubiquitinliknande modifierare 4
Externa ID :n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa

Liten ubiquitin-relaterad modifierare 4 är ett protein som hos människor kodas av SUMO4 -genen .

Fungera

Denna gen är en medlem av SUMO-genfamiljen. Denna familj av gener kodar för små ubiquitin-relaterade modifierare som är fästa till proteiner och kontrollerar målproteinernas subcellulära lokalisering, stabilitet eller aktivitet. Proteinet som beskrivs i denna post är lokaliserat i cytoplasman och modifierar specifikt IKBA, vilket leder till negativ reglering av NF-kappa-B-beroende transkription av IL12B -genen. En specifik polymorfism i denna SUMO-gen, som leder till M55V-substitutionen, har associerats med typ I-diabetes. RefSeq innehåller denna polymorfism.

Interaktioner

SUMO4 har visats interagera med IκBα .

Vidare läsning

Wang CY, Podolsky R, She JX (okt 2006). "Genetiska och funktionella bevis som stöder SUMO4 som en typ 1-diabetes mottaglighetsgen". Annals of the New York Academy of Sciences . 1079 (1): 257–67. Bibcode : 2006NYASA1079..257W . doi : 10.1196/annals.1375.039 . PMID 17130563 . S2CID 20462827 .
Davies JL, Kawaguchi Y, Bennett ST, Copeman JB, Cordell HJ, Pritchard LE, Reed PW, Gough SC, Jenkins SC, Palmer SM (sep 1994). "En genomomfattande sökning efter känslighetsgener för mänsklig typ 1-diabetes". Naturen . 371 (6493): 130–6. Bibcode : 1994Natur.371..130D . doi : 10.1038/371130a0 . PMID 8072542 . S2CID 4275341 .
Luo DF, Buzzetti R, Rotter JI, Maclaren NK, Raffel LJ, Nisticò L, Giovannini C, Pozzilli P, Thomson G, She JX (maj 1996). "Bekräftelse av tre känslighetsgener för insulinberoende diabetes mellitus: IDDM4, IDDM5 och IDDM8" . Human molekylär genetik . 5 (5): 693–8. doi : 10.1093/hmg/5.5.693 . PMID 8733139 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, Edwards CA, Ashurst JL, Wilming L, Jones MC, Horton R, Hunt SE, Scott CE, Gilbert JG, Clamp ME, Bethel G, Milne S, Ainscough R, Almeida JP, Ambrose KD , Andrews TD, Ashwell RI, Babbage AK, Bagguley CL, Bailey J, Banerjee R, Barker DJ, Barlow KF, Bates K, Beare DM, Beasley H, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bray-Allen S, Brook J , Brown AJ, Brown JY, Burford DC, Burrill W, Burton J, Carder C, Carter NP, Chapman JC, Clark SY, Clark G, Clee CM, Clegg S, Cobley V, Collier RE, Collins JE, Colman LK, Corby NR, Coville GJ, Culley KM, Dhami P, Davies J, Dunn M, Earthrowl ME, Ellington AE, Evans KA, Faulkner L, Francis MD, Frankish A, Frankland J, French L, Garner P, Garnett J, Ghori MJ, Gilby LM, Gillson CJ, Glithero RJ, Grafham DV, Grant M, Gribble S, Griffiths C, Griffiths M, Hall R, Halls KS, Hammond S, Harley JL, Hart EA, Heath PD, Heathcott R, Holmes SJ, Howden PJ , Howe KL, Howell GR, Huckle E, Humphray SJ, Humphries MD, Hunt AR, Johnson CM, Joy AA, Kay M, Keenan SJ, Kimberley AM, King A, Laird GK, Langford C, Lawlor S, Leongamornlert DA, Leversha M, Lloyd CR, Lloyd DM, Loveland JE, Lovell J, Martin S, Mashreghi-Mohammadi M, Maslen GL, Matthews L, McCann OT, McLaren SJ, McLay K, McMurray A, Moore MJ, Mullikin JC, Niblett D, Nickerson T, Novik KL, Oliver K, Overton-Larty EK, Parker A, Patel R, Pearce AV, Peck AI, Phillimore B, Phillips S, Plumb RW, Porter KM, Ramsey Y, Ranby SA, Rice CM, Ross MT, Searle SM, Sehra HK, Sheridan E, Skuce CD, Smith S, Smith M, Spraggon L, Squares SL, Steward CA, Sycamore N, Tamlyn-Hall G, Tester J, Theaker AJ, Thomas DW, Thorpe A, Tracey A, Tromans A, Tubby B, Wall M, Wallis JM, West AP, White SS, Whitehead SL, Whittaker H, Wild A, Willey DJ, Wilmer TE, Wood JM, Wray PW, Wyatt JC, Young L, Younger RM, Bentley DR, Coulson A, Durbin R, Hubbard T, Sulston JE, Dunham I, Rogers J, Beck S (okt 2003). "DNA-sekvensen och analysen av human kromosom 6" . Naturen . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003Natur.425..805M . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .
Guo D, Li M, Zhang Y, Yang P, Eckenrode S, Hopkins D, Zheng W, Purohit S, Podolsky RH, Muir A, Wang J, Dong Z, Brusko T, Atkinson M, Pozzilli P, Zeidler A, Raffel LJ , Jacob CO, Park Y, Serrano-Rios M, Larrad MT, Zhang Z, Garchon HJ, Bach JF, Rotter JI, She JX, Wang CY (aug 2004). "En funktionell variant av SUMO4, en ny I kappa B alfa-modifierare, är associerad med typ 1-diabetes". Naturgenetik . 36 (8): 837–41. doi : 10.1038/ng1391 . PMID 15247916 . S2CID 41123857 .
Smyth DJ, Howson JM, Lowe CE, Walker NM, Lam AC, Nutland S, Hutchings J, Tuomilehto-Wolf E, Tuomilehto J, Guja C, Ionescu-Tîrgoviste C, Undlien DE, Rønningen KS, Savage D, Dunger DB, Twells RC, McArdle WL, Strachan DP, Todd JA (feb 2005). "Bedöma giltigheten av sambandet mellan SUMO4 M55V-varianten och risken för typ 1-diabetes". Naturgenetik . 37 (2): 110–1, författarsvar 112–3. doi : 10.1038/ng0205-110 . PMID 15678134 . S2CID 33336557 .
Qu H, Bharaj B, Liu XQ, Curtis JA, Newhook LA, Paterson AD, Hudson TJ, Polychronakos C (feb 2005). "Bedöma giltigheten av sambandet mellan SUMO4 M55V-varianten och risken för typ 1-diabetes. " Naturgenetik . 37 (2): 111–2, författarsvar 112–3. doi : 10.1038/ng0205-111 . PMID 15678135 .
Park Y, Park S, Kang J, Yang S, Kim D (feb 2005). "Bedöma giltigheten av sambandet mellan SUMO4 M55V-varianten och risken för typ 1-diabetes. " Naturgenetik . 37 (2): 112, författarens svar 112–3. doi : 10.1038/ng0205-112a . PMID 15678137 . S2CID 30406915 .
Owerbach D, McKay EM, Yeh ET, Gabbay KH, Bohren KM (november 2005). "En prolin-90-rester som är unik för SUMO-4 förhindrar mognad och sumoylering". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 337 (2): 517–20. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.09.090 . PMID 16198310 .
Guo D, Han J, Adam BL, Colburn NH, Wang MH, Dong Z, Eizirik DL, She JX, Wang CY (dec 2005). "Proteomisk analys av SUMO4-substrat i HEK293-celler under serumsvält-inducerad stress". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 337 (4): 1308–18. doi : 10.1016/j.bbrc.2005.09.191 . PMID 16236267 .
Noso S, Ikegami H, Fujisawa T, Kawabata Y, Asano K, Hiromine Y, Tsurumaru M, Sugihara S, Lee I, Kawasaki E, Awata T, Ogihara T (dec 2005). "Genetisk heterogenitet i samband med SUMO4 M55V-varianten med känslighet för typ 1-diabetes" . Diabetes . 54 (12): 3582–6. doi : 10.2337/diabetes.54.12.3582 . PMID 16306380 .
Tsurumaru M, Kawasaki E, Ida H, Migita K, Moriuchi A, Fukushima K, Fukushima T, Abiru N, Yamasaki H, Noso S, Ikegami H, Awata T, Sasaki H, Eguchi K (aug 2006). "Bevis för rollen av liten ubiquitin-liknande modifierare 4 som ett allmänt autoimmunitetslokus i den japanska befolkningen" . Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 91 (8): 3138–43. doi : 10.1210/jc.2006-0206 . PMID 16735488 .
Costas J, Perez-Pampin E, Ferreiros-Vidal I, Torres M, Phillips C, Vicario JL, Pablos JL, Carracedo A, Gomez-Reino JJ, Gonzalez A (juni 2006). "SUMO4 och MAP3K7IP2 enkelnukleotidpolymorfismer och känslighet för reumatoid artrit". The Journal of Reumatology . 33 (6): 1048–51. PMID 16755651 .
Sedimbi SK, Shastry A, Park Y, Rumba I, Sanjeevi CB (okt 2006). "Association av SUMO4 M55V polymorfism med autoimmun diabetes hos lettiska patienter". Annals of the New York Academy of Sciences . 1079 (1): 273–7. Bibcode : 2006NYASA1079..273S . doi : 10.1196/annals.1375.041 . PMID 17130565 . S2CID 22345614 .
Lin HY, Wang CL, Hsiao PJ, Lu YC, Chen SY, Lin KD, Hsin SC, Hsieh MC, Shin SJ (april 2007). "SUMO4 M55V-variant är associerad med diabetisk nefropati vid typ 2-diabetes" . Diabetes . 56 (4): 1177–80. doi : 10.2337/db06-1283 . PMID 17229939 .
Sedimbi SK, Kanungo A, Shastry A, Park Y, Sanjeevi CB (april 2007). "Inget samband mellan SUMO4 M55V och autoimmun diabetes hos asiatisk-indiska patienter". International Journal of Immunogenetics . 34 (2): 137–42. doi : 10.1111/j.1744-313X.2007.00668.x . PMID 17373940 . S2CID 10433791 .
Noso S, Fujisawa T, Kawabata Y, Asano K, Hiromine Y, Fukai A, Ogihara T, Ikegami H (juni 2007). "Association av liten ubiquitin-like modifier 4 (SUMO4) variant, belägen i IDDM5 locus, med typ 2 diabetes i den japanska befolkningen" . Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism . 92 (6): 2358–62. doi : 10.1210/jc.2007-0031 . PMID 17374705 .
Bohren KM, Gabbay KH, Owerbach D (aug 2007). "Affinitetskromatografi av naturliga SUMO-proteiner med His-märkt rekombinant UBC9 bundet till Co2+-laddat talonharts". Proteinuttryck och rening . 54 (2): 289–94. doi : 10.1016/j.pep.2007.03.013 . PMID 17459725 .