SUB1

SUB1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, P15, PC4, p14, SUB1-homolog, transkriptionsregulator, SUB1-regulator för transkription
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Aktiverad RNA-polymeras II transkriptionskoaktivator p15, även känd som positiv kofaktor 4 ( PC4 ) eller SUB1-homolog är ett protein som hos människor kodas av SUB1 -genen . Den humana SUB1 -genen är uppkallad efter en ortolog gen i jäst.

SUB1 induceras av oxidativ stress och är involverad i att koordinera cellulära svar på DNA-strängbrott som uppstår efter oxidativ stress.    Yu L, Ma H, Ji X, Volkert MR (januari 2016). "Sub1-kärnproteinet skyddar DNA från oxidativ skada" . Molekylär och cellulär biokemi . 412 (1–2): 165–171. doi : 10.1007/s11010-015-2621-x . PMC 5064834 . PMID 26708217 . Jäst SUB1 har strukturella och funktionella likheter med humant alfa-synuklein , ett protein som har en viktig roll i Parkinsons sjukdom .    Schaser AJ, Osterberg VR, Dent SE, Stackhouse TL, Wakeham CM, Boutros SW, et al. (juli 2019). "Alfa-synuklein är ett DNA-bindande protein som modulerar DNA-reparation med konsekvenser för Lewy-kroppssjukdomar. " Vetenskapliga rapporter . 9 (1): 10919. doi : 10.1038/s41598-019-47227-z . PMC 6662836 . PMID 31358782 . Liksom SUB1 fungerar alfa-synuklein för att reglera DNA-reparation inklusive reparation av DNA-dubbelsträngsbrott.

Interaktioner

SUB1 har visat sig interagera med CSTF2 .

Vidare läsning

•    Kaiser K, Stelzer G, Meisterernst M (juli 1995). "Koaktivatorn p15 (PC4) initierar transkriptionell aktivering under TFIIA-TFIID-promotorkomplexbildning" . EMBO Journal . 14 (14): 3520–3527. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07358.x . PMC 394420 . PMID 7628453 .
•    Ge H, Zhao Y, Chait BT, Roeder RG (december 1994). "Fosforylering reglerar negativt funktionen av coactivator PC4" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 91 (26): 12691–12695. doi : 10.1073/pnas.91.26.12691 . PMC 45505 . PMID 7809103 .
•    Brandsen J, Werten S, van der Vliet PC, Meisterernst M, Kroon J, Gros P (november 1997). "C-terminal domän av transkriptionskofaktor PC4 avslöjar dimert ssDNA-bindningsställe". Naturens strukturbiologi . 4 (11): 900–903. doi : 10.1038/nsb1197-900 . PMID 9360603 . S2CID 30710386 .
•    Malik S, Guermah M, Roeder RG (mars 1998). "En dynamisk modell för PC4-koaktivatorfunktion i RNA-polymeras II-transkription" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (5): 2192–2197. doi : 10.1073/pnas.95.5.2192 . PMC 19292 . PMID 9482861 .
•    Luo Y, Ge H, Stevens S, Xiao H, Roeder RG (juli 1998). "Koaktivering av OCA-B: definition av kritiska regioner och synergism med allmänna kofaktorer" . Molekylär och cellulär biologi . 18 (7): 3803–3810. doi : 10.1128/mcb.18.7.3803 . PMC 108964 . PMID 9632764 .
•   Currie RA (juli 1998). "Biokemisk karakterisering av NF-Y-transkriptionsfaktorkomplexet under B-lymfocytutveckling" . Journal of Biological Chemistry . 273 (29): 18220–18229. doi : 10.1074/jbc.273.29.18220 . PMID 9660784 .
•   Wang Z, Roeder RG (april 1998). "DNA-topoisomeras I och PC4 kan interagera med humant TFIIIC för att främja både korrekt terminering och transkriptionsåterinitiering av RNA-polymeras III" . Molekylär cell . 1 (5): 749–757. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80074-X . PMID 9660958 .
•   Holloway AF, Occhiodoro F, Mittler G, Meisterernst M, Shannon MF (juli 2000). "Funktionell interaktion mellan HIV-transaktivatorn Tat och den transkriptionella samaktivatorn PC4 i T-celler" . Journal of Biological Chemistry . 275 (28): 21668–21677. doi : 10.1074/jbc.M909058199 . PMID 10887206 .
•    Yuan CX, Gurley WB (juli 2000). "Potentiella mål för HSF1 inom förinitieringskomplexet" . Cell Stress & Chaperones . 5 (3): 229–242. PMC 312889 . PMID 11005381 .
•   Kumar BR, Swaminathan V, Banerjee S, Kundu TK (maj 2001). "p300-medierad acetylering av human transkriptionskoaktivator PC4 hämmas av fosforylering" . Journal of Biological Chemistry . 276 (20): 16804–16809. doi : 10.1074/jbc.M100934200 . PMID 11279157 .
•   Yu P, Huang B, Shen M, Lau C, Chan E, Michel J, et al. (januari 2001). "p15(PAF), en ny PCNA-associerad faktor med ökat uttryck i tumörvävnader" . Onkogen . 20 (4): 484–489. doi : 10.1038/sj.onc.1204113 . PMID 11313979 .
•   Calvo O, Manley JL (maj 2001). "Evolutionärt konserverad interaktion mellan CstF-64 och PC4 länkar transkription, polyadenylering och terminering" . Molekylär cell . 7 (5): 1013–1023. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00236-2 . PMID 11389848 .
•   Guo H, Cai CQ, Kuo PC (februari 2002). "Hepatocyt nukleär faktor-4alfa förmedlar redoxkänslighet för inducerbar kväveoxidsyntasgentranskription" . Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 5054–5060. doi : 10.1074/jbc.M109017200 . PMID 11741883 .
•   Dubois T, Zemlickova E, Howell S, Aitken A (februari 2003). "Centaurin-alpha 1 associerar in vitro och in vivo med nukleolin". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 301 (2): 502–508. doi : 10.1016/S0006-291X(02)03010-3 . PMID 12565890 .
•   Fukuda A, Tokonabe S, Hamada M, Matsumoto M, Tsukui T, Nogi Y, Hisatake K (april 2003). "Lättnad av PC4-medierad transkriptionsrepression genom ERCC3-helikasaktiviteten av allmän transkriptionsfaktor TFIIH" . Journal of Biological Chemistry . 278 (17): 14827–14831. doi : 10.1074/jbc.M213172200 . PMID 12590132 .
•   Swietlicki E, Iordanov H, Fritsch C, Yi L, Levin MS, Rubin DC (2003). "Tillväxtfaktorreglering av PC4/TIS7, en omedelbar tidig gen som uttrycks under tarmanpassning efter resektion". Journal of Parenteral and Enteral Nutrition . 27 (2): 123–131. doi : 10.1177/0148607103027002123 . PMID 12665168 .
•    Banerjee S, Kumar BR, Kundu TK (mars 2004). "Allmän transkriptionskoaktivator PC4 aktiverar p53-funktionen" . Molekylär och cellulär biologi . 24 (5): 2052–2062. doi : 10.1128/MCB.24.5.2052-2062.2004 . PMC 350566 . PMID 14966284 .
•    Caldwell RB, Braselmann H, Schoetz U, Heuer S, Scherthan H, Zitzelsberger H (juli 2016). "Positiv kofaktor 4 (PC4) är avgörande för omdirigering av DNA-reparationsvägar i DT40-celler" . Vetenskapliga rapporter . 6 : 28890. doi : 10.1038/srep28890 . PMC 4931448 . PMID 27374870 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P53999 (aktiverad RNA-polymeras II transkriptionell coactivator p15) vid PDBe-KB .