SS18

SS18-
identifierare
	, SSXT, SYT, nBAF-kromatinombyggnadskomplex-underenhet, SS18-underenhet av BAF-kromatinombyggnadskomplex, SMARCL1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Protein SSXT är ett protein som hos människor kodas av SS18 -genen .

Fungera

SS18 är en medlem av det humana SWI/SNF- kromatinombyggnadskomplexet.

Klinisk signifikans

SS18 är involverad i en kromosomal translokation som vanligtvis förekommer i synovialt sarkom .

Interaktioner

SS18 har visat sig interagera med:

• EP300 ,
• MLLT10 ,
• SMARCA2 , och
• SMARCB1 .

Vidare läsning

•    Fligman I, Lonardo F, Jhanwar SC, Gerald WL, Woodruff J, Ladanyi M (dec 1995). "Molekylär diagnos av synovialt sarkom och karakterisering av en variant SYT-SSX2 fusionstranskript" . American Journal of Pathology . 147 (6): 1592–9. PMC 1869933 . PMID 7495284 .
•   Brett D, Whitehouse S, Antonson P, Shipley J, Cooper C, Goodwin G (sep 1997). "SYT-proteinet som är involverat i translokationen av t(X;18) synovial sarkom är en transkriptionell aktivator lokaliserad i nukleära kroppar" . Human molekylär genetik . 6 (9): 1559–64. doi : 10.1093/hmg/6.9.1559 . PMID 9285794 .
•   Thaete C, Brett D, Monaghan P, Whitehouse S, Rennie G, Rayner E, Cooper CS, Goodwin G (april 1999). "Funktionella domäner av SYT och SYT-SSX synovial sarkom translokationsproteiner och samlokalisering med SNF-proteinet BRM i kärnan" . Human molekylär genetik . 8 (4): 585–91. doi : 10.1093/hmg/8.4.585 . PMID 10072425 .
•    Eid JE, Kung AL, Scully R, Livingston DM (sep 2000). "p300 interagerar med det nukleära proto-onkoproteinet SYT som en del av den aktiva kontrollen av celladhesion" . Cell . 102 (6): 839–48. doi : 10.1016/S0092-8674(00)00072-6 . PMID 11030627 . S2CID 17342132 .
•    Tamborini E, Agus V, Mezzelani A, Riva C, Sozzi G, Azzarelli A, Pierotti MA, Pilotti S (april 2001). "Identifiering av en ny splitsad variant av SYT-genen uttryckt i normala vävnader och i synovialt sarkom" . British Journal of Cancer . 84 (8): 1087–94. doi : 10.1054/bjoc.2000.1710 . PMC 2363857 . PMID 11308259 .
•   Brodin B, Haslam K, Yang K, Bartolazzi A, Xie Y, Starborg M, Lundeberg J, Larsson O (maj 2001). "Klonning och karakterisering av splitsade fusionstranskriptvarianter av synovialt sarkom: SYT/SSX4, SYT/SSX4v och SYT/SSX2v. Möjlig reglerande roll för fusionsgenprodukten i vildtyps-SYT-uttryck". Gene . 268 (1–2): 173–82. doi : 10.1016/S0378-1119(01)00412-7 . PMID 11368913 .
•   de Bruijn DR, dos Santos NR, Thijssen J, Balemans M, Debernardi S, Linder B, Young BD, Geurts van Kessel A (maj 2001). "Det synoviala sarkomassocierade proteinet SYT interagerar med det akut leukemiassocierade proteinet AF10" . Onkogen . 20 (25): 3281–9. doi : 10.1038/sj.onc.1204419 . PMID 11423977 .
•    Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, Kondo S, Bono H, Okazaki Y, Hayashizaki Y (okt 2001). "Protein-proteininteraktionspanel som använder mus fullängds-cDNA" (PDF) . Genomforskning . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101/gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
•   Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (feb 2002). "SYT associerar med humana SNF/SWI-komplex och den C-terminala regionen av dess fusionspartner SSX1 riktar sig mot histoner" . Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 5498–505. doi : 10.1074/jbc.M108702200 . PMID 11734557 .
•   Yang K, Lui WO, Xie Y, Zhang A, Skytting B, Mandahl N, Larsson C, Larsson O (juni 2002). "Samexistens av SYT-SSX1- och SYT-SSX2-fusioner i synovialsarkom" . Onkogen . 21 (26): 4181–90. doi : 10.1038/sj.onc.1205569 . PMID 12037676 .
•   Imabayashi H, Mori T, Gojo S, Kiyono T, Sugiyama T, Irie R, Isogai T, Hata J, Toyama Y, Umezawa A (aug 2003). "Omdifferentiering av dedifferentierade kondrocyter och kondrogenes av mänskliga benmärgsstromaceller via kondrosfärbildning med uttrycksprofilering genom storskalig cDNA-analys". Experimentell cellforskning . 288 (1): 35–50. doi : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . PMID 12878157 .
•   Perani M, Ingram CJ, Cooper CS, Garrett MD, Goodwin GH (november 2003). "Konserverad SNH-domän av proto-onkoproteinet SYT interagerar med komponenter i de humana kromatinombyggnadskomplexen, medan QPGY-repeteringsdomänen bildar homo-oligomerer" . Onkogen . 22 (50): 8156–67. doi : 10.1038/sj.onc.1207031 . PMID 14603256 .
•   Iwasaki T, Koibuchi N, Chin WW (sep 2005). "Synovial sarkomtranslokation (SYT) kodar för en nukleär receptor-koaktivator" . Endokrinologi . 146 (9): 3892–9. doi : 10.1210/sv.2004-1513 . PMID 15919756 .
•    Fernebro J, Francis P, Edén P, Borg A, Panagopoulos I, Mertens F, Vallon-Christersson J, Akerman M, Rydholm A, Bauer HC, Mandahl N, Nilbert M (Mar 2006). "Genuttrycksprofiler relaterar till SS18/SSX-fusionstyp i synovialt sarkom" . International Journal of Cancer . 118 (5): 1165–72. doi : 10.1002/ijc.21475 . PMID 16152617 . S2CID 12084422 .
•   Perani M, Antonson P, Hamoudi R, Ingram CJ, Cooper CS, Garrett MD, Goodwin GH (dec 2005). "Proto-onkoproteinet SYT interagerar med SYT-interagerande protein/co-activator activator (SIP/CoAA), en human nukleär receptor co-activator med likhet med EWS och TLS/FUS familj av proteiner. " Journal of Biological Chemistry . 280 (52): 42863–76. doi : 10.1074/jbc.M502963200 . PMID 16227627 .
•   Sun Y, Gao D, Liu Y, Huang J, Lessnick S, Tanaka S (feb 2006). "IGF2 är avgörande för tumörbildning av synovialt sarkom onkoprotein SYT-SSX1" . Onkogen . 25 (7): 1042–52. doi : 10.1038/sj.onc.1209143 . PMID 16247461 .