SRRM1

SRRM1
Tillgängliga strukturer PDB Human UniProt-sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, 160-KD, POP101, SRM160, serin och arginin repetitiv matris 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa

Serin/arginin repetitiv matrisprotein 1 är ett protein som hos människor kodas av SRRM1 -genen .

Interaktioner

SRRM1 har visats interagera med CDC5L .

Vidare läsning

•    Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998). "SRPK2: ett differentiellt uttryckt SR-proteinspecifikt kinas involverat i att förmedla interaktionen och lokaliseringen av pre-mRNA-splitsningsfaktorer i däggdjursceller" . J. Cell Biol . 140 (4): 737–50. doi : 10.1083/jcb.140.4.737 . PMC 2141757 . PMID 9472028 .
•   Wilson KF, Fortes P, Singh US, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (1999). "Det nukleära cap-bindande komplexet är ett nytt mål för tillväxtfaktorreceptorkopplad signaltransduktion" . J. Biol. Chem . 274 (7): 4166–73. doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 . PMID 9933612 .
•    Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). "SRm160/300 skarvningskoaktivator krävs för exonförstärkarfunktion" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (11): 6125–30. Bibcode : 1999PNAS...96.6125E . doi : 10.1073/pnas.96.11.6125 . PMC 26846 . PMID 10339552 .
•    Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (2000). "SRm160/300 skarvningskoaktivatorsubenheter" . RNA . 6 (1): 111–20. doi : 10.1017/S1355838200991982 . PMC 1369899 . PMID 10668804 .
•    Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (2000). "Pre-mRNA-skarvning förändrar mRNP-sammansättning: bevis för stabil association av proteiner vid exon-exon-korsningar" . Genes Dev . 14 (9): 1098–108. doi : 10.1101/gad.14.9.1098 . PMC 316578 . PMID 10809668 .
•    McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). "Det akuta myeloid leukemi-associerade proteinet, DEK, bildar en splitsningsberoende interaktion med exon-produktkomplex" . J. Cell Biol . 150 (2): 309–20. doi : 10.1083/jcb.150.2.309 . PMC 2180225 . PMID 10908574 .
•    Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). "Spliceosomen deponerar flera proteiner 20-24 nukleotider uppströms om mRNA exon-exon-övergångar" . EMBO J . 19 (24): 6860–9. doi : 10.1093/emboj/19.24.6860 . PMC 305905 . PMID 11118221 .
•    Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Kommunikation av positionen för exon-exon-övergångar till mRNA-övervakningsmaskineriet av proteinet RNPS1". Vetenskap . 293 (5536): 1836–9. Bibcode : 2001Sci...293.1836L . doi : 10.1126/science.1062786 . PMID 11546874 . S2CID 389385 .
•    McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). "SRm160 splitsningskoaktivator främjar transkript 3'-ändsklyvning" . Mol. Cell. Biol . 22 (1): 148–60. doi : 10.1128/MCB.22.1.148-160.2002 . PMC 134228 . PMID 11739730 .
•    Szymczyna BR, Pineda-Lucena A, Mills JL, Szyperski T, Arrowsmith CH (2002). "1H, 13C och 15N resonanstilldelningar och sekundär struktur för PWI-domänen från SRm160 med NMR med reducerad dimensionalitet". J. Biomol. NMR . 22 (3): 299–300. doi : 10.1023/A:1014904502424 . PMID 11991360 . S2CID 13594831 .
•    Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002). "Rening och karakterisering av inhemska spliceosomer lämpliga för tredimensionell strukturanalys" . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
•    Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). "Exonövergångskomplexet detekteras på CBP80-bundet men inte eIF4E-bundet mRNA i däggdjursceller: dynamik i mRNP-ombyggnad" . EMBO J . 21 (13): 3536–45. doi : 10.1093/emboj/cdf345 . PMC 126094 . PMID 12093754 .
•   Meissner M, Lopato S, Gotzmann J, Sauermann G, Barta A (2003). "Proto-onkoprotein TLS/FUS är associerat med kärnmatrisen och komplexbundet med splitsningsfaktorer PTB, SRm160 och SR-proteiner". Exp. Cell Res . 283 (2): 184–95. doi : 10.1016/S0014-4827(02)00046-0 . PMID 12581738 .
•    Szymczyna BR, Bowman J, McCracken S, Pineda-Lucena A, Lu Y, Cox B, Lambermon M, Graveley BR, Arrowsmith CH, Blencowe BJ (2003). "Struktur och funktion av PWI-motivet: en ny nukleinsyrabindande domän som underlättar pre-mRNA-bearbetning" . Genes Dev . 17 (4): 461–75. doi : 10.1101/gad.1060403 . PMC 196000 . PMID 12600940 .
•    Wagner S, Chiosea S, Nickerson JA (2003). "De rumsliga inriktnings- och kärnmatrisbindande domänerna av SRm160" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (6): 3269–74. Bibcode : 2003PNAS..100.3269W . doi : 10.1073/pnas.0438055100 . PMC 152281 . PMID 12624182 .
•   McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (2003). "En evolutionärt bevarad roll för SRm160 i 3'-ändbearbetning som fungerar oberoende av exonövergångskomplexbildning" . J. Biol. Chem . 278 (45): 44153–60. doi : 10.1074/jbc.M306856200 . PMID 12944400 .
•    Wagner S, Chiosea S, Ivshina M, Nickerson JA (2004). "In vitro FRAP avslöjar den ATP-beroende kärnmobiliseringen av exon junction-komplexproteinet SRm160" . J. Cell Biol . 164 (6): 843–50. doi : 10.1083/jcb.200307002 . PMC 2172284 . PMID 15024032 .
•   Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). "Robust fosfoproteomisk profilering av tyrosinfosforyleringsställen från mänskliga T-celler med hjälp av immobiliserad metallaffinitetskromatografi och tandemmasspektrometri". Anal. Chem . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .

externa länkar

• SRRM1 human genplacering i UCSC Genome Browser .
• SRRM1 mänskliga gendetaljer i UCSC Genome Browser .