SF3A2

SF3A2-
identifierare
	, PRP11, PRPF11, SAP62, SF3a66, splitsningsfaktor 3a underenhet 2
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa

Splicing factor 3A subenhet 2 är ett protein som hos människor kodas av SF3A2 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för subenhet 2 av splitsningsfaktor 3a-proteinkomplexet. Heterotrimeren för splitsningsfaktor 3a inkluderar subenheterna 1, 2 och 3 och är nödvändig för in vitro-omvandlingen av 15S U2 snRNP till en aktiv 17S-partikel som utför pre-mRNA-splitsning. Subenhet 2 interagerar med subenhet 1 genom dess aminoterminal medan den enda zinkfingerdomänen av subenhet 2 spelar en roll i dess bindning till 15S U2 snRNP. Subenhet 2 kan också fungera oberoende av dess RNA-splitsningsfunktion som ett mikrotubulibindande protein.

Interaktioner

SF3A2 har visats interagera med DDX46 .

Vidare läsning

Chiara MD, Champion-Arnaud P, Buvoli M, Nadal-Ginard B, Reed R (juli 1994). "Specifika protein-proteininteraktioner mellan de essentiella däggdjursspliceosomassocierade proteinerna SAP 61 och SAP 114" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 91 (14): 6403–7. Bibcode : 1994PNAS...91.6403C . doi : 10.1073/pnas.91.14.6403 . PMC 44210 . PMID 8022796 .
Rain JC, Tartakoff AM, Krämer A, Legrain P (juni 1996). "Väsentliga domäner av PRP21-splitsningsfaktorn är inblandade i bindningen till PRP9- och PRP11-proteiner och konserveras genom evolution" . RNA . 2 (6): 535–50. PMC 1369393 . PMID 8718683 .
Hong W, Bennett M, Xiao Y, Feld Kramer R, Wang C, Reed R (januari 1997). "Association av U2 snRNP med det spliceosomala komplexet E" . Nukleinsyraforskning . 25 (2): 354–61. doi : 10.1093/nar/25.2.354 . PMC 146436 . PMID 9016565 .
Moraitou M, Patrinou-Georgoula M, Guialis A (maj 1998). "Strukturella/funktionella egenskaper hos en däggdjursmultikomponentstruktur som innehåller alla större spliceosomala små nukleära ribonukleoproteinpartiklar" . The Biochemical Journal . 332 (1): 135–44. doi : 10.1042/bj3320135 . PMC 1219461 . PMID 9576861 .
Yan D, Perriman R, Igel H, Howe KJ, Neville M, Ares M (september 1998). "CUS2, en jästhomolog av human Tat-SF1, räddar funktionen av felvikt U2 genom ett ovanligt RNA-igenkänningsmotiv" . Molekylär och cellulär biologi . 18 (9): 5000–9. doi : 10.1128/mcb.18.9.5000 . PMC 109085 . PMID 9710584 .
Neubauer G, King A, Rappsilber J , Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (september 1998). "Masspektrometri och EST-databassökning möjliggör karakterisering av multi-protein spliceosomkomplexet". Naturgenetik . 20 (1): 46–50. doi : 10.1038/1700 . PMID 9731529 . S2CID 585778 .
Krämer A, Grüter P, Gröning K, Kastner B (juni 1999). "Kombinerade biokemiska och elektronmikroskopiska analyser avslöjar arkitekturen hos däggdjurets U2 snRNP" . Journal of Cell Biology . 145 (7): 1355–68. doi : 10.1083/jcb.145.7.1355 . PMC 2133165 . PMID 10385517 .
Das R, Zhou Z, Reed R (maj 2000). "Funktionell association av U2 snRNP med det ATP-oberoende spliceosomala komplexet E" . Molekylär cell . 5 (5): 779–87. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80318-4 . PMID 10882114 .
Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (augusti 2001). "Ett nytt U2- och U11/U12-snRNP-protein som associerar med pre-mRNA-grenstället" . EMBO Journal . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
Nesic D, Krämer A (oktober 2001). "Domäner i mänskliga splitsningsfaktorer SF3a60 och SF3a66 krävs för bindning till SF3a120, sammansättning av 17S U2 snRNP och prespliceosombildning" . Molekylär och cellulär biologi . 21 (19): 6406–17. doi : 10.1128/MCB.21.19.6406-6417.2001 . PMC 99788 . PMID 11533230 .
Dresser DW, Jamin SP, Atkins CJ, Guerrier D (oktober 2001). "En uttryckt GNRP-liknande gen delar en dubbelriktad promotor med SF3A2 (SAP62) omedelbart uppströms om AMH". Gene . 277 (1–2): 163–73. doi : 10.1016/S0378-1119(01)00690-4 . PMID 11602354 .
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (april 2002). "Rening och karakterisering av inhemska spliceosomer lämpliga för tredimensionell strukturanalys" . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (september 2002). "Karakterisering av nya SF3b- och 17S U2 snRNP-proteiner, inklusive en human Prp5p-homolog och ett SF3b DEAD-box-protein" . EMBO Journal . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
Takenaka K, Nakagawa H, Miyamoto S, Miki H (augusti 2004). "Pre-mRNA-skarvningsfaktorn SF3a66 fungerar som ett mikrotubulibindande och buntande protein" . The Biochemical Journal . 382 (Pt 1): 223–30. doi : 10.1042/BJ20040521 . PMC 1133934 . PMID 15142036 .
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (juli 2004). "Funktionell proteomikkartläggning av en mänsklig signalväg" . Genomforskning . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Nesic D, Tanackovic G, Krämer A (september 2004). "En roll för Cajal-kroppar i de sista stegen av U2 snRNP-biogenes" . Journal of Cell Science . 117 (Pt 19): 4423–33. doi : 10.1242/jcs.01308 . PMID 15316075 .