Riktad projektionssträvan

I detta exempel används riktad projektionssträvan för att utforska projektioner av en genuttrycksdatauppsättning . Var och en av de 122 punkterna motsvarar ett prov taget från en cancertumör av fyra diagnostiska klasser (representerade av färg). För varje prov registrerades uttrycksnivån för 100 gener (representerad av axlarna). Animationen visar att TPP kan separera två av klasserna tydligt (röd och lila), men två andra kunde inte särskiljas (blå och grön). Positionen för axlarna anger då aktiveringen av vilka gener som är mest associerade med varje klass.

Riktad projektionssträvan är en typ av statistisk teknik som används för utforskande dataanalys , informationsvisualisering och urval av funktioner . Det tillåter användaren att interaktivt utforska mycket komplexa data (som vanligtvis har tiotals till hundratals attribut) för att hitta funktioner eller mönster av potentiellt intresse.

Konventionell, eller "blind", projektionssträvan , hittar de mest "intressanta" möjliga projektionerna i flerdimensionell data, med hjälp av en sökalgoritm som optimerar vissa fasta kriterium för "intressant" - såsom avvikelse från en normalfördelning . Däremot tillåter riktad projektionssträvan användaren att utforska utrymmet för projektioner genom att manipulera datapunkter direkt i en interaktiv scatterplot .

Riktad projektionssträvan har hittat tillämpningar inom DNA-mikroarraydataanalys , proteinsekvensanalys , graflayout och digital signalbehandling . Det är tillgängligt som ett paket för WEKAs verktygslåda för maskininlärning .

Vidare läsning

• Joe Faith (2007) "Targeted Projection Pursuit for Interactive Exploration of High-Dimensional Data Sets", Proceedings of 11th International Conference on Information Visualization

externa länkar

• imDEV gratis Excel-tillägg för riktade projektionsaktiviteter med funktionsval kombinerat med PLS och PLS-DA
• Projektsida med målinriktad projektion